Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00605
• Subject: XM_006714168.4
• Aligned Length: 2253
• Identities: 1863
• Gaps: 390

Alignment

Query    1  ATGAGCGGTGGTGAAGTGGTCTGCTCCGGATGGCTCCGCAAGTCCCCCCCGGAGAAAAAGTTGAAGCGTTATGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATGGAAGAGGAGATGGTTCGTGTTACGCAGTGGCCGTTTAACTGGAGATCCAGATGTTTTGGAATATTACAAAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGATCATGCCAAGAAGCCTATTCGTATTATTGATTTAAATTTATGTCAACAAGTAGATGCTGGATTGACATTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACAAAAAAGAGTTTGAAAACAGCTACATTTTTGATATCAACACTATTGACCGGATTTTCTACTTGGTAGCAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGCGAGGAGGAGATGAATAAGTGGGTTCGTTGTATTTGTGACATCTGTGGGTTTAATCCAACAGAAGAAGATC  370
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------ATGAATAAGTGGGTTCGTTGTATTTGTGACATCTGTGGGTTTAATCCAACAGAAGAAGATC  61

Query  371  CTGTGAAGCCACCTGGCAGCTCTTTACAAGCACCAGCTGATTTACCTTTAGCTATAAATACAGCACCACCATCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   62  CTGTGAAGCCACCTGGCAGCTCTTTACAAGCACCAGCTGATTTACCTTTAGCTATAAATACAGCACCACCATCC  135

Query  445  ACCCAGGCAGATTCATCCTCTGCTACTCTACCTCCTCCATATCAGCTAATCAATGTTCCACCACACCTGGAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  ACCCAGGCAGATTCATCCTCTGCTACTCTACCTCCTCCATATCAGCTAATCAATGTTCCACCACACCTGGAAAC  209

Query  519  TCTTGGCATTCAGGAGGATCCTCAAGACTACCTGTTGCTCATCAACTGTCAAAGCAAGAAGCCCGAACCCACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  TCTTGGCATTCAGGAGGATCCTCAAGACTACCTGTTGCTCATCAACTGTCAAAGCAAGAAGCCCGAACCCACCA  283

Query  593  G-------------------------------------------------------------------------  593
            |                                                                         
Sbjct  284  GCCAAGGGTCATCTTTTGTTTCTGAAGAAGGAGAGGAATACCTTCTACTAGAAGATTTTGAAAGCAAAACGATT  357

Query  594  --------AACGCATGCTGATTCTGCAAAATCCACCTCTTCTGAAACAGACTGCAATGATAACGTCCCTTCTCA  659
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  CCATTGCAAACGCATGCTGATTCTGCAAAATCCACCTCTTCTGAAACAGACTGCAATGATAACGTCCCTTCTCA  431

Query  660  TAAAAATCCTGCTTCCTCCCAGAGCAAACATGGAATGAATGGCTTTTTTCAGCAGCAAATGATATACGACTCTC  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  TAAAAATCCTGCTTCCTCCCAGAGCAAACATGGAATGAATGGCTTTTTTCAGCAGCAAATGATATACGACTCTC  505

Query  734  CACCTTCACGTGCCCCATCTGCTTCAGTTGACTCCAGCCTTTATAACCTGCCCAGGAGTTATTCCCATGATGTT  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  CACCTTCACGTGCCCCATCTGCTTCAGTTGACTCCAGCCTTTATAACCTGCCCAGGAGTTATTCCCATGATGTT  579

Query  808  TTACCAAAGGTGTCTCCATCAAGTACTGAAGCAGATGGAGAACTCTATGTTTTTAATACCCCATCTGGGACATC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  TTACCAAAGGTGTCTCCATCAAGTACTGAAGCAGATGGAGAACTCTATGTTTTTAATACCCCATCTGGGACATC  653

Query  882  GAGTGTAGAGACTCAAATGAGGCATGTATCTATTAGTTATGACATTCCTCCAACACCTGGTAATACTTATCAGA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  GAGTGTAGAGACTCAAATGAGGCATGTATCTATTAGTTATGACATTCCTCCAACACCTGGTAATACTTATCAGA  727

Query  956  TTCCACGAACATTTCCAGAAGGAACCTTGGGACAGACATCAAAGCTAGACACTATTCCAGATATTCCTCCACCT  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  TTCCACGAACATTTCCAGAAGGAACCTTGGGACAGACATCAAAGCTAGACACTATTCCAGATATTCCTCCACCT  801

Query 1030  CGGCCACCGAAACCACATCCAGCTCATGACCGATCTCCTGTGGAAACGTGTAGTATCCCACGCACCGCCTCAGA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  CGGCCACCGAAACCACATCCAGCTCATGACCGATCTCCTGTGGAAACGTGTAGTATCCCACGCACCGCCTCAGA  875

Query 1104  CACTGACAGTAGTTACTGTATCCCTACAGCAGGGATGTCGCCTTCACGTAGTAATACCATTTCCACTGTGGATT  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  CACTGACAGTAGTTACTGTATCCCTACAGCAGGGATGTCGCCTTCACGTAGTAATACCATTTCCACTGTGGATT  949

