Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00523
• Subject: NM_010162.2
• Aligned Length: 2238
• Identities: 2145
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCAGGCCAAAAAACGCTATTTCATCCTGCTCTCAGCTGGCTCTTGTCTCGCCCTTTTGTTTTATTTCGGAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGCAGGCCAAAAAACGCTATTTCATCCTGCTCTCAGCTGGCTCTTGTCTCGCCCTTTTGTTTTATTTTGGAGG  74

Query   75  CTTGCAGTTTAGGGCATCGAGGAGCCACAGCCGGAGAGAAGAACACAGCGGTAGGAATGGCTTGCACCACCCCA  148
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  CGTGCAGTTTAGGGCATCGAGGAGCCACAGCCGGAGAGAAGAGCACAGTGGTCGGAATGGCTTGCACCAGCCCA  148

Query  149  GTCCGGATCATTTCTGGCCCCGCTTCCCGGACGCTCTGCGCCCCTTCGTTCCTTGGGATCAATTGGAAAACGAG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTCCGGATCATTTCTGGCCCCGCTTCCCGGACGCTCTGCGCCCTTTCTTTCCTTGGGATCAATTGGAAAACGAG  222

Query  223  GATTCCAGCGTGCACATTTCCCCCCGGCAGAAGCGAGATGCCAACTCCAGCATCTACAAAGGCAAGAAGTGCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATTCCAGCGTGCACATTTCCCCCCGGCAGAAGCGAGACGCCAACTCGAGCATCTACAAAGGCAAGAAGTGCCG  296

Query  297  CATGGAGTCCTGCTTCGATTTCACCCTTTGCAAGAAAAACGGCTTCAAAGTCTACGTATACCCACAGCAAAAAG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  297  CATGGAGTCCTGCTTCGATTTCACCCTTTGCAAGAAAAACGGCTTCAAAGTCTACGTGTACCCGCAGCAGAAAG  370

Query  371  GGGAGAAAATCGCCGAAAGTTACCAAAACATTCTAGCGGCCATCGAGGGCTCCAGGTTCTACACCTCGGACCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAGAAAATCGCCGAAAGTTACCAAAACATTCTAGCGGCCATCGAGGGCTCCAGGTTCTACACCTCGGACCCC  444

Query  445  AGCCAGGCGTGCCTCTTTGTCCTGAGTCTGGATACTTTAGACAGAGACCAGTTGTCACCTCAGTATGTGCACAA  518
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCAGGCGTGCCTCTTTGTCTTGAGTCTGGATACTTTAGACAGAGACCAGTTATCACCTCAGTATGTGCACAA  518

Query  519  TTTGAGATCCAAAGTGCAGAGTCTCCACTTGTGGAACAATGGTAGGAATCATTTAATTTTTAATTTATATTCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TTTGAGATCCAAAGTGCAGAGTCTCCACTTGTGGAACAATGGTAGGAATCATTTAATTTTTAATTTATATTCTG  592

Query  593  GCACTTGGCCTGACTACACCGAGGACGTGGGGTTTGACATCGGCCAGGCGATGCTGGCCAAAGCCAGCATCAGT  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCACTTGGCCTGACTACACTGAGGACGTGGGGTTTGACATCGGCCAGGCGATGCTGGCCAAAGCCAGCATCAGT  666

Query  667  ACTGAAAACTTCCGACCCAACTTTGATGTTTCTATTCCCCTCTTTTCTAAGGATCATCCCAGGACAGGAGGGGA  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTGAAAACTTCCGACCAAACTTTGATGTTTCTATTCCCCTCTTTTCTAAGGATCATCCCAGGACAGGAGGGGA  740

Query  741  GAGGGGGTTTTTGAAGTTCAACACCATCCCTCCTCTCAGGAAGTACATGCTGGTATTCAAGGGGAAGAGGTACC  814
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  741  GAGGGGGTTTTTGAAATTTAACACCATCCCTCCTCTCAGGAAGTACATGCTGGTATTCAAGGGGAAGCGGTACC  814

Query  815  TGACAGGGATAGGATCAGACACCAGGAATGCCTTATATCACGTCCATAACGGGGAGGACGTTGTGCTCCTCACC  888
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct  815  TGACAGGGATAGGGTCAGACACCAGGAATGCCTTATATCACGTCCATAACGGGGAGGACGTCTTGCTCCTCACC  888

Query  889  ACCTGCAAGCATGGCAAAGACTGGCAAAAGCACAAGGATTCTCGCTGTGACAGAGACAACACCGAGTATGAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCTGCAAGCATGGCAAAGACTGGCAAAAGCACAAGGATTCTCGCTGTGACAGAGACAACACCGAGTATGAGAA  962

Query  963  GTATGATTATCGGGAAATGCTGCACAATGCCACTTTCTGTCTGGTTCCTCGTGGTCGCAGGCTTGGGTCCTTCA  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATATGATTATCGGGAAATGCTGCACAATGCCACTTTCTGTCTGGTTCCTCGTGGTCGCAGGCTTGGGTCCTTCA  1036

Query 1037  GATTCCTGGAGGCTTTGCAGGCTGCCTGCGTCCCTGTGATGCTCAGCAATGGATGGGAGTTGCCATTCTCTGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  GATTCCTGGAGGCTTTGCAGGCTGCCTGTGTCCCTGTAATGCTCAGCAACGGATGGGAGTTGCCATTCTCCGAA  1110

