Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00632
• Subject: XR_001785157.1
• Aligned Length: 2950
• Identities: 1839
• Gaps: 843

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  CGCGAGTGCTTACGTGTCGAGGAGGCGGGGCCTAAGACAGCAAGTCTAAGTCTGGAGGTTCCACTGGGTCCGAC  74

Query    1  ----------------------------------ATGGCGGTGTCTGC----CGGGTCCGCGCGGACCTCGCCC  36
                                              |||||    |.|||    |||.|||||.|.|....|.|||
Sbjct   75  CTGGCTGCAGAGAGGCTCACCTGTCCCTGCAGTCATGGC----TGTGCACCGCGGCTCCGCACTGGTTGCTCCC  144

Query   37  AGCTCAGATAAAGTACAGAAAGACAAGGCTGAACTGATCTCAGGGCCCAGGCAGGACAGCCGAATAGGGAAACT  110
            ..|||||||||||||||||||.|||||.|||.||.||..|||||.|..|..||||.|||||||||.|.||||.|
Sbjct  145  GCCTCAGATAAAGTACAGAAAAACAAGTCTGCACAGACATCAGGACTGAAACAGGGCAGCCGAATGGAGAAAAT  218

Query  111  CTTGGGTTTTGAGTGGACAGATTTGTCCAGTTGGCGGAGGCTGGTGACCCTGCTGAATCGACCAACGGACCCTG  184
            .||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||||.|||..|.|||||||||||.||...||||||||||||||
Sbjct  219  TTTAGGGTTTGAATGGACAGATTTATCTAGCTGGCAGAGTGTCGTGACCCTGCTTAACAAACCAACGGACCCTG  292

Query  185  CAAGCTTAGCTGTCTTTCGTTTTCTTTTTGGGTTCTTGATGGTGCTAGACATTCCCCAGGAGCGGGGGCTCAGC  258
            |||.|.|.|||||||||||||||||.||||..|||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  293  CAAACCTGGCTGTCTTTCGTTTTCTCTTTGCTTTCTTGATGCTGCTGGACATTCCCCAGGAACGCGGCCTTAGC  366

Query  259  TCTCTGGACCGGAAATACCTTGATGGGCTGGATGTGTGCCGCTTCCCCTTGCTGGATGCCCTACGCCCACTGCC  332
            ||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  367  TCCCTGGACCGAAAATACTTGGATGGGCTGGATGTGTGCCGTTTCCCCTTGCTGGATGCCTTGCGCCCACTGCC  440

Query  333  ACTTGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATGTTTCTGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGCCTGTGCTACC  406
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  441  ACTGGACTGGATGTATCTTGTCTACACCATCATGTTTCTGGGGGCACTGGGCATGATGCTGGGGCTATGCTACC  514

Query  407  GGATAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTGCCATACTGGTATGTGTTTCTCCTGGACAAGACATCATGGAACAACCAC  480
            ||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct  515  GGCTAAGCTGTGTGTTATTCCTGCTACCGTACTGGTACGTGTTTCTCCTGGACAAGACTTCGTGGAACAATCAC  588

Query  481  TCCTATCTGTATGGGTTGTTGGCCTTTCAGCTAACATTCATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGACGGTCT  554
            ||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|
Sbjct  589  TCCTATCTGTATGGTTTGTTGGCCTTTCAGTTGACATTCATGGATGCAAACCACTACTGGTCTGTGGATGGCTT  662

Query  555  GCTGAATGCCCATAGGAGGAATGCCCACGTGCCCCTTTGGAACTATGCAGTGCTCCGTGGCCAGATCTTCATTG  628
            |||||||||||..|.||.||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  663  GCTGAATGCCCGAAAGAAGAATGCTCACGTGCCCCTTTGGAACTACACAGTTCTGCGTGGCCAGATCTTCATCG  736

Query  629  TGTACTTCATTGCGGGTGTGAAAAAGCTGGATGCAGACTGGGTTGAAGGCTATTCCATGGAATATTTGTCCCGG  702
            ||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||..|||||.||||||||..|..||||||||
Sbjct  737  TGTACTTCATCGCGGGTGTGAAGAAGCTCGATGCTGACTGGGTTGGGGGCTACTCCATGGAGCACCTGTCCCGG  810

Query  703  CACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAACTGCTGTTGTCTGAGGAGCTGACTAGCCTGCTGGTCGTGCACTGGGGTGG  776
            |||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||
Sbjct  811  CACTGGCTCTTCAGTCCCTTCAAGCTGGTGTTGTCGGAGGAGCTGACAAGCCTGCTGGTAGTACACTGGTGTGG  884

