Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00624
• Subject: NM_033507.3
• Aligned Length: 1408
• Identities: 1377
• Gaps: 23

Alignment

Query    1  AT---GCTGGACGACA----GAGCCAGGATGGAGGCCGCCAAGAAGG---AGA---AGGTAGAGCAGATCCTGG  61
            ||   |.||||.|.||    |||||||          |||.|||..|   .||   .|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGATGGATGTCACAAGGAGCCAG----------GCCCAGACAGCCTTGACTCTGGTAGAGCAGATCCTGG  64

Query   62  CAGAGTTCCAGCTGCAGGAGGAGGACCTGAAGAAGGTGATGAGACGGATGCAGAAGGAGATGGACCGCGGCCTG  135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  CAGAGTTCCAGCTGCAGGAGGAGGACCTGAAGAAGGTGATGAGACGGATGCAGAAGGAGATGGACCGCGGCCTG  138

Query  136  AGGCTGGAGACCCATGAAGAGGCCAGTGTGAAGATGCTGCCCACCTACGTGCGCTCCACCCCAGAAGGCTCAGA  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  AGGCTGGAGACCCATGAAGAGGCCAGTGTGAAGATGCTGCCCACCTACGTGCGCTCCACCCCAGAAGGCTCAGA  212

Query  210  AGTCGGGGACTTCCTCTCCCTGGACCTGGGTGGCACTAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAGGTGGGAGAAGGTG  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  AGTCGGGGACTTCCTCTCCCTGGACCTGGGTGGCACTAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAGGTGGGAGAAGGTG  286

Query  284  AGGAGGGGCAGTGGAGCGTGAAGACCAAACACCAGATGTACTCCATCCCCGAGGACGCCATGACCGGCACTGCT  357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  AGGAGGGGCAGTGGAGCGTGAAGACCAAACACCAGATGTACTCCATCCCCGAGGACGCCATGACCGGCACTGCT  360

Query  358  GAGATGCTCTTCGACTACATCTCTGAGTGCATCTCCGACTTCCTGGACAAGCATCAGATGAAACACAAGAAGCT  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GAGATGCTCTTCGACTACATCTCTGAGTGCATCTCCGACTTCCTGGACAAGCATCAGATGAAACACAAGAAGCT  434

Query  432  GCCCCTGGGCTTCACCTTCTCCTTTCCTGTGAGGCACGAAGACATCGATAAGGGCATCCTTCTCAACTGGACCA  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  GCCCCTGGGCTTCACCTTCTCCTTTCCTGTGAGGCACGAAGACATCGATAAGGGCATCCTTCTCAACTGGACCA  508

Query  506  AGGGCTTCAAGGCCTCAGGAGCAGAAGGGAACAATGTCGTGGGGCTTCTGCGAGACGCTATCAAACGGAGAGGG  579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  AGGGCTTCAAGGCCTCAGGAGCAGAAGGGAACAATGTCGTGGGGCTTCTGCGAGACGCTATCAAACGGAGAGGG  582

Query  580  GACTTTGAAATGGATGTGGTGGCAATGGTGAATGACACGGTGGCCACGATGATCTCCTGCTACTACGAAGACCA  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  GACTTTGAAATGGATGTGGTGGCAATGGTGAATGACACGGTGGCCACGATGATCTCCTGCTACTACGAAGACCA  656

Query  654  TCAGTGCGAGGTCGGCATGATCGTGGGCACGGGCTGCAATGCCTGCTACATGGAGGAGATGCAGAATGTGGAGC  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  TCAGTGCGAGGTCGGCATGATCGTGGGCACGGGCTGCAATGCCTGCTACATGGAGGAGATGCAGAATGTGGAGC  730

Query  728  TGGTGGAGGGGGACGAGGGCCGCATGTGCGTCAATACCGAGTGGGGCGCCTTCGGGGACTCCGGCGAGCTGGAC  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  TGGTGGAGGGGGACGAGGGCCGCATGTGCGTCAATACCGAGTGGGGCGCCTTCGGGGACTCCGGCGAGCTGGAC  804

Query  802  GAGTTCCTGCTGGAGTATGACCGCCTGGTGGACGAGAGCTCTGCAAACCCCGGTCAGCAGCTGTATGAGAAGCT  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  GAGTTCCTGCTGGAGTATGACCGCCTGGTGGACGAGAGCTCTGCAAACCCCGGTCAGCAGCTGTATGAGAAGCT  878

Query  876  CATAGGTGGCAAGTACATGGGCGAGCTGGTGCGGCTTGTGCTGCTCAGGCTCGTGGACGAAAACCTGCTCTTCC  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  CATAGGTGGCAAGTACATGGGCGAGCTGGTGCGGCTTGTGCTGCTCAGGCTCGTGGACGAAAACCTGCTCTTCC  952

Query  950  ACGGGGAGGCCTCCGAGCAGCTGCGCACACGCGGAGCCTTCGAGACGCGCTTCGTGTCGCAGGTGGAGAGCGAC  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  ACGGGGAGGCCTCCGAGCAGCTGCGCACACGCGGAGCCTTCGAGACGCGCTTCGTGTCGCAGGTGGAGAGCGAC  1026

Query 1024  ACGGGCGACCGCAAGCAGATCTACAACATCCTGAGCACGCTGGGGCTGCGACCCTCGACCACCGACTGCGACAT  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  ACGGGCGACCGCAAGCAGATCTACAACATCCTGAGCACGCTGGGGCTGCGACCCTCGACCACCGACTGCGACAT  1100

Query 1098  CGTGCGCCGCGCCTGCGAGAGCGTGTCTACGCGCGCTGCGCACATGTGCTCGGCGGGGCTGGCGGGCGTCATCA  1171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  CGTGCGCCGCGCCTGCGAGAGCGTGTCTACGCGCGCTGCGCACATGTGCTCGGCGGGGCTGGCGGGCGTCATCA  1174

Query 1172  ACCGCATGCGCGAGAGCCGCAGCGAGGACGTAATGCGCATCACTGTGGGCGTGGATGGCTCCGTGTACAAGCTG  1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  ACCGCATGCGCGAGAGCCGCAGCGAGGACGTAATGCGCATCACTGTGGGCGTGGATGGCTCCGTGTACAAGCTG  1248

Query 1246  CACCCCAGCTTCAAGGAGCGGTTCCATGCCAGCGTGCGCAGGCTGACGCCCAGCTGCGAGATCACCTTCATCGA  1319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  CACCCCAGCTTCAAGGAGCGGTTCCATGCCAGCGTGCGCAGGCTGACGCCCAGCTGCGAGATCACCTTCATCGA  1322

Query 1320  GTCGGAGGAGGGCAGTGGCCGGGGCGCGGCCCTGGTCTCGGCGGTGGCCTGTAAGAAGGCCTGTATGCTGGGCC  1393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  GTCGGAGGAGGGCAGTGGCCGGGGCGCGGCCCTGGTCTCGGCGGTGGCCTGTAAGAAGGCCTGTATGCTGGGCC  1396

Query 1394  AG  1395
            ||
Sbjct 1397  AG  1398