Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00693
• Subject: XM_017317838.1
• Aligned Length: 2387
• Identities: 2085
• Gaps: 67

Alignment

Query    1  ATGGACTCCAAAGAATCATTAACT---CCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAGGGG  71
            |||||||||||||||||.|||.||   |||||||||||.|||..||||||||||.||||||..|.||.||||||
Sbjct    1  ATGGACTCCAAAGAATCCTTAGCTCCCCCTGGTAGAGACGAAGTCCCCAGCAGTTTGCTTGGCCGGGGGAGGGG  74

Query   72  AGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGG  145
            |...|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct   75  AAGCGTGATGGACTTGTATAAAACCCTGAGGGGTGGAGCTACAGTCAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCAGTGG  148

Query  146  CTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCAAGCAGC-GAAGACTTTTGGTTGATTTTCCAAAAGGCTCAGTAAGCAATGC  218
            |||..||||||||..||||.|||||||||| ||.|| ||.|..||||||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CTGCTGCTTCTCAGGCAGATTCCAAGCAGCAGAGGA-TTCTCCTTGATTTTTCAAAAGGCTCAGCAAGCAATGC  221

Query  219  GCA---------------------------------------------------GCAGCCAGATCTGTCCAAAG  241
            |||                                                   ||||||||||.|.|||||||
Sbjct  222  GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCCAGATTTATCCAAAG  295

Query  242  CAGTTTCACTCTCAATGGGACTGTATATGGGAGAGACAGAAACAAAAGTGATGGGAAATGACCTGGGATTCCCA  315
            |.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|.||||
Sbjct  296  CCGTTTCACTGTCCATGGGACTGTATATGGGAGAGACCGAAACAAAAGTGATGGGGAATGACTTGGGCTACCCA  369

Query  316  CAGCAGGGCCAAATCAGCCTTTCCTCGGGGGAAACAGACTTAAAGCTTTTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAA  389
            |||||||||||..|..||||.|||||.||||||||||||||...||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CAGCAGGGCCAGCTTGGCCTCTCCTCTGGGGAAACAGACTTTCGGCTTCTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAA  443

Query  390  TAGGTCGACCAGTGTTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAGCATCCACTGCTGTGTCTGCTGCCCCCACAGAGAAGG  463
            ||||||||||||...||||||||||||||||||||||.||.|..|.||||.||.||||.||||.||||||||||
Sbjct  444  TAGGTCGACCAGCCGTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAACACCTGCAGCTGGGTGTGCTACCCCGACAGAGAAGG  517

Query  464  AGTTTCCAAAAACTCACTCTGATGTATCTTCAGAACAGCAACATTTGAAGGGCCAGACTGGCACCAACGGTGGC  537
            |||||||..|.||||||||||||..||||||||||||||||.||...||..|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  518  AGTTTCCCCAGACTCACTCTGATCCATCTTCAGAACAGCAAAATAGAAAAAGCCAGCCTGGCACCAACGGTGGC  591

Query  538  AATGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATTTTGCAGGATTTGGAGTTTTCTTCTGGGTCCCC  611
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct  592  AGTGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATCTTGCAGGATTTGGAGTTTTCTGCCGGGTCCCC  665

Query  612  AGGTAAAGAGACGAATGAGAGTCCTTGGAGATCAGACCTGTTGATAGATGAAAACTGTTTGCTTTCTCCTCTGG  685
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||.|||
Sbjct  666  AGGTAAAGAGACAAACGAGAGTCCTTGGAGGTCAGACCTGTTGATAGATGAAAAC---TTGCTTTCTCCTTTGG  736

Query  686  CGGGAGAAGACGATTCATTCCTTTTGGAAGGAAACTCGAATGAGGACTGCAAGCCTCTCATTTTACCGGACACT  759
            ||||||||||.|||.||||||||.|||||||..||..|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  737  CGGGAGAAGATGATCCATTCCTTCTGGAAGGGGACGTGAATGAGGATTGCAAGCCTCTTATTTTACCGGACACT  810

Query  760  AAACCCAAAATTAAGGATAATGGAGATCTGGTTTTGTCAAGCCCCAGTAATGTAACACTGCCCCAAGTGAAAAC  833
            |||||.||||||.||||||.|||||||....|.||.|||||||||||.|.|||..|||||||||||||||||||
Sbjct  811  AAACCTAAAATTCAGGATACTGGAGATACAATCTTATCAAGCCCCAGCAGTGTGGCACTGCCCCAAGTGAAAAC  884

Query  834  AGAAAAAGAAGATTTCATCGAACTCTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCACAGTTTACTGTC  907
            |||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|
Sbjct  885  AGAGAAAGATGATTTCATTGAGCTTTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCCCGGTTTATTGCC  958

Query  908  AGGCAAGCTTTCCTGGAGCAAATATAATTGGTAATAAAATGTCTGCCATTTCTGTTCATGGTGTGAGTACCTCT  981
            |||||||||||.||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  959  AGGCAAGCTTTTCTGGGACAAATATAATTGGGAATAAAATGTCTGCCATTTCTGTTCATGGCGTGAGTACCTCT  1032

Query  982  GGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAACAGCAGGATCAGAAGCCTATTTTTAA  1055
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1033  GGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAGCAGCAGGATCAGAAGCCTGTTTTTAA  1106

Query 1056  TGTCATTCCACCAATTCCCGTTGGTTCCGAAAATTGGAATAGGTGCCAAGGATCTGGAGATGACAACTTGACTT  1129
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1107  TGTCATTCCACCAATTCCTGTTGGTTCTGAAAACTGGAATAGGTGCCAAGGGTCTGGAGAGGACAACCTGACTT  1180

