Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00693
• Subject: XM_006525663.3
• Aligned Length: 2390
• Identities: 2085
• Gaps: 70

Alignment

Query    1  ATGGACTCCAAAGAATCATTAACT---CCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAGGGG  71
            |||||||||||||||||.|||.||   |||||||||||.|||..||||||||||.||||||..|.||.||||||
Sbjct    1  ATGGACTCCAAAGAATCCTTAGCTCCCCCTGGTAGAGACGAAGTCCCCAGCAGTTTGCTTGGCCGGGGGAGGGG  74

Query   72  AGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGG  145
            |...|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct   75  AAGCGTGATGGACTTGTATAAAACCCTGAGGGGTGGAGCTACAGTCAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCAGTGG  148

Query  146  CTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCAAGCAGC-GAAGACTTTTGGTTGATTTTCCAAAAGGCTCAGTAAGCAATGC  218
            |||..||||||||..||||.|||||||||| ||.|| ||.|..||||||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CTGCTGCTTCTCAGGCAGATTCCAAGCAGCAGAGGA-TTCTCCTTGATTTTTCAAAAGGCTCAGCAAGCAATGC  221

Query  219  GCA---------------------------------------------------GCAGCCAGATCTGTCCAAAG  241
            |||                                                   ||||||||||.|.|||||||
Sbjct  222  GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCCAGATTTATCCAAAG  295

Query  242  CAGTTTCACTCTCAATGGGACTGTATATGGGAGAGACAGAAACAAAAGTGATGGGAAATGACCTGGGATTCCCA  315
            |.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|.||||
Sbjct  296  CCGTTTCACTGTCCATGGGACTGTATATGGGAGAGACCGAAACAAAAGTGATGGGGAATGACTTGGGCTACCCA  369

Query  316  CAGCAGGGCCAAATCAGCCTTTCCTCGGGGGAAACAGACTTAAAGCTTTTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAA  389
            |||||||||||..|..||||.|||||.||||||||||||||...||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CAGCAGGGCCAGCTTGGCCTCTCCTCTGGGGAAACAGACTTTCGGCTTCTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAA  443

Query  390  TAGGTCGACCAGTGTTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAGCATCCACTGCTGTGTCTGCTGCCCCCACAGAGAAGG  463
            ||||||||||||...||||||||||||||||||||||.||.|..|.||||.||.||||.||||.||||||||||
Sbjct  444  TAGGTCGACCAGCCGTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAACACCTGCAGCTGGGTGTGCTACCCCGACAGAGAAGG  517

Query  464  AGTTTCCAAAAACTCACTCTGATGTATCTTCAGAACAGCAACATTTGAAGGGCCAGACTGGCACCAACGGTGGC  537
            |||||||..|.||||||||||||..||||||||||||||||.||...||..|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  518  AGTTTCCCCAGACTCACTCTGATCCATCTTCAGAACAGCAAAATAGAAAAAGCCAGCCTGGCACCAACGGTGGC  591

Query  538  AATGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATTTTGCAGGATTTGGAGTTTTCTTCTGGGTCCCC  611
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  592  AGTGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATCTTGCAGGATTTGGAGTTTTCTGCCGGGTCCCC  665

Query  612  AGGTAAAGAGACGAATGAGAGTCCTTGGAGATCAGACCTGTTGATAGATGAAAACTGTTTGCTTTCTCCTCTGG  685
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||.|||
Sbjct  666  AGGTAAAGAGACAAACGAGAGTCCTTGGAGGTCAGACCTGTTGATAGATGAAAAC---TTGCTTTCTCCTTTGG  736

Query  686  CGGGAGAAGACGATTCATTCCTTTTGGAAGGAAACTCGAATGAGGACTGCAAGCCTCTCATTTTACCGGACACT  759
            ||||||||||.|||.||||||||.|||||||..||..|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  737  CGGGAGAAGATGATCCATTCCTTCTGGAAGGGGACGTGAATGAGGATTGCAAGCCTCTTATTTTACCGGACACT  810

Query  760  AAACCCAAAATTAAGGATAATGGAGATCTGGTTTTGTCAAGCCCCAGTAATGTAACACTGCCCCAAGTGAAAAC  833
            |||||.||||||.||||||.|||||||....|.||.|||||||||||.|.|||..|||||||||||||||||||
Sbjct  811  AAACCTAAAATTCAGGATACTGGAGATACAATCTTATCAAGCCCCAGCAGTGTGGCACTGCCCCAAGTGAAAAC  884

Query  834  AGAAAAAGAAGATTTCATCGAACTCTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCACAGTTTACTGTC  907
            |||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|
Sbjct  885  AGAGAAAGATGATTTCATTGAGCTTTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCCCGGTTTATTGCC  958

Query  908  AGGCAAGCTTTCCTGGAGCAAATATAATTGGTAATAAAATGTCTGCCATTTCTGTTCATGGTGTGAGTACCTCT  981
            |||||||||||.||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  959  AGGCAAGCTTTTCTGGGACAAATATAATTGGGAATAAAATGTCTGCCATTTCTGTTCATGGCGTGAGTACCTCT  1032

Query  982  GGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAACAGCAGGATCAGAAGCCTATTTTTAA  1055
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1033  GGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAGCAGCAGGATCAGAAGCCTGTTTTTAA  1106

Query 1056  TGTCATTCCACCAATTCCCGTTGGTTCCGAAAATTGGAATAGGTGCCAAGGATCTGGAGATGACAACTTGACTT  1129
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1107  TGTCATTCCACCAATTCCTGTTGGTTCTGAAAACTGGAATAGGTGCCAAGGGTCTGGAGAGGACAACCTGACTT  1180

