Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00683
• Subject: XM_005256359.2
• Aligned Length: 1671
• Identities: 1452
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGAGGGATAGCTCGGCCCCCAGCTCGGCCTCCTCGTCAGTGACAGATCTGTACTGCACCCCTCACAGCAGTAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCAGACCTCGTCCTGCCCGGCACGGCCGGGGACTTCAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGTACGCTGCTCT  148
                         .|||    |.|.|||||    ||||                   ||..|.||...|||   
Sbjct    1  -------------ATGC----CGCTGCCGG----TTCA-------------------GGTGTTTAACTTGC---  31

Query  149  ACGAGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  222
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  ---AGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  102

Query  223  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  176

Query  297  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  250

Query  371  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCAC------------CAGGGAG  432
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||
Sbjct  251  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGTCCTCTCTCAGGGAG  324

Query  433  CTGCAGAACGCACCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGC  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  CTGCAGAACGCACCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGC  398

Query  507  CACGCGGAAGAAGGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCA  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  CACGCGGAAGAAGGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCA  472

Query  581  AAGAGAGCATCCGGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTC  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  AAGAGAGCATCCGGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTC  546

Query  655  AAGTGCTATTCCCGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  AAGTGCTATTCCCGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAA  620

Query  729  GGTCAGCGTCTACTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  GGTCAGCGTCTACTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTG  694

Query  803  CCGAGCAGCGAGGAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCA  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  CCGAGCAGCGAGGAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCA  768

Query  877  GAGCTGGCCGCCAGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  GAGCTGGCCGCCAGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCC  842

Query  951  TGAGCTGCTGTCCCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGC  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  TGAGCTGCTGTCCCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGC  916

Query 1025  TGCAGCGCAATGTCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATC  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  TGCAGCGCAATGTCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATC  990

Query 1099  TTCAAATTCTACGAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGACAACCTGCTCCTGGA  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  TTCAAATTCTACGAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGACAACCTGCTCCTGGA  1064

Query 1173  CATGTATCTGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCC  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  CATGTATCTGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCC  1138

Query 1247  CCTACGTGTCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTG  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  CCTACGTGTCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTG  1212

Query 1321  ACGCAGCTAATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGT  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  ACGCAGCTAATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGT  1286

Query 1395  GGATCAGCGCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGA  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  GGATCAGCGCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGA  1360

Query 1469  TGCTGCGGGCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCA-----------------------------------  1507
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct 1361  TGCTGCGGGCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGGTGGGCTGGCTTGAGGGGGGGCAGGCGCACGGC  1434

Query 1508  -------------------------------------------AGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGA  1538
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  GTGTGGGGCCTGGTGGCTGTGAGCTGCTCCTTGTCTCCCCTGCAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGA  1508

Query 1539  GCTGACTCCAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1581
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  GCTGACTCCAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1551