Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00632
• Subject: NM_019802.5
• Aligned Length: 2286
• Identities: 1987
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGGCGGTGTCTGC----CGGGTCCGCGCGGACCTCGCCCAGCTCAGATAAAGTACAGAAAGACAAGGCTGAAC  70
            |||||    |.|||    |||.|||||.|.|....|.|||..|||||||||||||||||||.|||||.|||.||
Sbjct    1  ATGGC----TGTGCACCGCGGCTCCGCACTGGTTGCTCCCGCCTCAGATAAAGTACAGAAAAACAAGTCTGCAC  70

Query   71  TGATCTCAGGGCCCAGGCAGGACAGCCGAATAGGGAAACTCTTGGGTTTTGAGTGGACAGATTTGTCCAGTTGG  144
            .||..|||||.|..|..||||.|||||||||.|.||||.|.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct   71  AGACATCAGGACTGAAACAGGGCAGCCGAATGGAGAAAATTTTAGGGTTTGAATGGACAGATTTATCTAGCTGG  144

Query  145  CGGAGGCTGGTGACCCTGCTGAATCGACCAACGGACCCTGCAAGCTTAGCTGTCTTTCGTTTTCTTTTTGGGTT  218
            |.|||..|.|||||||||||.||...|||||||||||||||||.|.|.|||||||||||||||||.||||..||
Sbjct  145  CAGAGTGTCGTGACCCTGCTTAACAAACCAACGGACCCTGCAAACCTGGCTGTCTTTCGTTTTCTCTTTGCTTT  218

Query  219  CTTGATGGTGCTAGACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGCTCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATG  292
            |||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||
Sbjct  219  CTTGATGCTGCTGGACATTCCCCAGGAACGCGGCCTTAGCTCCCTGGACCGAAAATACTTGGATGGGCTGGATG  292

Query  293  TGTGCCGCTTCCCCTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCCACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATG  366
            |||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  TGTGCCGTTTCCCCTTGCTGGATGCCTTGCGCCCACTGCCACTGGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATG  366

Query  367  TTTCTGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACCGGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTG  440
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  367  TTTCTGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGGCTATGCTACCGGCTAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTACCGTACTG  440

Query  441  GTATGTGTTTCTCCTGGACAAGACATCATGGAACAACCACTCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAA  514
            |||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct  441  GTACGTGTTTCTCCTGGACAAGACTTCGTGGAACAATCACTCCTATCTGTATGGTTTGTTGGCCTTTCAGTTGA  514

Query  515  CATTCATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCTGCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCC  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||..|.||.||||||.|||||||||
Sbjct  515  CATTCATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGATGGCTTGCTGAATGCCCGAAAGAAGAATGCTCACGTGCCC  588

Query  589  CTTTGGAACTATGCAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTGTGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGC  662
            |||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  589  CTTTGGAACTACACAGTTCTGCGTGGCCAGATCTTCATCGTGTACTTCATCGCGGGTGTGAAGAAGCTCGATGC  662

Query  663  AGACTGGGTTGAAGGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGT  736
            .||||||||||..|||||.||||||||..|..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct  663  TGACTGGGTTGGGGGCTACTCCATGGAGCACCTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAGCTGGTGTTGT  736

Query  737  CTGAGGAGCTGACTAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGGGCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTC  810
            |.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  737  CGGAGGAGCTGACAAGCCTGCTGGTAGTACACTGGTGTGGGCTTCTCCTTGACCTCTCGGCTGGCTTCCTGCTC  810

Query  811  TTTTTTGATGTCTCAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGTCCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAG  884
            ||.|||||||.|||.|||.||.|.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  811  TTCTTTGATGCCTCCAGACCCGTCGGCCTGTTCTTCGTGTCCTACTTTCACTGCATGAACTCGCAGCTCTTCAG  884

Query  885  CATTGGTATGTTCTCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGG  958
            |||.||.|||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||.|||
Sbjct  885  CATCGGGATGTTTCCCTATGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCAGCTGAATGGCCTCGGAAGTTGG  958

Query  959  T-GTCCTACTGCCCCCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCCTCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGT  1031
            | |.||.| |||||...||||.|||||.|.|||.|||||..|||.||.||.||||.|||.||||.|||||||||
Sbjct  959  TAGCCCGA-TGCCCGAAAAGGCTGCAAGAGCTGCTGCCCACCAAAGCCGCTCCTCGGCCTAGTGCTTCCTGTGT  1031

Query 1032  GTATAAGAGGAGCCGGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGGCTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGC  1105
            ||||||||||..||||||||||..|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||...|||||||||||
Sbjct 1032  GTATAAGAGGTCCCGGGGCAAAGCTGGCCCGAAGCCCGGGCTGCGCCACCAGCTGGGAGCCATCTTCACCCTGC  1105

Query 1106  TCTACCTCCTGGAGCAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTTTCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGG  1179
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1106  TCTACCTCCTAGAGCAGCTCTTCCTGCCCTATTCCCACTTCCTGACCCAGGGTTACAATAACTGGACAAATGGG  1179

Query 1180  CTGTATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGG  1253
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1180  CTGTATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTAAAGATCACCTACCGCGACGG  1253

Query 1254  CCGCACTGGCGAACTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTTACACAGAGTCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACA  1327
            ||.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  CCTCACGGGCGAGCTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTCACACAGAGCCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACA  1327

Query 1328  TGCTGAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCGCCTGCTTCCCAAGTATAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTT  1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  TGCTGAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCTCCTGCTTCCCAAGTACAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTT  1401

Query 1402  GATATTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGATTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGC  1475
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1402  GATATTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGCTTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCTGT  1475

Query 1476  TTGGTCACCCTTTCAGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTCTTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTAC  1549
            .|||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||..|.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1476  CTGGTCCCCCTTCCAGCGCACACCTTGGGTGCAGCCACTCTTGATGGATTTATCTCCCTGGAGGACCAAGTTAC  1549

Query 1550  AGGAAATCAAGAGCAGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAG  1623
            ||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1550  AGGATATTAAGAGCAGTCTGGACAACCACACCGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGGCTTCACTTGGAG  1623

Query 1624  AATTTTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGC  1697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.|||||
Sbjct 1624  AATTTTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGAGAAGTCACCGTGGAATTGGTGGC  1697

Query 1698  AGAACAGAAGAACCAGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATGCAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATA  1771
            |||||||||.||.||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1698  AGAACAGAAAAATCAGACTCTTCAAGAAGGAGAGAAAATGCAGTTGCCTGCTGGAGAGTACCATAAAGTCTATA  1771

Query 1772  CGACATCACCTAGCCCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTG  1845
            |...||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1772  CTGTATCATCTAGTCCTTCCTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGGTCGCACTGGAGCAAGACCTG  1845

Query 1846  GCATATCTGCAAGAATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAAGTGAAACAGGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCC  1919
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1846  GCATATCTGCAAGAATTAAAGGAGAAGGTGGAGAACGGAAGTGAAACAGGGCCCCTGCCTCCAGAACTTCAGCC  1919

Query 1920  TCTGTTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAA  1993
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||   |||.|
Sbjct 1920  TCTTTTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTCCAAACTTTTCTCAGACG---ACAGA  1990

Query 1994  G---GCTCCAGGAGATTGAACGCCGGCGAAATACTCCTTTCCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAG  2064
            |   ||||||.||.|||||||||.|||||||||..|||||||||||||||||..||||||||.||.||||||||
Sbjct 1991  GGAAGCTCCAAGAAATTGAACGCAGGCGAAATAGCCCTTTCCATGAGCGATTTCTCCGCTTCGTGCTGCGAAAG  2064

Query 2065  CTCTATGTCTTTCGCCGCAGCTTCCTGATGACTTGTATCTCACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCT  2138
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||.||||||||||.||||||||
Sbjct 2065  CTCTACGTCTTTCGACGCAGCTTCCTGATGACTCGAATTTCACTCCGAAACCTGCTATTAGGCCGCCCTTCCCT  2138

Query 2139  GGAGCAGCTGGCCCAGGAGGTGACTTATGCAAACTTGAGACCCTTTGAGGCAGTTG--GAG--AACTGAATCCC  2208
            .|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||..||||||  |||  ||.||    |.
Sbjct 2139  AGAGCAACTAGCCCAAGAGGTGACATATGCAAACTTGCGACCATTTGAACCAGTTGATGAGTCAAGTG----CT  2208

Query 2209  TCAAACACGGATTCTTCACATTCTAATCCTCCTGAGTCAAATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTC  2274
            ||||||||.|||||||||.|   |.|.||..|.|||.||.||.||||.|.|||.|||||.||||||
Sbjct 2209  TCAAACACAGATTCTTCAAA---TCACCCGTCAGAGCCAGATTCTGAGCATGTTCACTCTGAGTTC  2271