Query  777  GCTGCTGCTTGACCTCTCAGCTGGTTTCCTGCTCTTTTTTGATGTCTCAAGATCCATTGGCCTGTTCTTTGTGT  850
            |||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||.|||.|||.||.|.|||||||||||.||||
Sbjct  885  GCTTCTCCTTGACCTCTCGGCTGGCTTCCTGCTCTTCTTTGATGCCTCCAGACCCGTCGGCCTGTTCTTCGTGT  958

Query  851  CCTACTTCCACTGCATGAATTCCCAGCTTTTCAGCATTGGTATGTTCTCCTACGTCATGCTGGCCAGCAGCCCT  924
            |||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||..||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  959  CCTACTTTCACTGCATGAACTCGCAGCTCTTCAGCATCGGGATGTTTCCCTATGTCATGCTGGCCAGCAGCCCT  1032

Query  925  CTCTTCTGCTCCCCTGAGTGGCCTCGGAAGCTGGT-GTCCTACTGCCCCCGAAGGTTGCAACAACTGTTGCCCC  997
            |||||||||||..||||.||||||||||||.|||| |.||.| |||||...||||.|||||.|.|||.|||||.
Sbjct 1033  CTCTTCTGCTCAGCTGAATGGCCTCGGAAGTTGGTAGCCCGA-TGCCCGAAAAGGCTGCAAGAGCTGCTGCCCA  1105

Query  998  TCAAGGCAGCCCCTCAGCCCAGTGTTTCCTGTGTGTATAAGAGGAGCCGGGGCAAAAGTGGCCAGAAGCCAGGG  1071
            .|||.||.||.||||.|||.||||.|||||||||||||||||||..||||||||||..|||||.||||||.|||
Sbjct 1106  CCAAAGCCGCTCCTCGGCCTAGTGCTTCCTGTGTGTATAAGAGGTCCCGGGGCAAAGCTGGCCCGAAGCCCGGG  1179

Query 1072  CTGCGCCATCAGCTGGGAGCTGCCTTCACCCTGCTCTACCTCCTGGAGCAGCTATTCCTGCCCTATTCTCATTT  1145
            ||||||||.|||||||||||...|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1180  CTGCGCCACCAGCTGGGAGCCATCTTCACCCTGCTCTACCTCCTAGAGCAGCTCTTCCTGCCCTATTCCCACTT  1253

Query 1146  TCTCACCCAGGGCTATAACAACTGGACAAATGGGCTGTATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCT  1219
            .||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  CCTGACCCAGGGTTACAATAACTGGACAAATGGGCTGTATGGCTATTCCTGGGACATGATGGTGCACTCCCGCT  1327

Query 1220  CCCACCAGCACGTGAAGATCACCTACCGTGATGGCCGCACTGGCGAACTGGGCTACCTTAACCCTGGGGTATTT  1293
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||       
Sbjct 1328  CCCACCAGCACGTAAAGATCACCTACCGCGACGGCCTCACGGGCGAGCTGGGCTACCTTAACCCTGG-------  1394

Query 1294  ACACAGAGTCGGCGATGGAAGGATCATGCAGACATGCTGAAGCAATATGCCACTTGCCTGAGCCGCCTGCTTCC  1367
                                                                                      
Sbjct 1395  --------------------------------------------------------------------------  1394

Query 1368  CAAGTATAATGTCACTGAGCCCCAGATCTACTTTGATATTTGGGTCTCCATCAATGACCGCTTCCAGCAGAGGA  1441
                                                                                   ||.
Sbjct 1395  -----------------------------------------------------------------------GGC  1397

Query 1442  TTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCCGCTTGGTCACCCTTTCAGCGCACATCCTGGGTGCAACCACTC  1515
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||
Sbjct 1398  TTTTTGACCCTCGTGTGGACATCGTGCAGGCTGTCTGGTCCCCCTTCCAGCGCACACCTTGGGTGCAGCCACTC  1471

Query 1516  TTGATGGACCTGTCTCCCTGGAGGGCCAAGTTACAGGAAATCAAGAGCAGCCTAGACAACCACACTGAGGTGGT  1589
            ||||||||..|.||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1472  TTGATGGATTTATCTCCCTGGAGGACCAAGTTACAGGATATTAAGAGCAGTCTGGACAACCACACCGAGGTGGT  1545

Query 1590  CTTCATTGCAGATTTCCCTGGACTGCACTTGGAGAATTTTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGC  1663
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  CTTCATTGCAGATTTCCCTGGGCTTCACTTGGAGAATTTTGTGAGTGAAGACCTGGGCAACACTAGCATCCAGC  1619

Query 1664  TGCTGCAGGGGGAAGTGACTGTGGAGCTTGTGGCAGAACAGAAGAACCAGACTCTTCGAGAGGGAGAAAAAATG  1737
            ||||||||||.|||||.||.|||||..|.||||||||||||||.||.||||||||||.|||.|||||.||||||
Sbjct 1620  TGCTGCAGGGAGAAGTCACCGTGGAATTGGTGGCAGAACAGAAAAATCAGACTCTTCAAGAAGGAGAGAAAATG  1693