Query 1178  TAAACAAATTGCGAAAAGATGCTAGTTCTCAAGACTGCTATGATATTCCACGAGCATTTCCAAGTGATAGATCT  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  TAAACAAATTGCGAAAAGATGCTAGTTCTCAAGACTGCTATGATATTCCACGAGCATTTCCAAGTGATAGATCT  1023

Query 1252  AGTTCACTTGAAGGCTTCCATAACCACTTTAAAGTCAAAAATGTGTTGACAGTGGGAAGTGTTTCAAGTGAAGA  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  AGTTCACTTGAAGGCTTCCATAACCACTTTAAAGTCAAAAATGTGTTGACAGTGGGAAGTGTTTCAAGTGAAGA  1097

Query 1326  ACTGGATGAAAATTACGTCCCAATGAATCCCAATTCACCACCACGACAACATTCCAGCAGTTTTACAGAACCAA  1399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  ACTGGATGAAAATTACGTCCCAATGAATCCCAATTCACCACCACGACAACATTCCAGCAGTTTTACAGAACCAA  1171

Query 1400  TTCAGGAAGCAAATTATGTGCCAATGACTCCAGGAACATTTGATTTTTCCTCATTTGGAATGCAAGTTCCTCCT  1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  TTCAGGAAGCAAATTATGTGCCAATGACTCCAGGAACATTTGATTTTTCCTCATTTGGAATGCAAGTTCCTCCT  1245

Query 1474  CCTGCTCATATGGGCTTCAGGTCCAGCCCAAAAACCCCTCCCAGAAGGCCAGTTCCTGTTGCAGACTGTGAACC  1547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246  CCTGCTCATATGGGCTTCAGGTCCAGCCCAAAAACCCCTCCCAGAAGGCCAGTTCCTGTTGCAGACTGTGAACC  1319

Query 1548  ACCCCCCGTGGATAGGAACCTCAAGCCAGACAGAAAAGGTCAAAGTCCTAAAATTTTAAGACTCAAACCCCATG  1621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320  ACCCCCCGTGGATAGGAACCTCAAGCCAGACAGAAAAGGTCAAAGTCCTAAAATTTTAAGACTCAAACCCCATG  1393

Query 1622  GTTTAGAGCGAACTGATTCACAAACCATAGGTGACTTTGCTACAAGAAGAAAGGTCAAGCCAGCGCCTTTAGAA  1695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394  GTTTAGAGCGAACTGATTCACAAACCATAGGTGACTTTGCTACAAGAAGAAAGGTCAAGCCAGCGCCTTTAGAA  1467

Query 1696  ATAAAACCTTTGCCAGAATGGGAAGAATTACAAGCCCCAGTTAGATCTCCCATCACTAGGAGTTTTGCTCGAGA  1769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468  ATAAAACCTTTGCCAGAATGGGAAGAATTACAAGCCCCAGTTAGATCTCCCATCACTAGGAGTTTTGCTCGAGA  1541

Query 1770  CTCTTCCAGGTTTCCCATGTCCCCCCGACCAGATTCAGTGCATAGCACAACTTCAAGCAGTGACTCACACGACA  1843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542  CTCTTCCAGGTTTCCCATGTCCCCCCGACCAGATTCAGTGCATAGCACAACTTCAAGCAGTGACTCACACGACA  1615

Query 1844  GTGAAGAGAATTATGTTCCCATGAACCCAAACCTGTCCAGTGAAGACCCAAATCTCTTTGGCAGTAACAGTCTT  1917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616  GTGAAGAGAATTATGTTCCCATGAACCCAAACCTGTCCAGTGAAGACCCAAATCTCTTTGGCAGTAACAGTCTT  1689

Query 1918  GATGGAGGAAGCAGCCCTATGATCAAGCCCAAAGGAGACAAACAGGTGGAATACTTAGATCTCGACTTAGATTC  1991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  GATGGAGGAAGCAGCCCTATGATCAAGCCCAAAGGAGACAAACAGGTGGAATACTTAGATCTCGACTTAGATTC  1763

Query 1992  TGGGAAATCCACACCACCACGTAAGCAAAAGAGCAGTGGCTCAGGCAGCAGTGTAGCAGATGAGAGAGTGGATT  2065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764  TGGGAAATCCACACCACCACGTAAGCAAAAGAGCAGTGGCTCAGGCAGCAGTGTAGCAGATGAGAGAGTGGATT  1837

Query 2066  ATGTTGTTGTTGACCAACAGAAGACCTTGGCTCTAAAGAGTACCCGGGAAGCCTGGACAGATGGGAGACAGTCC  2139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838  ATGTTGTTGTTGACCAACAGAAGACCTTGGCTCTAAAGAGTACCCGGGAAGCCTGGACAGATGGGAGACAGTCC  1911

Query 2140  ACAGAATCAGAAACGCCAGCGAAGAGTGTGAAA  2172
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912  ACAGAATCAGAAACGCCAGCGAAGAGTGTGAAA  1944