Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00632
- Subject:
- XM_017003803.2
- Aligned Length:
- 2274
- Identities:
- 2097
- Gaps:
- 177
Alignment
Query 1 ATGGCGGTGTCTGCCGGGTCCGCGCGGACCTCGCCCAGCTCAGATAAAGTACAGAAAGACAAGGCTGAACTGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGTGTCTGCCGGGTCCGCGCGGACCTCGCCCAGCTCA-------------------------------- 42
Query 75 CTCAGGGCCCAGGCAGGACAGCCGAATAGGGAAACTCTTGGGTTTTGAGTGGACAGATTTGTCCAGTTGGCGGA 148
Sbjct 43 -------------------------------------------------------------------------- 42
Query 149 GGCTGGTGACCCTGCTGAATCGACCAACGGACCCTGCAAGCTTAGCTGTCTTTCGTTTTCTTTTTGGGTTCTTG 222
|||||||||
Sbjct 43 -----------------------------------------------------------------GGGTTCTTG 51
Query 223 ATGGTGCTAGACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGCTCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATGTGTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 52 ATGGTGCTAGACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGCTCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATGTGTG 125
Query 297 CCGCTTCCCCTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCCACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATGTTTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126 CCGCTTCCCCTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCCACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATGTTTC 199
Query 371 TGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACCGGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTGGTAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 TGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACCGGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTGGTAT 273
Query 445 GTGTTTCTCCTGGACAAGACATCATGGAACAACCACTCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAACATT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 GTGTTTCTCCTGGACAAGACATCATGGAACAACCACTCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAACATT 347
Query 519 CATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCTGCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCCCTTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 CATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCTGCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCCCTTT 421
Query 593 GGAACTATGCAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTGTGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGCAGAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 GGAACTATGCAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTGTGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGCAGAC 495
Query 667 TGGGTTGAAGGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGTCTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 TGGGTTGAAGGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGGCACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGTCTGA 569
Query 741 GGAGCTGACTAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGGGCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTCTTTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 GGAGCTGACTAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGGGCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTCTTTT 643
Query 815 TTGATGTCTCAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGTCCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAGCATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 TTGATGTCTCAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGTCCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAGCATT 717
Query 889 GGTATGTTCTCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGGTGTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 GGTATGTTCTCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCTCTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGGTGTC 791
Query 963 CTACTGCCCCCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCCTCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGTGTATA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792 CTACTGCCCCCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCCTCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGTGTATA 865
Query 1037 AGAGGAGCCGGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGGCTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGCTCTAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866 AGAGGAGCCGGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGGCTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGCTCTAC 939
Query 1111 CTCCTGGAGCAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTTTCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGGCTGTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 940 CTCCTGGAGCAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTTTCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGGCTGTA 1013
Query 1185 TGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGGCCGCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 TGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCTCCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGGCCGCA 1087
Query 1259 CTGGCGAACTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTTACACAGAGTCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 CTGGCGAACTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTTACACAGAGTCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCTG 1161
Query 1333 AAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCGCCTGCTTCCCAAGTATAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162 AAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCGCCTGCTTCCCAAGTATAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATAT 1235
Query 1407 TTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGATTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGCTTGGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 TTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGATTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGCTTGGT 1309
Query 1481 CACCCTTTCAGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTCTTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTACAGGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 CACCCTTTCAGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTCTTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTACAGGAA 1383
Query 1555 ATCAAGAGCAGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAGAATTT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384 ATCAAGAGCAGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGTCTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAGAATTT 1457
Query 1629 TGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGCAGAAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458 TGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGCTGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGCAGAAC 1531
Query 1703 AGAAGAACCAGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATGCAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATACGACA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532 AGAAGAACCAGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATGCAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATACGACA 1605
Query 1777 TCACCTAGCCCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTGGCATA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1606 TCACCTAGCCCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGTCAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTGGCATA 1679
Query 1851 TCTGCAAGAATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAAGTGAAACAGGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCCTCTGT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TCTGCAAGAATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAAGT------GGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCCTCTGT 1747
Query 1925 TGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAAGGCTC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1748 TGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACACCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAAGGCTC 1821
Query 1999 CAGGAGATTGAACGCCGGCGAAATACTCCTTTCCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAGCTCTATGT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1822 CAGGAGATTGAACGCCGGCGAAATACTCCTTTCCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAGCTCTATGT 1895
Query 2073 CTTTCGCCGCAGCTTCCTGATGACTTGTATCTCACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCTGGAGCAGC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 CTTTCGCCGCAGCTTCCTGATGACTTGTATCTCACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCTGGAGCAGC 1969
Query 2147 TGGCCCAGGAGGTGACTTATGCAAACTTGAGACCCTTTGAGGCAGTTGGAGAACTGAATCCCTCAAACACGGAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 TGGCCCAGGAGGTGACTTATGCAAACTTGAGACCCTTTGAGGCAGTTGGAGAACTGAATCCCTCAAACACGGAT 2043
Query 2221 TCTTCACATTCTAATCCTCCTGAGTCAAATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTC 2274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2044 TCTTCACATTCTAATCCTCCTGAGTCAAATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTC 2097