Query 1738  CAGTTGCCTGCTGGTGAGTACCATAAGGTGTATACGACATCACCTAGCCCTTCTTGCTACATGTACGTCTATGT  1811
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||...||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  CAGTTGCCTGCTGGAGAGTACCATAAAGTCTATACTGTATCATCTAGTCCTTCCTGCTACATGTACGTCTATGT  1767

Query 1812  CAACACTACAGAGCTTGCACTGGAGCAAGACCTGGCATATCTGCAAGAATTAAAGGAAAAGGTGGAGAATGGAA  1885
            |||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1768  CAACACTACAGAGGTCGCACTGGAGCAAGACCTGGCATATCTGCAAGAATTAAAGGAGAAGGTGGAGAACGGAA  1841

Query 1886  GTGAAACAGGGCCTCTACCCCCAGAGCTGCAGCCTCTGTTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACA  1959
            |||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842  GTGAAACAGGGCCCCTGCCTCCAGAACTTCAGCCTCTTTTGGAAGGGGAAGTAAAAGGGGGCCCTGAGCCAACA  1915

Query 1960  CCTCTGGTTCAGACCTTTCTTAGACGCCAACAAAG---GCTCCAGGAGATTGAACGCCGGCGAAATACTCCTTT  2030
            ||||||||.||.||.|||||.|||||   |||.||   ||||||.||.|||||||||.|||||||||..|||||
Sbjct 1916  CCTCTGGTCCAAACTTTTCTCAGACG---ACAGAGGAAGCTCCAAGAAATTGAACGCAGGCGAAATAGCCCTTT  1986

Query 2031  CCATGAGCGATTCTTCCGCTTCTTGTTGCGAAAGCTCTATGTCTTTCGCCGCAGCTTCCTGATGACTTGTATCT  2104
            ||||||||||||..||||||||.||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|
Sbjct 1987  CCATGAGCGATTTCTCCGCTTCGTGCTGCGAAAGCTCTACGTCTTTCGACGCAGCTTCCTGATGACTCGAATTT  2060

Query 2105  CACTTCGAAATCTGATATTAGGCCGTCCTTCCCTGGAGCAGCTGGCCCAGGAGGTGACTTATGCAAACTTGAGA  2178
            ||||.|||||.|||.||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 2061  CACTCCGAAACCTGCTATTAGGCCGCCCTTCCCTAGAGCAACTAGCCCAAGAGGTGACATATGCAAACTTGCGA  2134

Query 2179  CCCTTTGAGGCAGTTG--GAG--AACTGAATCCCTCAAACACGGATTCTTCACATTCTAATCCTCCTGAGTCAA  2248
            ||.|||||..||||||  |||  ||.||    |.||||||||.|||||||||.|   |.|.||..|.|||.||.
Sbjct 2135  CCATTTGAACCAGTTGATGAGTCAAGTG----CTTCAAACACAGATTCTTCAAA---TCACCCGTCAGAGCCAG  2201

Query 2249  ATCCTGATCCTGTCCACTCAGAGTTC------------------------------------------------  2274
            ||.||||.|.|||.|||||.||||||                                                
Sbjct 2202  ATTCTGAGCATGTTCACTCTGAGTTCTGAGGGATGTACAGATGCTCTGTGCAGATGTGGGGGCAGCCTGTTATA  2275

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2276  GGCTTATTGTCTACGCAAAGAACATATTTTTGGAGAAAAATGATATGGGACAGGCTTTCACAGTACAGCCCAGG  2349

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2350  CTGGCCTCAAACTCATGGTTGGTCCCTCTGCTTCAGCCTGTTTTGTAATTACATAGATCACCAAACCTAGTTGC  2423

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2424  TTTTCCCTTTACATTTTTTCCCCTTATAAGTTCTTTAAAATTATAGCTTACATTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTT  2497

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2498  TTTTTTGTATTTTTTCTTTTTCAAGACAGGGTCTCTCTCTGTGTAGCACTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTA  2571

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2572  GTCCAGGCTGGCCTCCAACTCAGAAATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGTGCCAC  2645

Query 2275  --------------------------------------------------------------------------  2274
                                                                                      
Sbjct 2646  CACGCCCCACTGGGCTTTTAGTTTTTATAGACAAGATTTCTCCATGTAGACCAGACCAGCTCTCCTGAGTGCTG  2719

Query 2275  ----------------------------------------------------------------  2274
                                                                            
Sbjct 2720  AAATTAAAGGCACGGGACATCACTACCTGGCTTTCTTATTAAACTTGTTTTAGTGGTCTCAAAA  2783