Query 1130  CTCTGGGGACTCTGAACTTCCCTGGTCGAACAGTTTTTTCTAATGGCTATTCAAGCCCCAGCATGAGACCAGAT  1203
            |..|||||.||.||||||||.|.||.||..||||.|||||||||||.|||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 1181  CCTTGGGGGCTATGAACTTCGCAGGCCGCTCAGTGTTTTCTAATGGATATTCAAGCCCTGGAATGAGACCAGAT  1254

Query 1204  GTAAGCTCTCCTCCATCCAGCTCCTCAACAGCAACAACAGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCTGA  1277
            ||.||.||||||||.|||||||||||.||||   ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1255  GTGAGTTCTCCTCCGTCCAGCTCCTCCACAG---CAACGGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCCGA  1325

Query 1278  TGAAGCTTCAGGATGTCATTATGGAGTCTTAACTTGTGGAAGCTGTAAAGTTTTCTTCAAAAGAGCAGTGGAAG  1351
            |||||||||.|||||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1326  TGAAGCTTCGGGATGCCATTATGGGGTGCTGACGTGTGGAAGCTGTAAAGTCTTCTTTAAAAGAGCAGTGGAAG  1399

Query 1352  ---GACAGCACAATTACCTATGTGCTGGAAGGAATGATTGCATCATCGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGCCCA  1422
               ||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1400  GTAGACAGCACAATTACCTTTGTGCTGGAAGAAATGATTGCATCATTGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGTCCA  1473

Query 1423  GCATGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAGGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACAAAGAAAAAAATAAAAGG  1496
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1474  GCATGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAAGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACGAAGAAAAAAATTAAAGG  1547

Query 1497  AATTCAGCAGGCCACTACAGGAGTCTCACAAGAAACCTCTGAAAATCCTGGTAACAAAACAATAGTTCCTGCAA  1570
            |||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||||   .|.|||||||||||||||||||||..
Sbjct 1548  AATTCAGCAAGCCACTGCAGGAGTCTCACAAGACACTTCTGAAAA---CGCTAACAAAACAATAGTTCCTGCCG  1618

Query 1571  CGTTACCACAACTCACCCCTACCCTGGTGTCACTGTTGGAGGTTATTGAACCTGAAGTGTTATATGCAGGATAT  1644
            ||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1619  CGCTGCCACAGCTTACCCCTACCCTGGTGTCACTGCTGGAGGTGATCGAGCCTGAGGTGTTATATGCAGGATAT  1692

Query 1645  GATAGCTCTGTTCCAGACTCAACTTGGAGGATCATGACTACGCTCAACATGTTAGGAGGGCGGCAAGTGATTGC  1718
            ||.||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1693  GACAGCTCTGTTCCAGACTCAGCATGGAGAATTATGACCACGCTCAACATGTTAGGTGGGCGCCAAGTGATTGC  1766

Query 1719  AGCAGTGAAATGGGCAAAGGCAATACCAGGTTTCAGGAACTTACACCTGGATGACCAAATGACCCTACTGCAGT  1792
            .||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1767  CGCAGTGAAATGGGCAAAGGCGATACCAGGATTCAGAAACTTACACCTGGATGACCAAATGACCCTTCTACAGT  1840

Query 1793  ACTCCTGGATGTTTCTTATGGCATTTGCTCTGGGGTGGAGATCATATAGACAATCAAGTGCAAACCTGCTGTGT  1866
            ||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||||.|||||||||.||.
Sbjct 1841  ACTCATGGATGTTTCTCATGGCATTTGCCCTGGGTTGGAGATCATACAGACAAGCAAGTGGAAACCTGCTATGC  1914

Query 1867  TTTGCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTACGACCAATGTAAACACATGCT  1940
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1915  TTTGCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTATGACCAATGTAAACACATGCT  1988

Query 1941  GTATGTTTCCTCTGAGTTACACAGGCTTCAGGTATCTTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCTTACTGCTTC  2014
            ||.|.|.|||.||||.|||||.||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989  GTTTATCTCCACTGAATTACAAAGATTGCAGGTATCCTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCTTACTGCTTC  2062

Query 2015  TCTCTTCAGTTCCTAAGGACGGTCTGAAGAGCCAAGAGCTATTTGATGAAATTAGAATGACCTACATCAAAGAG  2088
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||.||.|||||||||
Sbjct 2063  TCTCCTCAGTTCCTAAGGAAGGTCTGAAGAGCCAAGAGTTATTTGATGAGATTCGAATGACTTATATCAAAGAG  2136

Query 2089  CTAGGAAAAGCCATTGTCAAGAGGGAAGGAAACTCCAGCCAGAACTGGCAGCGGTTTTATCAACTGACAAAACT  2162
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137  CTAGGAAAAGCCATTGTCAAAAGGGAAGGAAACTCCAGTCAGAATTGGCAGCGGTTTTATCAACTGACAAAACT  2210

Query 2163  CTTGGATTCTATGCATGAAGTGGTTGAAAATCTCCTTAACTATTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGACCATGA  2236
            .|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2211  TTTGGACTCCATGCATGATGTGGTTGAAAATCTCCTTAGCTACTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGTCCATGA  2284

Query 2237  GTATTGAATTCCCCGAGATGTTAGCTGAAATCATCACCAATCAGATACCAAAATATTCAAATGGAAATATCAAA  2310
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2285  GTATTGAATTCCCAGAGATGTTAGCTGAAATCATCACTAATCAGATACCAAAATACTCAAATGGAAATATCAAA  2358

Query 2311  AAACTTCTGTTTCATCA-AAAG  2331
            ||.|||||||||||||| ||| 
Sbjct 2359  AAGCTTCTGTTTCATCAGAAA-  2379