Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00539
• Subject: NM_004629.1
• Aligned Length: 1866
• Identities: 1866
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCCCGCCAGACCACCTCTGTGGGCTCCAGCTGCCTGGACCTGTGGAGGGAAAAGAATGACCGGCTCGTTCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCGCCAGACCACCTCTGTGGGCTCCAGCTGCCTGGACCTGTGGAGGGAAAAGAATGACCGGCTCGTTCG  74

Query   75  ACAGGCCAAGGTGGCTCAGAACTCCGGTCTGACTCTGAGGCGACAGCAGTTGGCTCAGGATGCACTGGAAGGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAGGCCAAGGTGGCTCAGAACTCCGGTCTGACTCTGAGGCGACAGCAGTTGGCTCAGGATGCACTGGAAGGGC  148

Query  149  TCAGAGGGCTCCTCCATAGTCTGCAAGGGCTCCCTGCAGCTGTTCCTGTTCTTCCCTTGGAGCTGACTGTCACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGAGGGCTCCTCCATAGTCTGCAAGGGCTCCCTGCAGCTGTTCCTGTTCTTCCCTTGGAGCTGACTGTCACC  222

Query  223  TGCAACTTCATTATCCTGAGGGCAAGCTTGGCCCAGGGTTTCACAGAGGATCAGGCCCAGGATATCCAGCGGAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAACTTCATTATCCTGAGGGCAAGCTTGGCCCAGGGTTTCACAGAGGATCAGGCCCAGGATATCCAGCGGAG  296

Query  297  CCTAGAGAGAGTGCTGGAGACACAGGAGCAGCAGGGGCCCAGGTTGGAACAGGGGCTCAGGGAGCTGTGGGACT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTAGAGAGAGTGCTGGAGACACAGGAGCAGCAGGGGCCCAGGTTGGAACAGGGGCTCAGGGAGCTGTGGGACT  370

Query  371  CTGTCCTTCGTGCTTCCTGCCTTCTGCCGGAGCTGCTGTCTGCCCTGCACCGCCTGGTTGGCCTGCAGGCTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGTCCTTCGTGCTTCCTGCCTTCTGCCGGAGCTGCTGTCTGCCCTGCACCGCCTGGTTGGCCTGCAGGCTGCC  444

Query  445  CTCTGGTTGAGTGCTGACCGTCTTGGGGACCTGGCCTTGTTACTAGAGACCCTGAATGGCAGCCAGAGTGGAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCTGGTTGAGTGCTGACCGTCTTGGGGACCTGGCCTTGTTACTAGAGACCCTGAATGGCAGCCAGAGTGGAGC  518

Query  519  CTCTAAGGATCTGCTGTTACTTCTGAAAACTTGGAGTCCCCCAGCTGAGGAATTAGATGCTCCATTGACCCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCTAAGGATCTGCTGTTACTTCTGAAAACTTGGAGTCCCCCAGCTGAGGAATTAGATGCTCCATTGACCCTGC  592

Query  593  AGGATGCCCAGGGATTGAAGGATGTCCTCCTGACAGCATTTGCCTACCGCCAAGGTCTCCAGGAGCTGATCACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGATGCCCAGGGATTGAAGGATGTCCTCCTGACAGCATTTGCCTACCGCCAAGGTCTCCAGGAGCTGATCACA  666

Query  667  GGGAACCCAGACAAGGCACTAAGCAGCCTTCATGAAGCGGCCTCAGGCCTGTGTCCACGGCCTGTGTTGGTCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGAACCCAGACAAGGCACTAAGCAGCCTTCATGAAGCGGCCTCAGGCCTGTGTCCACGGCCTGTGTTGGTCCA  740

Query  741  GGTGTACACAGCACTGGGGTCCTGTCACCGTAAGATGGGAAATCCACAGAGAGCACTGTTGTACTTGGTTGCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTGTACACAGCACTGGGGTCCTGTCACCGTAAGATGGGAAATCCACAGAGAGCACTGTTGTACTTGGTTGCAG  814

Query  815  CCCTGAAAGAGGGATCAGCCTGGGGTCCTCCACTTCTGGAGGCCTCTAGGCTCTATCAGCAACTGGGGGACACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCTGAAAGAGGGATCAGCCTGGGGTCCTCCACTTCTGGAGGCCTCTAGGCTCTATCAGCAACTGGGGGACACA  888

Query  889  ACAGCAGAGCTGGAGAGTCTGGAGCTGCTAGTTGAGGCCTTGAATGTCCCATGCAGTTCCAAAGCCCCGCAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGCAGAGCTGGAGAGTCTGGAGCTGCTAGTTGAGGCCTTGAATGTCCCATGCAGTTCCAAAGCCCCGCAGTT  962

