Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00520
• Subject: XM_006514971.3
• Aligned Length: 1434
• Identities: 1161
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148
                                                              ||.|           ||||||||.
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGC-----------TTCAAGATT  13

Query  149  TAAGTCAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTG---ACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGAC  219
            ||||     |.||||...|.|  |||.|     |||     |.||   ||||       ||        ||||.
Sbjct   14  TAAG-----TGCAGGCGTCTT--CTTCC-----CTC-----CTTGTTCACAA-------CA--------CAGAA  55

Query  220  TATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGA  293
            .||.||          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct   56  CATTAG----------TGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATGTTCAGA  119

Query  294  AATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTG  367
            |.||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120  ACTCGGGTCTGCTTGCAGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTG  193

Query  368  CCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCA  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  194  CCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCA  267

Query  442  CTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATC  515
            ||.||.|||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  268  CTACACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTC  341

Query  516  GCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCT  589
            .||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  342  TCAGTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTT  415

Query  590  TTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCC  663
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  TTCCTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCC  489

Query  664  TTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGC  737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.||
Sbjct  490  TTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGC  563

Query  738  CAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTA  811
            ||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  CAGCCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTA  637

Query  812  GCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAA  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  638  GCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAG  711

Query  886  AAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCC  959
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  712  AAGGGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCC  785

Query  960  AGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTC  1033
            .||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  TGGAATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTC  859

Query 1034  TGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAA  1107
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  860  TGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAA  933

Query 1108  GAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCG  1181
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  934  GAGGTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCG  1007

Query 1182  CTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAG  1255
            ||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1008  CTATTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGG  1081

Query 1256  AAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAAC  1329
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  AAGCCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAAC  1155

Query 1330  GAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCC  1403
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  GAAGAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCC  1229

Query 1404  CCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1431
            .|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1230  TCACCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC  1257