Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00520
• Subject: XM_006514969.3
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1164
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TAAGTCAATTACAGGAAACATGGCT---TGCAG-----AAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTAC  214
                        |.||||.|| .||   .||||     || |||||   ||||.| .||.|| |.|||.|.|||
Sbjct    1  ------------ATGAAATAT-ACTGTAGGCAGCCTCCAA-CTCAG---CCTGTC-CTGGTG-GGAGTCTCTAC  55

Query  215  CAGA-CTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATG  287
               | ||.|||.||  ||||  ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct   56  ---ATCTCTCATGC--AAAG--TGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATG  122

Query  288  TTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATG  361
            |||||||.||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  123  TTCAGAACTCGGGTCTGCTTGCAGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATG  196

Query  362  TCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTG  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  197  TCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTG  270

Query  436  TCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCC  509
            ||||||||.||.|||||||||||||||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  271  TCCCCACTACACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCC  344

Query  510  TCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTA  583
            |||.||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  345  TCCTTCTCAGTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTA  418

Query  584  ACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAAC  657
            |.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419  ATTCTTTTCCTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAAC  492

Query  658  ATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAG  731
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.|
Sbjct  493  ATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGG  566

Query  732  TGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAG  805
            |||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  567  TGCAGCCAGCCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAG  640

Query  806  TGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATG  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  641  TGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATG  714

Query  880  TTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACA  953
            |||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct  715  TTTGAGAAGGGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCA  788

Query  954  AGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAG  1027
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  789  AGAGCCTGGAATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAG  862

Query 1028  CTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAG  1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  CTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAG  936

Query 1102  CCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTC  1175
            ||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  937  CCCGAAGAGGTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTC  1010

Query 1176  ACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTG  1249
            .|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1011  TCTCCGCTATTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTG  1084

Query 1250  ATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCAC  1323
            |.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1085  ACCCGGAAGCCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCAC  1158

Query 1324  ATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTG  1397
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1159  ATCAACGAAGAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTG  1232

Query 1398  CAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1431
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1233  CAACCCTCACCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC  1266