Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00683
• Subject: XM_024450723.1
• Aligned Length: 1749
• Identities: 1413
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGAGGGATAGCTCGGCCCCCAGCTCGGCCTCCTCGTCAGTGACAGATCTGTACTGCACCCCTCACAGCAGTAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCAGACCTCGTCCTGCCCGGCACGGCCGGGGACTTCAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGTACGCTGCTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACGAGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  222
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  54

Query  223  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  128

Query  297  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  202

Query  371  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCAC------------CAGGGAG  432
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||
Sbjct  203  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGTCCTCTCTCAGGGAG  276

Query  433  CTGCAGAACGCACCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGC  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  CTGCAGAACGCACCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGC  350

Query  507  CACGCGGAAGAAGGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCA  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  CACGCGGAAGAAGGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCA  424

Query  581  AAGAGAGCATCCGGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTC  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  AAGAGAGCATCCGGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTC  498

Query  655  AAGTGCTATTCCCGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  AAGTGCTATTCCCGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAA  572

Query  729  GGTCAGCGTCTACTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  GGTCAGCGTCTACTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTG  646

Query  803  CCGAGCAGCGAGGAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCA  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  CCGAGCAGCGAGGAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCA  720

Query  877  GAGCTGGCCGCCAGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  GAGCTGGCCGCCAGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCC  794

Query  951  TGAGCTGCTGTCCCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGC  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  TGAGCTGCTGTCCCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGC  868

Query 1025  TGCAGCGCAATGTCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATC  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  TGCAGCGCAATGTCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATC  942

Query 1099  TTCAAATTCTACGAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGA-------------------  1153
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  943  TTCAAATTCTACGAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGTGGGCCCCGCCTGGGG  1016

Query 1154  -----------------------------------------------------------AGGACAACCTGCTCC  1168
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct 1017  TAGGGGTGAGGTGGGGCCCTGCCTGGCCTCCTGTCCTGGTCCTGACCAGCCCCTTCCCCAGGACAACCTGCTCC  1090

Query 1169  TGGACATGTATCTGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTC  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091  TGGACATGTATCTGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTC  1164

Query 1243  AGCCCCTACGTGTCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGA  1316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165  AGCCCCTACGTGTCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGA  1238

Query 1317  GCTGACGCAGCTAATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGG  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239  GCTGACGCAGCTAATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGG  1312

Query 1391  ACGTGGATCAGCGCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCC  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313  ACGTGGATCAGCGCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCC  1386

Query 1465  ATGATGCTGCGGGCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCA-------------------------------  1507
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 1387  ATGATGCTGCGGGCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGGTGGGCTGGCTTGAGGGGGGGCAGGCGCA  1460

Query 1508  -----------------------------------------------AGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGG  1534
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461  CGGCGTGTGGGGCCTGGTGGCTGTGAGCTGCTCCTTGTCTCCCCTGCAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGG  1534

Query 1535  GGGAGCTGACTCCAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1581
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535  GGGAGCTGACTCCAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1581