Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00632
- Subject:
- XM_006506414.3
- Aligned Length:
- 2282
- Identities:
- 1668
- Gaps:
- 403
Alignment
Query 1 ATGGCGGTGTCTGCCGGGTCCGCGCGGACCTCGCCCAGCTCAGATAAAGTACAGAAAGACAAGGCTGAACTGAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTCAGGGCCCAGGCAGGACAGCCGAATAGGGAAACTCTTGGGTTTTGAGTGGACAGATTTGTCCAGTTGGCGGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGCTGGTGACCCTGCTGAATCGACCAACGGACCCTGCAAGCTTAGCTGTCTTTCGTTTTCTTTTTGGGTTCTTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATGGTGCTAGACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGCTCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATGTGTG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCGCTTCCCCTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCCACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATGTTTC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACCGGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTGGTAT 444
|||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1 --------------ATGATGCTGGGGCTATGCTACCGGCTAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTACCGTACTGGTAC 60
Query 445 GTGTTTCTCCTGGACAAGACATCATGGAACAACCACTCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAACATT 518
||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 61 GTGTTTCTCCTGGACAAGACTTCGTGGAACAATCACTCCTATCTGTATGGTTTGTTGGCCTTTCAGTTGACATT 134
Query 519 CATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCTGCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCCCTTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||..|.||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 135 CATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGATGGCTTGCTGAATGCCCGAAAGAAGAATGCTCACGTGCCCCTTT 208
Query 593 GGAACTATGCAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTGTGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGCAGAC 666
|||||||..||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 209 GGAACTACACAGTTCTGCGTGGCCAGATCTTCATCGTGTACTTCATCGCGGGTGTGAAGAAGCTCGATGCTGAC 282
Query 667 TGGGTTGAAGGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGTCTGA 740
|||||||..|||||.||||||||..|..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||
Sbjct 283 TGGGTTGGGGGCTACTCCATGGAGCACCTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAGCTGGTGTTGTCGGA 356
Query 741 GGAGCTGACTAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGGGCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTCTTTT 814
|||||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 357 GGAGCTGACAAGCCTGCTGGTAGTACACTGGTGTGGGCTTCTCCTTGACCTCTCGGCTGGCTTCCTGCTCTTCT 430
Query 815 TTGATGTCTCAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGTCCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAGCATT 888
||||||.|||.|||.||.|.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 431 TTGATGCCTCCAGACCCGTCGGCCTGTTCTTCGTGTCCTACTTTCACTGCATGAACTCGCAGCTCTTCAGCATC 504
Query 889 GGTATGTTCTCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGGT-GT 961
||.|||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||.|||| |.
Sbjct 505 GGGATGTTTCCCTATGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCAGCTGAATGGCCTCGGAAGTTGGTAGC 578
Query 962 CCTACTGCCCCCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCCTCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGTGTAT 1035
||.| |||||...||||.|||||.|.|||.|||||..|||.||.||.||||.|||.||||.|||||||||||||
Sbjct 579 CCGA-TGCCCGAAAAGGCTGCAAGAGCTGCTGCCCACCAAAGCCGCTCCTCGGCCTAGTGCTTCCTGTGTGTAT 651
Query 1036 AAGAGGAGCCGGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGGCTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGCTCTA 1109
||||||..||||||||||..|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||...|||||||||||||||
Sbjct 652 AAGAGGTCCCGGGGCAAAGCTGGCCCGAAGCCCGGGCTGCGCCACCAGCTGGGAGCCATCTTCACCCTGCTCTA 725
Query 1110 CCTCCTGGAGCAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTTTCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGGCTGT 1183
||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 726 CCTCCTAGAGCAGCTCTTCCTGCCCTATTCCCACTTCCTGACCCAGGGTTACAATAACTGGACAAATGGGCTGT 799
Query 1184 ATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGGCCGC 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||.|
Sbjct 800 ATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTAAAGATCACCTACCGCGACGGCCTC 873
Query 1258 ACTGGCGAACTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTTACACAGAGTCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCT 1331
||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 874 ACGGGCGAGCTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTCACACAGAGCCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCT 947
Query 1332 GAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCGCCTGCTTCCCAAGTATAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATA 1405
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 GAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCTCCTGCTTCCCAAGTACAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATA 1021
Query 1406 TTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGATTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGCTTGG 1479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||
Sbjct 1022 TTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGCTTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCTGTCTGG 1095
Query 1480 TCACCCTTTCAGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTCTTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTACAGGA 1553
||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||..|.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1096 TCCCCCTTCCAGCGCACACCTTGGGTGCAGCCACTCTTGATGGATTTATCTCCCTGGAGGACCAAGTTACAGGA 1169
Query 1554 AATCAAGAGCAGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAGAATT 1627
.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1170 TATTAAGAGCAGTCTGGACAACCACACCGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGGCTTCACTTGGAGAATT 1243
Query 1628 TTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGCAGAA 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.|||||||||
Sbjct 1244 TTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGAGAAGTCACCGTGGAATTGGTGGCAGAA 1317
Query 1702 CAGAAGAACCAGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATGCAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATACGAC 1775
|||||.||.||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||...
Sbjct 1318 CAGAAAAATCAGACTCTTCAAGAAGGAGAGAAAATGCAGTTGCCTGCTGGAGAGTACCATAAAGTCTATACTGT 1391
Query 1776 ATCACCTAGCCCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTGGCAT 1849
||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392 ATCATCTAGTCCTTCCTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGGTCGCACTGGAGCAAGACCTGGCAT 1465
Query 1850 ATCTGCAAGAATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAAGTGAAACAGGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCCTCTG 1923
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 1466 ATCTGCAAGAATTAAAGGAGAAGGTGGAGAACGGAAGTGAAACAGGGCCCCTGCCTCCAGAACTTCAGCCTCTT 1539
Query 1924 TTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAAG--- 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||| |||.||
Sbjct 1540 TTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTCCAAACTTTTCTCAGACG---ACAGAGGAA 1610
Query 1995 GCTCCAGGAGATTGAACGCCGGCGAAATACTCCTTTCCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAGCTCT 2068
||||||.||.|||||||||.|||||||||..|||||||||||||||||..||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1611 GCTCCAAGAAATTGAACGCAGGCGAAATAGCCCTTTCCATGAGCGATTTCTCCGCTTCGTGCTGCGAAAGCTCT 1684
Query 2069 ATGTCTTTCGCCGCAGCTTCCTGATGACTTGTATCTCACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCTGGAG 2142
|.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||||.|||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1685 ACGTCTTTCGACGCAGCTTCCTGATGACTCGAATTTCACTCCGAAACCTGCTATTAGGCCGCCCTTCCCTAGAG 1758
Query 2143 CAGCTGGCCCAGGAGGTGACTTATGCAAACTTGAGACCCTTTGAGGCAGTTG--GAG--AACTGAATCCCTCAA 2212
||.||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||..|||||| ||| ||.|| |.||||
Sbjct 1759 CAACTAGCCCAAGAGGTGACATATGCAAACTTGCGACCATTTGAACCAGTTGATGAGTCAAGTG----CTTCAA 1828
Query 2213 ACACGGATTCTTCACATTCTAATCCTCCTGAGTCAAATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTC 2274
||||.|||||||||.| |.|.||..|.|||.||.||.||||.|.|||.|||||.||||||
Sbjct 1829 ACACAGATTCTTCAAA---TCACCCGTCAGAGCCAGATTCTGAGCATGTTCACTCTGAGTTC 1887