Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00683
• Subject: XM_024450724.1
• Aligned Length: 1749
• Identities: 1410
• Gaps: 339

Alignment

Query    1  ATGAGGGATAGCTCGGCCCCCAGCTCGGCCTCCTCGTCAGTGACAGATCTGTACTGCACCCCTCACAGCAGTAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCAGACCTCGTCCTGCCCGGCACGGCCGGGGACTTCAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGTACGCTGCTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACGAGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  222
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  54

Query  223  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  128

Query  297  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  202

Query  371  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCAC------------CAGGGAG  432
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||
Sbjct  203  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGTCCTCTCTCAGGGAG  276

Query  433  CTGCAGAACGCACCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGC  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  CTGCAGAACGCACCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGC  350

Query  507  CACGCGGAAGAAGGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCA  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  CACGCGGAAGAAGGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCA  424

Query  581  AAGAGAGCATCCGGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTC  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  AAGAGAGCATCCGGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTC  498

Query  655  AAGTGCTATTCCCGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  AAGTGCTATTCCCGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAA  572

Query  729  GGTCAGCGTCTACTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  GGTCAGCGTCTACTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTG  646

Query  803  CCGAGCAGCGAGGAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCA  876
            |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  CCG---AGCGAGGAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCA  717

Query  877  GAGCTGGCCGCCAGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  GAGCTGGCCGCCAGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCC  791

Query  951  TGAGCTGCTGTCCCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGC  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  TGAGCTGCTGTCCCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGC  865

Query 1025  TGCAGCGCAATGTCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATC  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  TGCAGCGCAATGTCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATC  939

Query 1099  TTCAAATTCTACGAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGA-------------------  1153
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  940  TTCAAATTCTACGAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGTGGGCCCCGCCTGGGG  1013

Query 1154  -----------------------------------------------------------AGGACAACCTGCTCC  1168
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct 1014  TAGGGGTGAGGTGGGGCCCTGCCTGGCCTCCTGTCCTGGTCCTGACCAGCCCCTTCCCCAGGACAACCTGCTCC  1087

Query 1169  TGGACATGTATCTGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTC  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  TGGACATGTATCTGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTC  1161

Query 1243  AGCCCCTACGTGTCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGA  1316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162  AGCCCCTACGTGTCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGA  1235

Query 1317  GCTGACGCAGCTAATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGG  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236  GCTGACGCAGCTAATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGG  1309

Query 1391  ACGTGGATCAGCGCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCC  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310  ACGTGGATCAGCGCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCC  1383

Query 1465  ATGATGCTGCGGGCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCA-------------------------------  1507
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 1384  ATGATGCTGCGGGCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGGTGGGCTGGCTTGAGGGGGGGCAGGCGCA  1457

Query 1508  -----------------------------------------------AGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGG  1534
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458  CGGCGTGTGGGGCCTGGTGGCTGTGAGCTGCTCCTTGTCTCCCCTGCAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGG  1531

Query 1535  GGGAGCTGACTCCAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1581
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532  GGGAGCTGACTCCAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1578