Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00683
• Subject: NM_001321093.2
• Aligned Length: 1581
• Identities: 1413
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGAGGGATAGCTCGGCCCCCAGCTCGGCCTCCTCGTCAGTGACAGATCTGTACTGCACCCCTCACAGCAGTAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCAGACCTCGTCCTGCCCGGCACGGCCGGGGACTTCAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGTACGCTGCTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACGAGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  222
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  54

Query  223  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  128

Query  297  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  202

Query  371  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGGAGCTGCAGAACGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGGAGCTGCAGAACGCA  276

Query  445  CCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGCCACGCGGAAGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  CCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGCCACGCGGAAGAA  350

Query  519  GGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCAAAGAGAGCATCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  GGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCAAAGAGAGCATCC  424

Query  593  GGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTCAAGTGCTATTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  GGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTCAAGTGCTATTCC  498

Query  667  CGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAAGGTCAGCGTCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  CGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAAGGTCAGCGTCTA  572

Query  741  CTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTGCCGAGCAGCGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  CTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTGCCGAGCAGCGAG  646

Query  815  GAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCAGAGCTGGCCGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  GAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCAGAGCTGGCCGCC  720

Query  889  AGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCTGAGCTGCTGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  AGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCTGAGCTGCTGTC  794

Query  963  CCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGCTGCAGCGCAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  CCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGCTGCAGCGCAATG  868

Query 1037  TCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATCTTCAAATTCTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  TCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATCTTCAAATTCTAC  942

Query 1111  GAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGACAACCTGCTCCTGGACATGTATCTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  GAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGACAACCTGCTCCTGGACATGTATCTGGC  1016

Query 1185  CCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCCCCTACGTGTCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017  CCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCCCCTACGTGTCAG  1090

Query 1259  CCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTGACGCAGCTAATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091  CCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTGACGCAGCTAATC  1164

Query 1333  CTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGTGGATCAGCGCAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165  CTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGTGGATCAGCGCAG  1238

Query 1407  CACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGATGCTGCGGGCAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239  CACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGATGCTGCGGGCAG  1312

Query 1481  CTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCTGACTCCAGCCAAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313  CTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCTGACTCCAGCCAAC  1386

Query 1555  AGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1581
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387  AGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1413