Query  963  TCTCATTGAGGTAGAATTACTACTGCCACCACCTGACCTAGCCTCACCCCTTCATTGTGGCACTCAGAGCCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTCATTGAGGTAGAATTACTACTGCCACCACCTGACCTAGCCTCACCCCTTCATTGTGGCACTCAGAGCCAGA  1036

Query 1037  CCAAGCACATACTAGCAAGCAGGTGCCTACAGACGGGGAGGGCAGGAGACGCTGCAGAGCATTACTTGGACCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAGCACATACTAGCAAGCAGGTGCCTACAGACGGGGAGGGCAGGAGACGCTGCAGAGCATTACTTGGACCTG  1110

Query 1111  CTGGCCCTGTTGCTGGATAGCTCGGAGCCAAGGTTCTCCCCACCCCCCTCCCCTCCAGGGCCCTGTATGCCTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGGCCCTGTTGCTGGATAGCTCGGAGCCAAGGTTCTCCCCACCCCCCTCCCCTCCAGGGCCCTGTATGCCTGA  1184

Query 1185  GGTGTTTTTGGAGGCAGCGGTAGCACTGATCCAGGCAGGCAGAGCCCAAGATGCCTTGACTCTATGTGAGGAGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTGTTTTTGGAGGCAGCGGTAGCACTGATCCAGGCAGGCAGAGCCCAAGATGCCTTGACTCTATGTGAGGAGT  1258

Query 1259  TGCTCAGCCGCACATCATCTCTGCTACCCAAGATGTCCCGGCTGTGGGAAGATGCCAGAAAAGGAACCAAGGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTCAGCCGCACATCATCTCTGCTACCCAAGATGTCCCGGCTGTGGGAAGATGCCAGAAAAGGAACCAAGGAA  1332

Query 1333  CTGCCATACTGCCCACTCTGGGTCTCTGCCACCCACCTGCTTCAGGGCCAGGCCTGGGTTCAACTGGGTGCCCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGCCATACTGCCCACTCTGGGTCTCTGCCACCCACCTGCTTCAGGGCCAGGCCTGGGTTCAACTGGGTGCCCA  1406

Query 1407  AAAAGTGGCAATTAGTGAATTTAGCAGGTGCCTCGAGCTGCTCTTCCGGGCCACACCTGAGGAAAAAGAACAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAAAGTGGCAATTAGTGAATTTAGCAGGTGCCTCGAGCTGCTCTTCCGGGCCACACCTGAGGAAAAAGAACAAG  1480

Query 1481  GGGCAGCTTTCAACTGTGAGCAGGGATGTAAGTCAGATGCGGCACTGCAGCAGCTTCGGGCAGCCGCCCTAATT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGGCAGCTTTCAACTGTGAGCAGGGATGTAAGTCAGATGCGGCACTGCAGCAGCTTCGGGCAGCCGCCCTAATT  1554

Query 1555  AGTCGTGGACTGGAATGGGTAGCCAGCGGCCAGGATACCAAAGCCTTACAGGACTTCCTCCTCAGTGTGCAGAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGTCGTGGACTGGAATGGGTAGCCAGCGGCCAGGATACCAAAGCCTTACAGGACTTCCTCCTCAGTGTGCAGAT  1628

Query 1629  GTGCCCAGGTAATCGAGACACTTACTTTCACCTGCTTCAGACTCTGAAGAGGCTAGATCGGAGGGATGAGGCCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTGCCCAGGTAATCGAGACACTTACTTTCACCTGCTTCAGACTCTGAAGAGGCTAGATCGGAGGGATGAGGCCA  1702

Query 1703  CTGCACTCTGGTGGAGGCTGGAGGCCCAAACTAAGGGGTCACATGAAGATGCTCTGTGGTCTCTCCCCCTGTAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGCACTCTGGTGGAGGCTGGAGGCCCAAACTAAGGGGTCACATGAAGATGCTCTGTGGTCTCTCCCCCTGTAC  1776

Query 1777  CTAGAAAGCTATTTGAGCTGGATCCGTCCCTCTGATCGTGACGCCTTCCTTGAAGAATTTCGGACATCTCTGCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTAGAAAGCTATTTGAGCTGGATCCGTCCCTCTGATCGTGACGCCTTCCTTGAAGAATTTCGGACATCTCTGCC  1850

Query 1851  AAAGTCTTGTGACCTG  1866
            ||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAAGTCTTGTGACCTG  1866