Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00624
• Subject: XM_006514444.1
• Aligned Length: 1540
• Identities: 1175
• Gaps: 224

Alignment

Query    1  ATGCTGGACGACAGAGCCAGGATGGAGGCCGCCAAGAAGGAGAAGGTAGAGCAGATCCTGGCAGAGTTCCAGCT  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGGATGACAGAGCCAGGATGGAGGCCACCAAGAAGGAAAAGGTAGAGCAGATCCTGGCAGAGTTCCAGCT  74

Query   75  GCAGGAGGAGGACCTGAAGAAGGTGATGAGACGGATGCAGAAGGAGATGGACCGCGGCCTGAGGCTGGAGACCC  148
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct   75  GCAGGAGGAAGACCTGAAGAAGGTGATGAGCCGGATGCAGAAGGAGATGGACCGTGGCCTGAAGCTGGAGACCC  148

Query  149  ATGAAGAGGCCAGTGTGAAGATGCTGCCCACCTACGTGCGCTCCACCCCAGAAGGCTCAGAAGTCGGGGACTTC  222
            ||.|.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  149  ATCAGGAGGCCAGTGTAAAGATGTTGCCCACCTACGTGCGTTCCACCCCAGAAGGCTCAGAAGTTGGAGACTTT  222

Query  223  CTCTCCCTGGACCTGGGTGGCACTAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAGGTGGGAGAAGGTGAGGAGGGGCAGTG  296
            ||||||.|.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||..||.|||||
Sbjct  223  CTCTCCTTAGACCTGGGAGGAACCAACTTCAGGGTGATGCTGGTGAAAGTGGGGGAGGGGGAGGCAGGACAGTG  296

Query  297  GAGCGTGAAGACCAAACACCAGATGTACTCCATCCCCGAGGACGCCATGACCGGCACTGCTGAGATGCTCTTCG  370
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  297  GAGCGTGAAGACGAAACACCAGATGTATTCCATCCCCGAGGACGCCATGACGGGCACTGCGGAGATGCTCTTTG  370

Query  371  ACTACATCTCTGAGTGCATCTCCGACTTCCTGGACAAGCATCAGATGAAACACAAGAAGCTGCCCCTGGGCTTC  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  371  ACTACATCTCTGAGTGCATCTCTGACTTCCTGGACAAGCATCAGATGAAACACAAGAAACTACCCCTGGGCTTC  444

Query  445  ACCTTCTCCTTTCCTGTGAGGCACGAAGACATCGATAAGGGCATCCTTCTCAACTGGACCAAGGGCTTCAAGGC  518
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCTTCTCCTTCCCTGTAAGGCACGAAGACATAGACAAGGGCATCCTGCTCAACTGGACCAAGGGCTTCAAGGC  518

Query  519  CTCAGGAGCAGAAGGGAACAATGTCGTGGGGCTTCTGCGAGACGCTATCAAACGGAGAGGGGACTTTGAAATGG  592
            |||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||.||||||||..||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  CTCCGGAGCAGAAGGGAACAACATCGTGGGACTTCTCCGAGATGCTATCAAGAGGAGAGGGGACTTTGAGATGG  592

Query  593  ATGTGGTGGCAATGGTGAATGACACGGTGGCCACGATGATCTCCTGCTACTACGAAGACCATCAGTGCGAGGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||..||.||.||||||
Sbjct  593  ATGTGGTGGCAATGGTGAATGACACGGTGGCCACAATGATCTCCTGCTACTATGAAGACCGCCAATGTGAGGTC  666

Query  667  GGCATGATCGTGGGCACGGGCTGCAATGCCTGCTACATGGAGGAGATGCAGAATGTGGAGCTGGTGGAGGGGGA  740
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  667  GGCATGATTGTGGGCACCGGCTGCAACGCCTGCTACATGGAGGAGATGCAGAATGTGGAGCTGGTGGAAGGCGA  740

Query  741  CGAGGGCCGCATGTGCGTCAATACCGAGTGGGGCGCCTTCGGGGACTCCGGCGAGCTGGACGAGTTCCTGCTGG  814
            .|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  TGAGGGGCGCATGTGTGTCAACACAGAGTGGGGCGCCTTCGGGAACTCCGGTGAGCTGGACGAGTTCCTCCTGG  814

Query  815  AGTATGACCGCCTGGTGGACGAGAGCTCTGCAAACCCCGGTCAGCAGCTGTATGAGAAGCTCATAGGTGGCAAG  888
            ||||.|||||..|||||||.||||||||.|..||||||||||||||||||||.||.|||.||||.||.||.|||
Sbjct  815  AGTACGACCGGATGGTGGATGAGAGCTCAGTGAACCCCGGTCAGCAGCTGTACGAAAAGATCATTGGCGGAAAG  888

Query  889  TACATGGGCGAGCTGGTGCGGCTTGTGCTGCTCAGGCTCGTGGACGAAAACCTGCTCTTCCACGGGGAGGCCTC  962
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||.||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  889  TACATGGGCGAGCTGGTACGACTTGTGCTGCTCAAGCTGGTAGAGGAGAATCTTCTGTTCCACGGAGAGGCCTC  962

Query  963  CGAGCAGCTGCGCACACGCGGAGCCTTCGAGACGCGCTTCGTGTCGCAGGTGGAGAGCGACACGGGCGACCGCA  1036
            .|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||.|
Sbjct  963  AGAGCAGCTGCGCACACGTGGTGCTTTTGAGACCCGTTTTGTGTCGCAGGTGGAGAGCGACTCTGGGGACCGAA  1036

Query 1037  AGCAGATCTACAACATCCTGAGCACGCTGGGGCTGCGACCCTCGACCACCGACTGCGACATCGTGCGCCGCGCC  1110
            .|||||||...||||||||||||||.|||||.||.||||||||...|.|||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1037  GGCAGATCCTTAACATCCTGAGCACTCTGGGCCTTCGACCCTCTGTCGCCGACTGCGACATTGTGCGCCGTGCC  1110

Query 1111  TGCGAGAGCGTGTCTACGCGCGCTGCGCACATGTGCTCGGCGGGGCTGGCGGGCGTCATCAACCGCATGCGCGA  1184
            ||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1111  TGTGAAAGCGTGTCCACTCGCGCCGCCCACATGTGCTCAGCAGGACTAGCGGGGGTCATAAATCGCATGCGCGA  1184

Query 1185  GAGCCGCAGCGAGGACGTAATGCGCATCACTGTGGGCGTGGATGGCTCCGTGTACAAGCTGCACCCCA------  1252
            .||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|      
Sbjct 1185  AAGCCGCAGTGAGGACGTGATGCGCATCACGGTGGGCGTGGATGGCTCCGTGTACAAGCTGCACCCGAGGTCAG  1258

Query 1253  --------------------------------------------------------------------------  1252
                                                                                      
Sbjct 1259  CCTCCACCTTCGCTCGCGCTCCAACCTCCCGGGCTCCAAGGGAGGCTCCAAGGGCGCGGCTTTCAACTCCAGGC  1332

Query 1253  -----------------------------------------------------------------GCTTCAAGG  1261
                                                                             |||||||||
Sbjct 1333  TTTTGTGAGCCGATCCTGCTTGATTCTCCCTGGGCCTGGAATACTGAATATATACTGCAGTCTGGGCTTCAAGG  1406

Query 1262  AGCGGTTCCATGCCAGCGTGCGCAGGCTGACGCCCAGCTGCGAGATCACCTTCATCGAGTCGGAGGAGGGCAGT  1335
            |||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||                   
Sbjct 1407  AGCGGTTTCACGCCAGTGTGCGCAGGCTGACACCCAACTGCGAAATCACCTTCAT-------------------  1461

Query 1336  GGCCGGGGCGCGGCCCTGGTCTCGGCGGTGGCCTGTAAGAAGGCCTGTATGCTGGGCCAG  1395
                                                                        
Sbjct 1462  ------------------------------------------------------------  1461