Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00605
• Subject: XM_017007968.1
• Aligned Length: 2172
• Identities: 2125
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGAGCGGTGGTGAAGTGGTCTGCTCCGGATGGCTCCGCAAGTCCCCCCCGGAGAAAAAGTTGAAGCGTTATGC  74
            |||||       |||         .||..||  ||...|||          ||.|||||           |.||
Sbjct    1  ATGAG-------GAA---------ACCTCAT--CTTTACAA----------GAAAAAAA-----------AAGC  35

Query   75  ATGGAAGAGGAGATGGTTCGTGTTACGCAGTGGCCGTTTAACTGGAGATCCAGATGTTTTGGAATATTACAAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   36  ATGGAAGAGGAGATGGTTCGTGTTACGCAGTGGCCGTTTAACTGGAGATCCAGATGTTTTGGAATATTACAAAA  109

Query  149  ATGATCATGCCAAGAAGCCTATTCGTATTATTGATTTAAATTTATGTCAACAAGTAGATGCTGGATTGACATTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  110  ATGATCATGCCAAGAAGCCTATTCGTATTATTGATTTAAATTTATGTCAACAAGTAGATGCTGGATTGACATTT  183

Query  223  AACAAAAAAGAGTTTGAAAACAGCTACATTTTTGATATCAACACTATTGACCGGATTTTCTACTTGGTAGCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  184  AACAAAAAAGAGTTTGAAAACAGCTACATTTTTGATATCAACACTATTGACCGGATTTTCTACTTGGTAGCAGA  257

Query  297  CAGCGAGGAGGAGATGAATAAGTGGGTTCGTTGTATTTGTGACATCTGTGGGTTTAATCCAACAGAAGAAGATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258  CAGCGAGGAGGAGATGAATAAGTGGGTTCGTTGTATTTGTGACATCTGTGGGTTTAATCCAACAGAAGAAGATC  331

Query  371  CTGTGAAGCCACCTGGCAGCTCTTTACAAGCACCAGCTGATTTACCTTTAGCTATAAATACAGCACCACCATCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  332  CTGTGAAGCCACCTGGCAGCTCTTTACAAGCACCAGCTGATTTACCTTTAGCTATAAATACAGCACCACCATCC  405

Query  445  ACCCAGGCAGATTCATCCTCTGCTACTCTACCTCCTCCATATCAGCTAATCAATGTTCCACCACACCTGGAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  ACCCAGGCAGATTCATCCTCTGCTACTCTACCTCCTCCATATCAGCTAATCAATGTTCCACCACACCTGGAAAC  479

Query  519  TCTTGGCATTCAGGAGGATCCTCAAGACTACCTGTTGCTCATCAACTGTCAAAGCAAGAAGCCCGAACCCACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  TCTTGGCATTCAGGAGGATCCTCAAGACTACCTGTTGCTCATCAACTGTCAAAGCAAGAAGCCCGAACCCACCA  553

Query  593  GAACGCATGCTGATTCTGCAAAATCCACCTCTTCTGAAACAGACTGCAATGATAACGTCCCTTCTCATAAAAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  554  GAACGCATGCTGATTCTGCAAAATCCACCTCTTCTGAAACAGACTGCAATGATAACGTCCCTTCTCATAAAAAT  627

Query  667  CCTGCTTCCTCCCAGAGCAAACATGGAATGAATGGCTTTTTTCAGCAGCAAATGATATACGACTCTCCACCTTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  CCTGCTTCCTCCCAGAGCAAACATGGAATGAATGGCTTTTTTCAGCAGCAAATGATATACGACTCTCCACCTTC  701

Query  741  ACGTGCCCCATCTGCTTCAGTTGACTCCAGCCTTTATAACCTGCCCAGGAGTTATTCCCATGATGTTTTACCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  ACGTGCCCCATCTGCTTCAGTTGACTCCAGCCTTTATAACCTGCCCAGGAGTTATTCCCATGATGTTTTACCAA  775

Query  815  AGGTGTCTCCATCAAGTACTGAAGCAGATGGAGAACTCTATGTTTTTAATACCCCATCTGGGACATCGAGTGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  776  AGGTGTCTCCATCAAGTACTGAAGCAGATGGAGAACTCTATGTTTTTAATACCCCATCTGGGACATCGAGTGTA  849

Query  889  GAGACTCAAATGAGGCATGTATCTATTAGTTATGACATTCCTCCAACACCTGGTAATACTTATCAGATTCCACG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850  GAGACTCAAATGAGGCATGTATCTATTAGTTATGACATTCCTCCAACACCTGGTAATACTTATCAGATTCCACG  923

Query  963  AACATTTCCAGAAGGAACCTTGGGACAGACATCAAAGCTAGACACTATTCCAGATATTCCTCCACCTCGGCCAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  AACATTTCCAGAAGGAACCTTGGGACAGACATCAAAGCTAGACACTATTCCAGATATTCCTCCACCTCGGCCAC  997

Query 1037  CGAAACCACATCCAGCTCATGACCGATCTCCTGTGGAAACGTGTAGTATCCCACGCACCGCCTCAGACACTGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  CGAAACCACATCCAGCTCATGACCGATCTCCTGTGGAAACGTGTAGTATCCCACGCACCGCCTCAGACACTGAC  1071

