Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00540
- Subject:
- NR_152751.1
- Aligned Length:
- 1829
- Identities:
- 1234
- Gaps:
- 391
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------ATGGCGGATGGTCAGGTGGCGGAAC 25
|||||||||..||..||...|||.|
Sbjct 1 CCTAGTCAGGTCCGGCGGCCTGCACACGCCAAGCACGCTGGGAGTAGCCATGGCGGATAATCCCGTTTTGGAGC 74
Query 26 TGCTGCTCCGGCGGCTGGAGGCGTCTGATGGCGGCCTGGACAGCGCCGAGTTGGCGGCTGAGCTGGGCATGGAG 99
||.||||.|||||||||||||...||||||||||.|||||||||||.||||||||..|..|||||||..|||||
Sbjct 75 TGTTGCTGCGGCGGCTGGAGGTAGCTGATGGCGGTCTGGACAGCGCGGAGTTGGCTACGCAGCTGGGTGTGGAG 148
Query 100 CACCAGGCGGTGGTGGGCGCCGTGAAGAGCCTTCAGGCGCTGGGCGAGGTCATCGAGGCTGAACTTCGGTCCAC 173
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct 149 CACCAGGCGGTGGTGGGCGCAGTGAAGAGCCTTCAAGCTCTGGGTGAGGTCATTGAGGCTGAGCTTCGTTCTAC 222
Query 174 CAAGCACTGGGAGCTTACTGCGGAGGGCGAGGAGATTGCCCGGGAGGGCAGCCATGAGGCCCGTGTGTTTCGAA 247
||||..|||||||||.|||.| ||||||.|
Sbjct 223 CAAGTGCTGGGAGCTGACTAC---------------------------------TGAGGCAC------------ 251
Query 248 GCATTCCCCCAGAGGGCCTGGCCCAGAGCGAGCTTATGCGACTGCCCAGTGGCAAAGTGGGCTTCAGCAAGGCC 321
||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 252 -----------------------------------------CTGCCCAGCGGCAAGGTGGGCTTCAGCAAGGCC 284
Query 322 ATGTCCAACAAGTGGATTCGGGTGGACAAGAGTGCGGCTGACGGGCCCCGGGTGTTCCGAGTGGTGGACAGCAT 395
|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 285 ATGTCCAACAAGTGGATCCGAGTGGACAAGAGTGCCGCCGACGGGCCCCGGGTGTTCCGAGTGGTGGACAGTAT 358
Query 396 GGAGGATGAGGTGCAGCGGCGGCTCCAGCTGGTCCGGGGGGGACAGGCTGAGAAGCTGGGGGAGAAGGAGAGGA 469
.||||||||.||||||..||||.|.||||||||||.||..||.||||||||||||||||..||.|||||..|||
Sbjct 359 AGAGGATGAAGTGCAGAAGCGGTTGCAGCTGGTCCAGGCAGGCCAGGCTGAGAAGCTGGCTGAAAAGGAACGGA 432
Query 470 GCGAGCTGAGGAAGAGGAAGCTGTTGGCTGAAGTGACTCTGAAGACCTACTGGGTGAGCAAAGGCAGTGCCTTT 543
..|||||.|||||||||||||||.||.|.|||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||..|||||.
Sbjct 433 ATGAGCTCAGGAAGAGGAAGCTGCTGACGGAAGTGATCCTGAAAACCTACTGGGTGAGCAAGGGCAAGGCCTTC 506
Query 544 AGTACCAGCATCTCCAAGCAAGAGACAGAGCTGAGCCCAGAGATGATCTCCAGTGGCTCTTGGCGGGACCGGCC 617
||.||.|||.|.||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 507 AGCACAAGCGTGTCTAAGCAGGAGGCAGAGCTGAGCCCAGAGATGATCTCCAGTGGCTCTTGGAGGGACCGACC 580
Query 618 CTTCAAGCCCTACAACTTCTTGGCCCACGGTGTCCTCCCCGACAGCGGCCACCTTCACCCGCTGCTCAAGGTCC 691
.|||||.|||||||||||||..||||..|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||..||||||||||||
Sbjct 581 TTTCAAACCCTACAACTTCTCTGCCCGTGGTGTGCTCCCAGATAGTGGCCACCTGCACCCCTTGCTCAAGGTCC 654
Query 692 GCTCCCAGTTCCGACAGATCTTCCTGGAGATGGGGTTCACCGAGATGCCGACTGATAACTTCATTGAGAGCTCC 765
||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 655 GCTCTCAGTTCCGACAAATCTTCTTGGAGATGGGGTTCACTGAGATGCCTACGGACAATTTCATTGAGAGCTCC 728
Query 766 TTCTGGAACTTTGACGCCCTCTTCCAGCCCCAGCAGCACCCAGCCCGTGACCAGCACGACACCTTCTTCCTTCG 839
||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 729 TTCTGGAACTTTGATGCACTCTTTCAGCCTCAGCAGCACCCAGCACGTGACCAACATGATACTTTCTTCCTGCG 802
