Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00520
- Subject:
- XM_011515167.3
- Aligned Length:
- 1485
- Identities:
- 1413
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ----------------ATGGATGGATTTTATGACCAGCA--AG------------------------------- 25
|||||.|| ||||| ||
Sbjct 1 ATGAGTGGAAGAGGAGATGGAGGG----------CAGCAGCAGCTGCTGCACTCAAAGTTTTTGGCTGGGTTTG 64
Query 26 --TGCCTTACATGGTCACCAAT---AGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAAACCAACAAATGTCAGGAAAA 94
|||| ||||.|..|..||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 TCTGCC--ACATTGAAAAGAATGAAAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAAACCAACAAATGTCAGGAAAA 136
Query 95 GAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTAAGTCAATTACAGGAAACA 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 GAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTAAGTCAATTACAGGAAACA 210
Query 169 TGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTT 242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 TGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTT 284
Query 243 TCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAG 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 TCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAG 358
Query 317 AACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTG 390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTG 432
Query 391 GGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTC 464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 GGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTC 506
Query 465 AACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCT 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 AACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCT 580
Query 539 ACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCA 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 ACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCA 654
Query 613 AGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCA 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 AGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCA 728
Query 687 GGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTC 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 GGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTC 802
Query 761 TGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGG 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 TGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGG 876
Query 835 CAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGA 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 CAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGA 950
Query 909 TGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCA 982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 TGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCA 1024
Query 983 CATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCAT 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 CATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCAT 1098
Query 1057 TTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCAT 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 TTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCAT 1172
Query 1131 TCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTA 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 TCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTA 1246
Query 1205 TGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTT 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 TGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTT 1320
Query 1279 CCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTC 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 CCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTC 1394
Query 1353 TCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACG 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 TCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACG 1468
Query 1427 TGTAT 1431
|||||
Sbjct 1469 TGTAT 1473