Query 1111  AGTAGTTACTGTATCCCTACAGCAGGGATGTCGCCTTCACGTAGTAATACCATTTCCACTGTGGATTTAAACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072  AGTAGTTACTGTATCCCTACAGCAGGGATGTCGCCTTCACGTAGTAATACCATTTCCACTGTGGATTTAAACAA  1145

Query 1185  ATTGCGAAAAGATGCTAGTTCTCAAGACTGCTATGATATTCCACGAGCATTTCCAAGTGATAGATCTAGTTCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146  ATTGCGAAAAGATGCTAGTTCTCAAGACTGCTATGATATTCCACGAGCATTTCCAAGTGATAGATCTAGTTCAC  1219

Query 1259  TTGAAGGCTTCCATAACCACTTTAAAGTCAAAAATGTGTTGACAGTGGGAAGTGTTTCAAGTGAAGAACTGGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220  TTGAAGGCTTCCATAACCACTTTAAAGTCAAAAATGTGTTGACAGTGGGAAGTGTTTCAAGTGAAGAACTGGAT  1293

Query 1333  GAAAATTACGTCCCAATGAATCCCAATTCACCACCACGACAACATTCCAGCAGTTTTACAGAACCAATTCAGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294  GAAAATTACGTCCCAATGAATCCCAATTCACCACCACGACAACATTCCAGCAGTTTTACAGAACCAATTCAGGA  1367

Query 1407  AGCAAATTATGTGCCAATGACTCCAGGAACATTTGATTTTTCCTCATTTGGAATGCAAGTTCCTCCTCCTGCTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368  AGCAAATTATGTGCCAATGACTCCAGGAACATTTGATTTTTCCTCATTTGGAATGCAAGTTCCTCCTCCTGCTC  1441

Query 1481  ATATGGGCTTCAGGTCCAGCCCAAAAACCCCTCCCAGAAGGCCAGTTCCTGTTGCAGACTGTGAACCACCCCCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442  ATATGGGCTTCAGGTCCAGCCCAAAAACCCCTCCCAGAAGGCCAGTTCCTGTTGCAGACTGTGAACCACCCCCC  1515

Query 1555  GTGGATAGGAACCTCAAGCCAGACAGAAAAGGTCAAAGTCCTAAAATTTTAAGACTCAAACCCCATGGTTTAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516  GTGGATAGGAACCTCAAGCCAGACAGAAAAGGTCAAAGTCCTAAAATTTTAAGACTCAAACCCCATGGTTTAGA  1589

Query 1629  GCGAACTGATTCACAAACCATAGGTGACTTTGCTACAAGAAGAAAGGTCAAGCCAGCGCCTTTAGAAATAAAAC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1590  GCGAACTGATTCACAAACCATAGGTGACTTTGCTACAAGAAGAAAGGTCAAGCCAGCGCCTTTAGAAATAAAAC  1663

Query 1703  CTTTGCCAGAATGGGAAGAATTACAAGCCCCAGTTAGATCTCCCATCACTAGGAGTTTTGCTCGAGACTCTTCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664  CTTTGCCAGAATGGGAAGAATTACAAGCCCCAGTTAGATCTCCCATCACTAGGAGTTTTGCTCGAGACTCTTCC  1737

Query 1777  AGGTTTCCCATGTCCCCCCGACCAGATTCAGTGCATAGCACAACTTCAAGCAGTGACTCACACGACAGTGAAGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738  AGGTTTCCCATGTCCCCCCGACCAGATTCAGTGCATAGCACAACTTCAAGCAGTGACTCACACGACAGTGAAGA  1811

Query 1851  GAATTATGTTCCCATGAACCCAAACCTGTCCAGTGAAGACCCAAATCTCTTTGGCAGTAACAGTCTTGATGGAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812  GAATTATGTTCCCATGAACCCAAACCTGTCCAGTGAAGACCCAAATCTCTTTGGCAGTAACAGTCTTGATGGAG  1885

Query 1925  GAAGCAGCCCTATGATCAAGCCCAAAGGAGACAAACAGGTGGAATACTTAGATCTCGACTTAGATTCTGGGAAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886  GAAGCAGCCCTATGATCAAGCCCAAAGGAGACAAACAGGTGGAATACTTAGATCTCGACTTAGATTCTGGGAAA  1959

Query 1999  TCCACACCACCACGTAAGCAAAAGAGCAGTGGCTCAGGCAGCAGTGTAGCAGATGAGAGAGTGGATTATGTTGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1960  TCCACACCACCACGTAAGCAAAAGAGCAGTGGCTCAGGCAGCAGTGTAGCAGATGAGAGAGTGGATTATGTTGT  2033

Query 2073  TGTTGACCAACAGAAGACCTTGGCTCTAAAGAGTACCCGGGAAGCCTGGACAGATGGGAGACAGTCCACAGAAT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034  TGTTGACCAACAGAAGACCTTGGCTCTAAAGAGTACCCGGGAAGCCTGGACAGATGGGAGACAGTCCACAGAAT  2107

Query 2147  CAGAAACGCCAGCGAAGAGTGTGAAA  2172
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2108  CAGAAACGCCAGCGAAGAGTGTGAAA  2133