Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00683
• Subject: NM_145370.2
• Aligned Length: 1585
• Identities: 1371
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  ATGAGGGATAGCTCGGCCCCCAGCTCGGCCTCCTCGTCAGTGACAGATCTGTACTGCACCCCT---CACAGCAG  71
            |||.|||..|||.||||.||||||||||||||.|||||.|...|.||.|||..|.|||.||||   ||||||  
Sbjct    1  ATGCGGGGCAGCCCGGCGCCCAGCTCGGCCTCGTCGTCGGCCTCCGACCTGAGCCGCAGCCCTGCGCACAGC--  72

Query   72  TAGGTCAGACCT-CGTCCTGCCCGGCACGGCCGGGGACTTCAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGTACGCTG  144
             |||||.|||.| ||    ||||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct   73  -AGGTCCGACTTGCG----GCCCGGCACGGCGGGCGACTACAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGCACGTTG  141

Query  145  CTCTACGAGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGT  218
            ||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  142  CTTTCCGAGGGGGCCGTGGAACCCATGCAGATTGATGTCGATCCGCAGGAAGATCCGCAGAACGCACCTGATGT  215

Query  219  CAACTACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCG  292
            ||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  216  CAACTATGTGGTGGAGAATCCCACCCTGGATCTGGAGCAGTATGCAGCCAGCTACAGTGGCCTGATGCGAATTG  289

Query  293  AACGGCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTG  366
            |.||.||.|||||.||||||||.|..|||||..|.|||.||||.||||||.||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  290  AGCGACTACAGTTTATTGCTGACCGTTGCCCTCCACTGAGGGTAGAGGCCTTGAAAATGGCTCTATCCTTCGTG  363

Query  367  CAGAGAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGGAGCTGCAGAA  440
            |||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  364  CAGAGGACCTTCAATGTGGACATGTATGAAGAGATACACCGGAAGCTCTCCGAGGCTACCAGGGAGCTGCAGAA  437

Query  441  CGCACCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGCCACGCGGA  514
            .|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  438  TGCACCTGATGCCATCCCTGAGAGTGGAGTGGAGCCCCCGCCCCTGGACACAGCCTGGGTGGAGGCCACTCGGA  511

Query  515  AGAAGGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCAAAGAGAGC  588
            |||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  512  AGAAGGCTCTGTTGAAACTGGAGAAGCTGGACACGGACTTGAAGAACTATAAGGGCAATTCTATCAAAGAGAGC  585

Query  589  ATCCGGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTCAAGTGCTA  662
            |||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  586  ATCAGGCGCGGCCACGATGACCTGGGTGATCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAATGCCCTCAAATGTTA  659

Query  663  TTCCCGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAAGGTCAGCG  736
            .||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  660  CTCACGAGCCCGAGACTACTGCACCAGTGCTAAGCATGTCATCAACATGTGCCTCAACGTCATCAAGGTCAGTG  733

Query  737  TCTACTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTGCCGAGCAG  810
            ||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  734  TCTACTTGCAAAATTGGTCTCATGTGTTAAGCTATGTCAGCAAGGCCGAGTCTACTCCAGAGATTGCTGAGCAG  807

Query  811  CGAGGAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCAGAGCTGGC  884
            ||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  808  CGGGGAGAGCGGGACAGCCAGACGCAAGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCTGCAGGCTTGGCTGAGCTGGC  881

Query  885  CGCCAGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCTGAGCTGC  958
            |||..|||||||.|||||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  882  CGCACGGAAGTATAAGCAAGCAGCCAAGTGCTTCCTTCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCAGAGCTGC  955

Query  959  TGTCCCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGCTGCAGCGC  1032
            |||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  956  TGTCCCCCAGCAATGTGGCTGTCTATGGTGGCCTGTGTGCCTTAGCCACCTTTGACCGGCAGGAGCTGCAACGA  1029

Query 1033  AATGTCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATCTTCAAATT  1106
            |||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1030  AATGTCATCTCCAGCAGTTCCTTCAAGCTGTTCCTGGAGCTGGAGCCACAGGTCAGAGACATCATCTTCAAATT  1103

Query 1107  CTACGAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGACAACCTGCTCCTGGACATGTATC  1180
            |||.||.||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1104  CTATGAATCCAAGTATGCCTCATGCTTGAAGATGCTGGACGAGATGAAGGATAACCTGCTCCTGGACATGTACC  1177

Query 1181  TGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCCCCTACGTG  1254
            |||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 1178  TGGCCCCTCACGTCAGGACACTGTACACCCAGATTCGTAACCGGGCTCTTATCCAATACTTCAGCCCCTATGTG  1251

Query 1255  TCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTGACGCAGCT  1328
            |||||.||.|||||.|.||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1252  TCAGCTGATATGCACAAGATGGCTGCAGCCTTCAACACAACAGTTGCAGCTCTGGAAGATGAGCTGACACAGCT  1325

Query 1329  AATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGTGGATCAGC  1402
            .||.||||||||.||.||.|.||||||..|.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1326  CATTCTGGAGGGCCTTATTAATGCCCGCATCGACTCACACAGCAAGATACTGTATGCTCGAGATGTGGATCAGC  1399

Query 1403  GCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGATGCTGCGG  1476
            |.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.|||.|.
Sbjct 1400  GTAGCACCACCTTTGAGAAGTCCCTGCTGATGGGCAAGGAATTCCAACGACGTGCCAAAGCTATGATTCTGAGA  1473

Query 1477  GCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCTGACTCCAGC  1550
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1474  GCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGTCTCCTCCTAGAGAAGGGAGCCAAGGGGAGCTGACTCCAGC  1547

Query 1551  CAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1581
            ||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1548  CAACAGCCAGTCACGCATGAGTACCAACATG  1578