Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_00683
Subject:
NM_001346709.1
Aligned Length:
531
Identities:
453
Gaps:
45

Alignment

Query   1  MRDSSAPSSASSSVTDLYCTPHSSRSDLVLPGTAGDFSLSASLSACTLLYEGAVEPMQIDVDPQEDPQNAPDVN  74
                                        .|.....|.|           .|||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -----------------------------MPLPVQVFNL-----------QGAVEPMQIDVDPQEDPQNAPDVN  34

Query  75  YVVENPSLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPTLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQNA  148
           ||||||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  35  YVVENPTLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADRCPPLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQNA  108

Query 149  PDAIPESGVEPPALDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYS  222
           ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109  PDAIPESGVEPPPLDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYS  182

Query 223  RARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183  RARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAA  256

Query 297  RKYKQAAKCLLLASFDHCDFPELLSPSNVAIYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFY  370
           |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257  RKYKQAAKCFLLASFDHCDFPELLSPSNVAVYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFY  330

Query 371  ESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMHRMAAAFNTTVAALEDELTQLI  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 331  ESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMHKMAAAFNTTVAALEDELTQLI  404

Query 445  LEGLISARVDSHSKILYARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMMLRAAVLRNQIH--VKSPPREGSQGELTP  516
           |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||  |||...||..|..| 
Sbjct 405  LEGLINARIDSHSKILYARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMILRAAVLRNQIHVKVKSLGCEGMGGTHT-  477

Query 517  ANSQSRMSTNM--  527
           |......||..  
Sbjct 478  ASTEPSLSTAVSS  490