Query 1130  CTCTGGGGACTCTGAACTTCCCTGGTCGAACAGTTTTTTCTAATGGCTATTCAAGCCCCAGCATGAGACCAGAT  1203
            |..|||||.||.||||||||.|.||.||..||||.|||||||||||.|||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 1181  CCTTGGGGGCTATGAACTTCGCAGGCCGCTCAGTGTTTTCTAATGGATATTCAAGCCCTGGAATGAGACCAGAT  1254

Query 1204  GTAAGCTCTCCTCCATCCAGCTCCTCAACAGCAACAACAGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCTGA  1277
            ||.||.||||||||.|||||||||||.||||   ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1255  GTGAGTTCTCCTCCGTCCAGCTCCTCCACAG---CAACGGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCCGA  1325

Query 1278  TGAAGCTTCAGGATGTCATTATGGAGTCTTAACTTGTGGAAGCTGTAAAGTTTTCTTCAAAAGAGCAGTGGAAG  1351
            |||||||||.|||||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1326  TGAAGCTTCGGGATGCCATTATGGGGTGCTGACGTGTGGAAGCTGTAAAGTCTTCTTTAAAAGAGCAGTGGAAG  1399

Query 1352  GACAGCACAATTACCTATGTGCTGGAAGGAATGATTGCATCATCGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGCCCAGCA  1425
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1400  GACAGCACAATTACCTTTGTGCTGGAAGAAATGATTGCATCATTGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGTCCAGCA  1473

Query 1426  TGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAGGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACAAAGAAAAAAATAAAAGGAAT  1499
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1474  TGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAAGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACGAAGAAAAAAATTAAAGGAAT  1547

Query 1500  TCAGCAGGCCACTACAGGAGTCTCACAAGAAACCTCTGAAAATCCTGGTAACAAAACAATAGTTCCTGCAACGT  1573
            ||||||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||||   .|.|||||||||||||||||||||..||.
Sbjct 1548  TCAGCAAGCCACTGCAGGAGTCTCACAAGACACTTCTGAAAA---CGCTAACAAAACAATAGTTCCTGCCGCGC  1618

Query 1574  TACCACAACTCACCCCTACCCTGGTGTCACTGTTGGAGGTTATTGAACCTGAAGTGTTATATGCAGGATATGAT  1647
            |.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1619  TGCCACAGCTTACCCCTACCCTGGTGTCACTGCTGGAGGTGATCGAGCCTGAGGTGTTATATGCAGGATATGAC  1692

Query 1648  AGCTCTGTTCCAGACTCAACTTGGAGGATCATGACTACGCTCAACATGTTAGGAGGGCGGCAAGTGATTGCAGC  1721
            ||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 1693  AGCTCTGTTCCAGACTCAGCATGGAGAATTATGACCACGCTCAACATGTTAGGTGGGCGCCAAGTGATTGCCGC  1766

Query 1722  AGTGAAATGGGCAAAGGCAATACCAGGTTTCAGGAACTTACACCTGGATGACCAAATGACCCTACTGCAGTACT  1795
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1767  AGTGAAATGGGCAAAGGCGATACCAGGATTCAGAAACTTACACCTGGATGACCAAATGACCCTTCTACAGTACT  1840

Query 1796  CCTGGATGTTTCTTATGGCATTTGCTCTGGGGTGGAGATCATATAGACAATCAAGTGCAAACCTGCTGTGTTTT  1869
            |.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||||.|||||||||.||.|||
Sbjct 1841  CATGGATGTTTCTCATGGCATTTGCCCTGGGTTGGAGATCATACAGACAAGCAAGTGGAAACCTGCTATGCTTT  1914

Query 1870  GCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTACGACCAATGTAAACACATGCTGTA  1943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1915  GCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTATGACCAATGTAAACACATGCTGTT  1988

Query 1944  TGTTTCCTCTGAGTTACACAGGCTTCAGGTATCTTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCTTACTGCTTCTCT  2017
            |.|.|||.||||.|||||.||..|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989  TATCTCCACTGAATTACAAAGATTGCAGGTATCCTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCTTACTGCTTCTCT  2062

Query 2018  CTTCAGTTCCTAAGGACGGTCTGAAGAGCCAAGAGCTATTTGATGAAATTAGAATGACCTACATCAAAGAGCTA  2091
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2063  CCTCAGTTCCTAAGGAAGGTCTGAAGAGCCAAGAGTTATTTGATGAGATTCGAATGACTTATATCAAAGAGCTA  2136

Query 2092  GGAAAAGCCATTGTCAAGAGGGAAGGAAACTCCAGCCAGAACTGGCAGCGGTTTTATCAACTGACAAAACTCTT  2165
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2137  GGAAAAGCCATTGTCAAAAGGGAAGGAAACTCCAGTCAGAATTGGCAGCGGTTTTATCAACTGACAAAACTTTT  2210

Query 2166  GGATTCTATGCATGAAGTGGTTGAAAATCTCCTTAACTATTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGACCATGAGTA  2239
            |||.||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2211  GGACTCCATGCATGATGTGGTTGAAAATCTCCTTAGCTACTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGTCCATGAGTA  2284

Query 2240  TTGAATTCCCCGAGATGTTAGCTGAAATCATCACCAATCAGATACCAAAATATTCAAATGGAAATATCAAAAAA  2313
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2285  TTGAATTCCCAGAGATGTTAGCTGAAATCATCACTAATCAGATACCAAAATACTCAAATGGAAATATCAAAAAG  2358

Query 2314  CTTCTGTTTCATCA-AAAG  2331
            |||||||||||||| ||| 
Sbjct 2359  CTTCTGTTTCATCAGAAA-  2376