Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_00683
Subject:
NM_001177874.1
Aligned Length:
527
Identities:
469
Gaps:
40

Alignment

Query   1  MRDSSAPSSASSSVTDLYCTPHSSRSDLVLPGTAGDFSLSASLSACTLLYEGAVEPMQIDVDPQEDPQNAPDVN  74
                                        .|.....|.|           .|||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -----------------------------MPLPVQVFNL-----------QGAVEPMQIDVDPQEDPQNAPDVN  34

Query  75  YVVENPSLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPTLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQNA  148
           ||||||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  35  YVVENPTLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADRCPPLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQNA  108

Query 149  PDAIPESGVEPPALDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYS  222
           ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109  PDAIPESGVEPPPLDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYS  182

Query 223  RARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183  RARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAA  256

Query 297  RKYKQAAKCLLLASFDHCDFPELLSPSNVAIYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFY  370
           |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257  RKYKQAAKCFLLASFDHCDFPELLSPSNVAVYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFY  330

Query 371  ESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMHRMAAAFNTTVAALEDELTQLI  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 331  ESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMHKMAAAFNTTVAALEDELTQLI  404

Query 445  LEGLISARVDSHSKILYARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMMLRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGELTPAN  518
           |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405  LEGLINARIDSHSKILYARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMILRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGELTPAN  478

Query 519  SQSRMSTNM  527
           |||||||||
Sbjct 479  SQSRMSTNM  487