Query 1111  GTGATTAATTGGAACCAAGCTGCCGTCATAGGCGATGAGAGATTGTTATTACAGATTCCTTCTACAATCAGGTC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGATTAATTGGAACCAAGCTGCCGTCATAGGCGATGAGAGATTGCTATTACAGATTCCTTCTACAATCAGGTC  1184

Query 1185  TATTCATCAGGATAAAATCCTAGCACTTAGACAGCAGACACAATTCTTGTGGGAGGCTTATTTTTCTTCAGTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATTCATCAGGATAAAATCCTAGCACTTAGACAGCAGACACAGTTCTTGTGGGAGGCTTATTTTTCTTCAGTTG  1258

Query 1259  AGAAGATTGTATTAACTACACTAGAGATTATTCAGGACAGAATATTCAAGCACATATCACGTAACAGTTTAATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAAGATTGTATTAACTACACTAGAGATTATTCAGGACAGAATATTCAAGCACATATCACGTAACAGTTTAATA  1332

Query 1333  TGGAACAAACATCCTGGAGGATTGTTCGTACTACCACAGTATTCATCTTATCTGGGAGATTTTCCTTACTACTA  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  TGGAACAAACATCCTGGAGGATTGTTCGTCCTACCGCAGTATTCATCTTACCTGGGAGATTTCCCTTACTACTA  1406

Query 1407  TGCTAATTTAGGTTTAAAGCCCCCCTCCAAATTCACTGCAGTCATCCATGCGGTGACCCCCCTGGTCTCTCAGT  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCTAATTTAGGTTTAAAGCCCCCCTCCAAATTCACTGCAGTCATCCATGCTGTGACTCCCCTGGTCTCTCAGT  1480

Query 1481  CCCAGCCAGTGTTGAAGCTTCTCGTGGCTGCAGCCAAGTCCCAGTACTGTGCCCAGATCATAGTTCTATGGAAT  1554
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  CCCAGCCAGTGTTGAAGCTTCTTGTGGCTGCAGCCAAATCCCAGTACTGTGCGCAGATCATAGTTCTGTGGAAT  1554

Query 1555  TGTGACAAGCCCCTACCAGCCAAACACCGCTGGCCTGCCACTGCTGTGCCTGTCGTCGTCATTGAAGGAGAGAG  1628
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||
Sbjct 1555  TGTGACAAGCCTCTACCAGCCAAACATCGCTGGCCTGCCACTGCCGTGCCTGTCATCGTCATTGAAGGAGAAAG  1628

Query 1629  CAAGGTTATGAGCAGCCGTTTTCTGCCCTACGACAACATCATCACAGACGCCGTGCTCAGCCTTGACGAGGACA  1702
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1629  CAAGGTTATGAGCAGCCGGTTTCTGCCCTATGACAACATCATCACTGATGCTGTGCTCAGCCTGGATGAGGACA  1702

Query 1703  CGGTGCTTTCAACAACAGAGGTGGATTTCGCCTTCACAGTGTGGCAGAGCTTCCCTGAGAGGATTGTGGGGTAC  1776
            |.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1703  CTGTGCTTTCAACTACGGAAGTGGATTTTGCCTTCACCGTATGGCAGAGCTTCCCAGAGAGGATTGTGGGATAT  1776

Query 1777  CCCGCGCGCAGCCACTTCTGGGATAACTCTAAGGAGCGGTGGGGATACACATCAAAGTGGACGAACGACTACTC  1850
            ||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1777  CCTGCTCGCAGTCATTTCTGGGATAACTCAAAGGAGCGGTGGGGATATACATCCAAGTGGACGAATGACTACTC  1850

Query 1851  CATGGTGTTGACAGGAGCTGCTATTTACCACAAATATTATCACTACCTATACTCCCATTACCTGCCAGCCAGCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CATGGTGTTGACAGGAGCTGCTATCTACCACAAATATTATCACTACCTGTATTCCCATTACCTGCCAGCCAGCC  1924

Query 1925  TGAAGAACATGGTGGACCAATTGGCCAATTGTGAGGACATTCTCATGAACTTCCTGGTGTCTGCTGTGACAAAA  1998
            |||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGAAGAACATGGTAGACCAACTGGCCAACTGTGAGGACATTCTCATGAATTTCCTGGTGTCTGCTGTGACAAAA  1998

Query 1999  TTGCCTCCAATCAAAGTGACCCAGAAGAAGCAGTATAAGGAGACAATGATGGGACAGACTTCTCGGGCTTCCCG  2072
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1999  TTGCCTCCAATCAAAGTGACCCAGAAGAAACAGTATAAGGAGACAATGATGGGACAGACTTCCCGAGCATCCCG  2072

Query 2073  TTGGGCTGACCCTGACCACTTTGCCCAGCGACAGAGCTGCATGAATACGTTTGCCAGCTGGTTTGGCTACATGC  2146
            .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTGGGCCGACCCTGACCACTTTGCCCAGCGACAGAGCTGCATGAATACATTTGCCAGCTGGTTTGGCTACATGC  2146

Query 2147  CGCTGATCCACTCTCAGATGAGGCTCGACCCCGTCCTCTTTAAAGACCAGGTCTCTATTTTGAGGAAGAAATAC  2220
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 2147  CGCTGATCCATTCTCAGATGAGGCTGGACCCGGTCCTCTTTAAAGACCAAGTCTCAATTCTGAGGAAGAAATAC  2220

Query 2221  CGAGACATTGAGCGACTT  2238
            .||||||||||.||||||
Sbjct 2221  AGAGACATTGAACGACTT  2238