Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00624
• Subject: NM_001287386.1
• Aligned Length: 1404
• Identities: 1227
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  AT-GCTG----GACGACAGAGCCAGGA-TGGAGGCCGCCAAGAAGGAGA---AGGTAGAGCAGATCCTGGCAGA  65
            || ||||    .||.|||     |||| .|||    |||.||..|..||   .|||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGTGGATACTACA-----AGGAGGGGA----GCCCAGTCGTTGACTCTGGTAGAGCAGATCCTGGCAGA  65

Query   66  GTTCCAGCTGCAGGAGGAGGACCTGAAGAAGGTGATGAGACGGATGCAGAAGGAGATGGACCGCGGCCTGAGGC  139
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct   66  GTTCCAGCTGCAGGAGGAAGACCTGAAGAAGGTGATGAGCCGGATGCAGAAGGAGATGGACCGTGGCCTGAAGC  139

Query  140  TGGAGACCCATGAAGAGGCCAGTGTGAAGATGCTGCCCACCTACGTGCGCTCCACCCCAGAAGGCTCAGAAGTC  213
            |||||||||||.|.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  140  TGGAGACCCATCAGGAGGCCAGTGTAAAGATGTTGCCCACCTACGTGCGTTCCACCCCAGAAGGCTCAGAAGTT  213

Query  214  GGGGACTTCCTCTCCCTGGACCTGGGTGGCACTAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAGGTGGGAGAAGGTGAGGA  287
            ||.|||||.||||||.|.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||.
Sbjct  214  GGAGACTTTCTCTCCTTAGACCTGGGAGGAACCAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAAGTGGGGGAGGGGGAGGC  287

Query  288  GGGGCAGTGGAGCGTGAAGACCAAACACCAGATGTACTCCATCCCCGAGGACGCCATGACCGGCACTGCTGAGA  361
            .||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  288  AGGACAGTGGAGCGTGAAGACGAAACACCAGATGTATTCCATCCCCGAGGACGCCATGACGGGCACTGCGGAGA  361

Query  362  TGCTCTTCGACTACATCTCTGAGTGCATCTCCGACTTCCTGGACAAGCATCAGATGAAACACAAGAAGCTGCCC  435
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  362  TGCTCTTTGACTACATCTCTGAGTGCATCTCTGACTTCCTGGACAAGCATCAGATGAAACACAAGAAACTACCC  435

Query  436  CTGGGCTTCACCTTCTCCTTTCCTGTGAGGCACGAAGACATCGATAAGGGCATCCTTCTCAACTGGACCAAGGG  509
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  436  CTGGGCTTCACCTTCTCCTTCCCTGTAAGGCACGAAGACATAGACAAGGGCATCCTGCTCAACTGGACCAAGGG  509

Query  510  CTTCAAGGCCTCAGGAGCAGAAGGGAACAATGTCGTGGGGCTTCTGCGAGACGCTATCAAACGGAGAGGGGACT  583
            ||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||.||||||||..||||||||||||
Sbjct  510  CTTCAAGGCCTCCGGAGCAGAAGGGAACAACATCGTGGGACTTCTCCGAGATGCTATCAAGAGGAGAGGGGACT  583

Query  584  TTGAAATGGATGTGGTGGCAATGGTGAATGACACGGTGGCCACGATGATCTCCTGCTACTACGAAGACCATCAG  657
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||..||.
Sbjct  584  TTGAGATGGATGTGGTGGCAATGGTGAATGACACGGTGGCCACAATGATCTCCTGCTACTATGAAGACCGCCAA  657

Query  658  TGCGAGGTCGGCATGATCGTGGGCACGGGCTGCAATGCCTGCTACATGGAGGAGATGCAGAATGTGGAGCTGGT  731
            ||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  TGTGAGGTCGGCATGATTGTGGGCACCGGCTGCAACGCCTGCTACATGGAGGAGATGCAGAATGTGGAGCTGGT  731

Query  732  GGAGGGGGACGAGGGCCGCATGTGCGTCAATACCGAGTGGGGCGCCTTCGGGGACTCCGGCGAGCTGGACGAGT  805
            |||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct  732  GGAAGGCGATGAGGGGCGCATGTGTGTCAACACAGAGTGGGGCGCCTTCGGGAACTCCGGTGAGCTGGACGAGT  805

Query  806  TCCTGCTGGAGTATGACCGCCTGGTGGACGAGAGCTCTGCAAACCCCGGTCAGCAGCTGTATGAGAAGCTCATA  879
            ||||.||||||||.|||||..|||||||.||||||||.|..||||||||||||||||||||.||.|||.||||.
Sbjct  806  TCCTCCTGGAGTACGACCGGATGGTGGATGAGAGCTCAGTGAACCCCGGTCAGCAGCTGTACGAAAAGATCATT  879

Query  880  GGTGGCAAGTACATGGGCGAGCTGGTGCGGCTTGTGCTGCTCAGGCTCGTGGACGAAAACCTGCTCTTCCACGG  953
            ||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||.||.||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct  880  GGCGGAAAGTACATGGGCGAGCTGGTACGACTTGTGCTGCTCAAGCTGGTAGAGGAGAATCTTCTGTTCCACGG  953

Query  954  GGAGGCCTCCGAGCAGCTGCGCACACGCGGAGCCTTCGAGACGCGCTTCGTGTCGCAGGTGGAGAGCGACACGG  1027
            .||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|.|
Sbjct  954  AGAGGCCTCAGAGCAGCTGCGCACACGTGGTGCTTTTGAGACCCGTTTTGTGTCGCAGGTGGAGAGCGACTCTG  1027

Query 1028  GCGACCGCAAGCAGATCTACAACATCCTGAGCACGCTGGGGCTGCGACCCTCGACCACCGACTGCGACATCGTG  1101
            |.|||||.|.|||||||...||||||||||||||.|||||.||.||||||||...|.|||||||||||||.|||
Sbjct 1028  GGGACCGAAGGCAGATCCTTAACATCCTGAGCACTCTGGGCCTTCGACCCTCTGTCGCCGACTGCGACATTGTG  1101

Query 1102  CGCCGCGCCTGCGAGAGCGTGTCTACGCGCGCTGCGCACATGTGCTCGGCGGGGCTGGCGGGCGTCATCAACCG  1175
            |||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 1102  CGCCGTGCCTGTGAAAGCGTGTCCACTCGCGCCGCCCACATGTGCTCAGCAGGACTAGCGGGGGTCATAAATCG  1175

Query 1176  CATGCGCGAGAGCCGCAGCGAGGACGTAATGCGCATCACTGTGGGCGTGGATGGCTCCGTGTACAAGCTGCACC  1249
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  CATGCGCGAAAGCCGCAGTGAGGACGTGATGCGCATCACGGTGGGCGTGGATGGCTCCGTGTACAAGCTGCACC  1249

Query 1250  CCAGCTTCAAGGAGCGGTTCCATGCCAGCGTGCGCAGGCTGACGCCCAGCTGCGAGATCACCTTCATCGAGTCG  1323
            |.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1250  CGAGCTTCAAGGAGCGGTTTCACGCCAGTGTGCGCAGGCTGACACCCAACTGCGAAATCACCTTCATTGAATCA  1323

Query 1324  GAGGAGGGCAGTGGCCGGGGCGCGGCCCTGGTCTCGGCGGTGGCCTGTAAGAAGGCCTGTATGCTGGGCCAG  1395
            |||||||||||.|||.||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1324  GAGGAGGGCAGCGGCAGGGGAGCCGCACTGGTCTCTGCGGTGGCCTGCAAGAAGGCTTGCATGCTGGGCCAG  1395