Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00548
• Subject: XM_024454066.1
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1257
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGCCCCTGTCCCGCTGGTTGAGATCTGTGGGGGTCTTCCTGCTGCCAGCCCCCTACTGGGCACCCCGGGAGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCCTGTCCCGCTGGTTGAGATCTGTGGGGGTCTTCCTGCTGCCAGCCCCCTACTGGGCACCCCGGGAGAG  74

Query   75  GTGGCTGGGTTCCCTACGGCGGCCCTCCCTGGTGCACGGGTACCCAGTCCTGGCCTGGCACAGTGCCCGCTGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGGCTGGGTTCCCTACGGCGGCCCTCCCTGGTGCACGGGTACCCAGTCCTGGCCTGGCACAGTGCCCGCTGCT  148

Query  149  GGTGCCAAGCGTGGACAGAGGAACCTCGAGCCCTTTGCTCCTCCCTCAGAATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGTGCCAAGCGTGGACAGAGGAACCTCGAGCCCTTTGCTCCTCCCTCAGAATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT  222

Query  223  GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT  296

Query  297  GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT  370

Query  371  ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC  444

Query  445  CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA  518

Query  519  TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG  592

Query  593  CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG  666

Query  667  ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG  740

Query  741  CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT  814

Query  815  TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG  888

Query  889  ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATT-----------------------------------------  921
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct  889  ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATTCAGGTAAGAAGGCAGGAGGCAGTAGCAGAGAACAGGCACCA  962

Query  922  ----------------------------------------------------------------CAGGATGATT  931
                                                                            ||||||||||
Sbjct  963  GCTTCACTCCTCCTCTGCCCAGGAACCTCATCCTTCCTCTTTTGCTGCCCTCCCCCTCCCTGCCCAGGATGATT  1036

Query  932  ACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGACCGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGG  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGACCGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGG  1110

Query 1006  CTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTCCAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGA  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTCCAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGA  1184

Query 1080  GGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTATATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGG  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTATATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGG  1258

Query 1154  AAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCATTGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCATTGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGG  1332

Query 1228  CTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAG  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAG  1362