Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00520
• Subject: XM_006514970.3
• Aligned Length: 1432
• Identities: 1177
• Gaps: 170

Alignment

Query    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TAAGTCAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAA-GCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTA  221
                               |||  ||...||| ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  -------------------ATG--TTAATGAATGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTTCCAGACTA  53

Query  222  TCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAA  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct   54  TCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATGTTCAGAAC  127

Query  296  TCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCC  369
            ||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  TCGGGTCTGCTTGCAGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCC  201

Query  370  TATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACT  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  202  TATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACT  275

Query  444  GCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGC  517
            .||.|||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  276  ACACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTC  349

Query  518  AGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTT  591
            |||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  350  AGTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTT  423

Query  592  CCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTT  665
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  CCTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTT  497

Query  666  CCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCA  739
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.||||
Sbjct  498  CCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCA  571

Query  740  GCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGC  813
            ||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  GCCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGC  645

Query  814  TGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  646  TGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAA  719

Query  888  GGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAG  961
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct  720  GGGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTG  793

Query  962  GAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTG  1035
            |||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  GAATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTG  867

Query 1036  GATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGA  1109
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  868  GATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGA  941

Query 1110  GGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCT  1183
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  942  GGTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCT  1015

Query 1184  ATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAA  1257
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1016  ATTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAA  1089

Query 1258  GCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGA  1331
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  GCCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAACGA  1163

Query 1332  GGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCC  1405
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1164  AGAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTC  1237

Query 1406  ACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1431
            ||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1238  ACCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC  1263