Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00683
• Subject: XM_017314412.1
• Aligned Length: 1581
• Identities: 1271
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGAGGGATAGCTCGGCCCCCAGCTCGGCCTCCTCGTCAGTGACAGATCTGTACTGCACCCCTCACAGCAGTAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCAGACCTCGTCCTGCCCGGCACGGCCGGGGACTTCAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGTACGCTGCTCT  148
                         .|||    |.|.|||||    ||||                   ||..|.||...|||   
Sbjct    1  -------------ATGC----CGCTGCCGG----TTCA-------------------GGTGTTTAACTTGC---  31

Query  149  ACGAGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  222
               |||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct   32  ---AGGGGGCCGTGGAACCCATGCAGATTGATGTCGATCCGCAGGAAGATCCGCAGAACGCACCTGATGTCAAC  102

Query  223  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  296
            ||.|||||||||||.||||.||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct  103  TATGTGGTGGAGAATCCCACCCTGGATCTGGAGCAGTATGCAGCCAGCTACAGTGGCCTGATGCGAATTGAGCG  176

Query  297  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  370
            .||.|||||.||||||||.|..|||||..|.|||.||||.||||||.||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  177  ACTACAGTTTATTGCTGACCGTTGCCCTCCACTGAGGGTAGAGGCCTTGAAAATGGCTCTATCCTTCGTGCAGA  250

Query  371  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGGAGCTGCAGAACGCA  444
            |.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  251  GGACCTTCAATGTGGACATGTATGAAGAGATACACCGGAAGCTCTCCGAGGCTACCAGGGAGCTGCAGAATGCA  324

Query  445  CCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGCCACGCGGAAGAA  518
            ||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  325  CCTGATGCCATCCCTGAGAGTGGAGTGGAGCCCCCGCCCCTGGACACAGCCTGGGTGGAGGCCACTCGGAAGAA  398

Query  519  GGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCAAAGAGAGCATCC  592
            |||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.
Sbjct  399  GGCTCTGTTGAAACTGGAGAAGCTGGACACGGACTTGAAGAACTATAAGGGCAATTCTATCAAAGAGAGCATCA  472

Query  593  GGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTCAAGTGCTATTCC  666
            |||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct  473  GGCGCGGCCACGATGACCTGGGTGATCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAATGCCCTCAAATGTTACTCA  546

Query  667  CGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAAGGTCAGCGTCTA  740
            ||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  547  CGAGCCCGAGACTACTGCACCAGTGCTAAGCATGTCATCAACATGTGCCTCAACGTCATCAAGGTCAGTGTCTA  620

Query  741  CTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTGCCGAGCAGCGAG  814
            ||||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|   ||||.|
Sbjct  621  CTTGCAAAATTGGTCTCATGTGTTAAGCTATGTCAGCAAGGCCGAGTCTACTCCAGAGATTGCTG---AGCGGG  691

Query  815  GAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCAGAGCTGGCCGCC  888
            |||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  692  GAGAGCGGGACAGCCAGACGCAAGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCTGCAGGCTTGGCTGAGCTGGCCGCA  765

Query  889  AGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCTGAGCTGCTGTC  962
            .|||||||.|||||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  766  CGGAAGTATAAGCAAGCAGCCAAGTGCTTCCTTCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCAGAGCTGCTGTC  839

Query  963  CCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGCTGCAGCGCAATG  1036
            |||||||||.|||||..||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  840  CCCCAGCAATGTGGCTGTCTATGGTGGCCTGTGTGCCTTAGCCACCTTTGACCGGCAGGAGCTGCAACGAAATG  913

Query 1037  TCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATCTTCAAATTCTAC  1110
            |||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct  914  TCATCTCCAGCAGTTCCTTCAAGCTGTTCCTGGAGCTGGAGCCACAGGTCAGAGACATCATCTTCAAATTCTAT  987

Query 1111  GAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGACAACCTGCTCCTGGACATGTATCTGGC  1184
            ||.||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  988  GAATCCAAGTATGCCTCATGCTTGAAGATGCTGGACGAGATGAAGGATAACCTGCTCCTGGACATGTACCTGGC  1061

Query 1185  CCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCCCCTACGTGTCAG  1258
            |||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1062  CCCTCACGTCAGGACACTGTACACCCAGATTCGTAACCGGGCTCTTATCCAATACTTCAGCCCCTATGTGTCAG  1135

Query 1259  CCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTGACGCAGCTAATC  1332
            |.||.|||||.|.||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1136  CTGATATGCACAAGATGGCTGCAGCCTTCAACACAACAGTTGCAGCTCTGGAAGATGAGCTGACACAGCTCATT  1209

Query 1333  CTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGTGGATCAGCGCAG  1406
            ||||||||.||.||.|.||||||..|.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1210  CTGGAGGGCCTTATTAATGCCCGCATCGACTCACACAGCAAGATACTGTATGCTCGAGATGTGGATCAGCGTAG  1283

Query 1407  CACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGATGCTGCGGGCAG  1480
            ||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.|||.|.||||
Sbjct 1284  CACCACCTTTGAGAAGTCCCTGCTGATGGGCAAGGAATTCCAACGACGTGCCAAAGCTATGATTCTGAGAGCAG  1357

Query 1481  CTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCTGACTCCAGCCAAC  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  CTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGTCTCCTCCTAGAGAAGGGAGCCAAGGGGAGCTGACTCCAGCCAAC  1431

Query 1555  AGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1581
            ||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1432  AGCCAGTCACGCATGAGTACCAACATG  1458