Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00683
• Subject: XM_024450726.1
• Aligned Length: 1737
• Identities: 1413
• Gaps: 324

Alignment

Query    1  ATGAGGGATAGCTCGGCCCCCAGCTCGGCCTCCTCGTCAGTGACAGATCTGTACTGCACCCCTCACAGCAGTAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCAGACCTCGTCCTGCCCGGCACGGCCGGGGACTTCAGCCTGAGCGCCAGCCTGTCGGCCTGTACGCTGCTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACGAGGGGGCCGTGGAGCCCATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  222
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGCAGATCGACGTGGACCCCCAGGAAGACCCGCAGAATGCACCTGACGTCAAC  54

Query  223  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  TACGTGGTGGAGAACCCCAGCCTGGATCTGGAACAGTACGCGGCCAGCTACAGCGGCCTGATGCGCATCGAACG  128

Query  297  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  GCTGCAGTTCATTGCTGATCACTGCCCCACGCTGCGGGTGGAGGCCCTGAAGATGGCCCTCTCCTTCGTGCAGA  202

Query  371  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGGAGCTGCAGAACGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  GAACCTTTAACGTGGACATGTACGAGGAGATCCACCGCAAGCTCTCAGAGGCCACCAGGGAGCTGCAGAACGCA  276

Query  445  CCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGCCACGCGGAAGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  CCCGACGCCATCCCTGAGAGCGGCGTGGAGCCCCCAGCCCTGGACACGGCCTGGGTGGAGGCCACGCGGAAGAA  350

Query  519  GGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCAAAGAGAGCATCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  GGCGCTGCTGAAGCTGGAGAAGCTGGACACAGACCTGAAGAACTACAAGGGCAACTCCATCAAAGAGAGCATCC  424

Query  593  GGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTCAAGTGCTATTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  GGCGCGGCCACGACGACCTGGGCGACCACTACCTGGACTGTGGGGACCTCAGCAACGCCCTCAAGTGCTATTCC  498

Query  667  CGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAAGGTCAGCGTCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  CGGGCCCGGGACTACTGCACCAGCGCCAAACACGTCATCAACATGTGCCTCAATGTCATCAAGGTCAGCGTCTA  572

Query  741  CTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTGCCGAGCAGCGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  573  CTTGCAGAATTGGTCTCATGTGCTCAGCTACGTCAGCAAGGCTGAGTCCACCCCAGAGATTGCCGAGCAGCGAG  646

Query  815  GAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCAGAGCTGGCCGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  GAGAGCGTGACAGCCAGACCCAGGCCATCCTCACCAAGCTCAAGTGTGCCGCAGGCTTGGCAGAGCTGGCCGCC  720

Query  889  AGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCTGAGCTGCTGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721  AGGAAGTACAAGCAGGCTGCCAAGTGCCTCCTGCTGGCTTCCTTTGATCACTGTGACTTCCCTGAGCTGCTGTC  794

Query  963  CCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGCTGCAGCGCAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  CCCCAGCAACGTGGCCATCTACGGTGGCCTGTGCGCCTTGGCTACCTTTGACCGGCAGGAGCTGCAGCGCAATG  868

Query 1037  TCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATCTTCAAATTCTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  TCATCTCCAGCAGCTCCTTCAAGTTGTTCTTGGAGCTGGAGCCACAGGTCCGAGACATCATCTTCAAATTCTAC  942

Query 1111  GAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGA-------------------------------  1153
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  943  GAGTCCAAGTACGCCTCATGTCTCAAGATGCTGGACGAGATGAAGGTGGGCCCCGCCTGGGGTAGGGGTGAGGT  1016

Query 1154  -----------------------------------------------AGGACAACCTGCTCCTGGACATGTATC  1180
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017  GGGGCCCTGCCTGGCCTCCTGTCCTGGTCCTGACCAGCCCCTTCCCCAGGACAACCTGCTCCTGGACATGTATC  1090

Query 1181  TGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCCCCTACGTG  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091  TGGCCCCCCATGTCAGGACCCTGTACACCCAGATTCGCAACCGTGCCCTCATCCAGTATTTCAGCCCCTACGTG  1164

Query 1255  TCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTGACGCAGCT  1328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165  TCAGCCGACATGCATAGGATGGCGGCAGCCTTCAATACCACGGTGGCCGCCCTGGAGGACGAGCTGACGCAGCT  1238

Query 1329  AATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGTGGATCAGC  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239  AATCCTGGAGGGGCTGATCAGTGCCCGTGTGGACTCACACAGCAAGATCCTATACGCCCGGGACGTGGATCAGC  1312

Query 1403  GCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGATGCTGCGG  1476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313  GCAGCACCACCTTTGAGAAGTCTCTGTTGATGGGCAAGGAGTTCCAGCGCCGCGCCAAGGCCATGATGCTGCGG  1386

Query 1477  GCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCA-------------------------------------------  1507
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct 1387  GCAGCTGTGCTCCGCAACCAGATCCATGTCAAGGTGGGCTGGCTTGAGGGGGGGCAGGCGCACGGCGTGTGGGG  1460

Query 1508  -----------------------------------AGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCTGACTC  1546
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461  CCTGGTGGCTGTGAGCTGCTCCTTGTCTCCCCTGCAGTCCCCGCCCAGAGAAGGGAGCCAGGGGGAGCTGACTC  1534

Query 1547  CAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1581
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535  CAGCCAACAGCCAGTCCCGGATGAGCACCAACATG  1569