Query 840 AGATCCAGCGGAGGCCCTGCAGCTCCCAATGGACTATGTCCAGCGGGTCAAGCGGACCCACTCTCAGGGCGGCT 913
|||.|||||.||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 803 AGACCCAGCTGAGGCCCTGCAGCTTCCAATGGGCTATGTCCAGCGCGTGAAACGGACCCACTCCCAGGGTGGCT 876
Query 914 ACGGCTCACAGGGGTACAAGTATAACTGGAAGCTGGACGAGGCCCGGAAAAACCTACTGCGAACCCACACCACA 987
|||||||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 877 ACGGCTCACAGGGCTACAAGTATACCTGGAAGCTGGAAGAGGCCCGGAAAAACCTGCTTCGCACACACACCACA 950
Query 988 TCAGCCAGCGCCCGTGCGCTCTACCGCCTTGCCCAGAAGAAGCCCTTCACTCCGGTCAAGTACTTCTCCATCGA 1061
.|||||||||||||.||.|||||||...|.||||||||||||||.||.||.||.|.||||||||||||.||.||
Sbjct 951 GCAGCCAGCGCCCGCGCCCTCTACCAGTTAGCCCAGAAGAAGCCGTTTACACCAGCCAAGTACTTCTCTATTGA 1024
Query 1062 CCGCGTATTCCGGAATGAGACCCTGGACGCCACGCACCTGGCTGAGTTCCACCAGATCGAGGGCGTGGTGGCGG 1135
.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||..|.||.|
Sbjct 1025 TCGTGTGTTTCGGAATGAGACGCTGGACGCCACGCACCTGGCGGAGTTCCACCAGATTGAGGGTGTAATAGCAG 1098
Query 1136 ATCATGGTCTCACCTTGGGCCACCTCATGGGCGTTCTGCGGGAGTTCTTCACCAAGCTGGGTATCACGCAACTC 1209
|.||||||||||||.|.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||..|.
Sbjct 1099 ACCATGGTCTCACCCTAGGCCACCTCATGGGTGTGCTGAGGGAGTTCTTCACCAAGCTGGGAATCACGCAGTTG 1172
Query 1210 CGCTTCAAGCCAGCCTACAACCCATACACAGAGCCCAGCATGGAGGTGTTCAGCTACCACCAAGGCCTGAAGAA 1283
||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1173 CGCTTCAAACCAGCCTACAACCCCTACACAGAGCCCAGCATGGAAGTGTTCAGCTACCACCAAGGTCTAAAGAA 1246
Query 1284 GTGGGTGGAGGTCGGAAACTCGGGGGTCTTCCGTCCAGAGATGCTGCTGCCCATGGGGCTTCCCGAGAACGTGT 1357
||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1247 GTGGGTTGAAGTTGGCAACTCTGGGGTCTTCCGCCCTGAGATGCTCCTGCCTATGGGGCTCCCTGAGAATGTGT 1320
Query 1358 CGGTCATTGCCTGGGGCCTCTCCCTGGAGCGCCCAACGATGATCAAATATGGCATCAACAATATCCGGGAGCTG 1431
|.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1321 CTGTCATTGCTTGGGGTCTCTCCCTGGAACGCCCAACAATGATCAAATATGGCATCAATAACATCCGAGAACTG 1394
Query 1432 GTGGGCCACAAGGTGAACCTGCAGATGGTGTATGACAGTCCCCTGTGCCGCCTGGATGCCGAGCCGAGGCCCCC 1505
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..|||||||.||||||...|||||.|||.||.|
Sbjct 1395 GTGGGCCACAAGGTGAACCTGCAGATGGTATACGACAGCCCTGTGTGCCGACTGGATATTGAGCCCAGGTCCTC 1468
Query 1506 TCCCACACAGGAGGCTGCG------------------------------------------------------- 1524
....||||||||||||||.
Sbjct 1469 AAAGACACAGGAGGCTGCATGATATAGGCTGTTCCAGAGATCCCTGTCTAGTCCCTGTGCATCTCTTGGCAGTG 1542
Query 1525 -------------------------------------------------------------------------- 1524
Sbjct 1543 ACCTACTATTTATGAGGCCTCTGTGAGGCCAGCTCACTCCCCCTGCCTCTCCCACCCTGGGGGCAGGGTTCTAA 1616
Query 1525 -------------------------------------------------------------------------- 1524
Sbjct 1617 GTATGGGGAGTTCTTATGCTGGCTTTTAGTGGTGTGTGTAGTTTGCTTGTAAGGGTGGGTTTGGCCCTGCAGGC 1690
Query 1525 ----------------------------------------------------- 1524
Sbjct 1691 CAGCTGTTTTAATAAAGTGGGCACATTCCCTCATTTGGTGCCTTTTGTTAGGA 1743