Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00520
- Subject:
- XM_006514968.3
- Aligned Length:
- 1458
- Identities:
- 1198
- Gaps:
- 174
Alignment
Query 1 ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC 148
||.| ||||||||.
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGC-----------TTCAAGATT 13
Query 149 TAAGT---------------------------CAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGAC 195
||||| ||| .|||| ||||| .||||||||||||||||
Sbjct 14 TAAGTGCAGGCGTCTTCTTCCCTCCTTGTTCACAA-CACAG--AACAT---------TAGCTCAGGTACCTGAC 75
Query 196 AATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAA 269
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 76 AATGATGAGCAGTTTGTTCCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAA 149
Query 270 AGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAG 343
||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 AGAACCCCACAGCCCATGTTCAGAACTCGGGTCTGCTTGCAGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAG 223
Query 344 AAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACA 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 224 AAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACA 297
Query 418 CCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGC 491
|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||.||.|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 298 CCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACTACACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGC 371
Query 492 CTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCC 565
|||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 372 CTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTCAGTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCC 445
Query 566 AGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGC 639
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 446 AGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTTCCTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGC 519
Query 640 CAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACA 713
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 520 CAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACA 593
Query 714 CAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATT 787
.|.|||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 594 TACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCAGCCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATT 667
Query 788 TTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGC 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 668 TTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGC 741
Query 862 AGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATT 935
||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 742 AGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAAGGGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTT 815
Query 936 CGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGC 1009
||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.||||
Sbjct 816 CGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTGGAATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGC 889
Query 1010 TCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATG 1083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 890 TCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATG 963
Query 1084 GAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTA 1157
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 964 GAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGAGGTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTA 1037
Query 1158 TGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATG 1231
|||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1038 TGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCTATTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACG 1111
Query 1232 TCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAG 1305
|.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1112 TGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAAGCCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAG 1185
Query 1306 ACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACAT 1379
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1186 ACGGACATGGAACGTCACATCAACGAAGAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACAT 1259
Query 1380 GCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT 1431
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1260 GCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTCACCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC 1311