Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00739
• Subject: NM_133879.2
• Aligned Length: 2067
• Identities: 1789
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGCGGGAGAAGGGCCAGTA  74
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGTTCCTTCGTGCAGCACAGCGTGAGGGTTCTGCAGGAACTCAACAAGCAGCGCGAGAAGGGCCAGTA  74

Query   75  CTGCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTTGCCTGCTGCAGTCACT  148
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct   75  TTGCGACGCCACACTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTCAAGGCGCACTGGAGTGTCCTGGCGTGTTGCAGCCATT  148

Query  149  TTTTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTTCGCTGAGATCTTTGGC  222
            |.||||||||..||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct  149  TCTTCCAGAGAATCTACGGGGATGGCACAGGGGGCAGCGTTGTCCTCCCAGCGGGCTTTGCTGAGATTTTTGGC  222

Query  223  CTCTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATCAGGTGCTCCTGGCAGC  296
            |||.||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||
Sbjct  223  CTCCTGCTGGACTTTTTCTACACTGGCCACCTCGCCCTCACCTCAGGGAACAGGGATCAGGTACTCTTGGCAGC  296

Query  297  CAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACTTCAGTGGGACAGGCAG  370
            ||..||||||.|.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||.||||.||||||||||||||| 
Sbjct  297  CAAAGAGTTGAGGGTGCCTGAGGCTGTGGAGCTATGTCAGAGCTTCCAGCCCCAAACCTCAGTGGGACAGGCA-  369

Query  371  CAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAAGGAGCCGGCAGGCTTG  444
                    ||||||||.|||||.|..||||||||||||.|.|||||.||||||.|.|||||||||.|||.||||
Sbjct  370  --------CAGAGTGGACTGGGTCAACCTGCCTCCCAGGACGTGAAAAGCCACCTGAAGGAGCCGACAGACTTG  435

Query  445  GAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAGGCAGTCATAGTCCTCA  518
            ||.||.||||||||||..|||||||||.|.||.|.|.||..|||||||||||||||||.||         ||.|
Sbjct  436  GATGAGGAGGAAGTTTTCAGGACTCTGAGCCTGGCCTCCGTGGATCAGGAGCCCAGAGACA---------CTGA  500

Query  519  GAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCC---TCCTCCCTCTGTGGGAAACTGAAGCAGGCCT  589
            |..|||||||||...|.|.||.|||||||      ||.||   .|||.|||||||||||||||.|.||||||.|
Sbjct  501  GCAGCCCCAGCTGGGTACACCTGCTCAGA------GCACCACGGCCTTCCTCTGTGGGAAACTCACGCAGGCTT  568

Query  590  TGAAGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCTTAGAGGCTGAAGGT  663
            |||||||||.||||...||||||||..|..|.|||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct  569  TGAAGCCTTCTCCCTCAGAGGACAAAGAGTCTGAGGACTGCAAAGAGCCCCCAAGGCCCTTCGAGGCTGGAGGT  642

Query  664  GCCCAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGGGATGGCGATTACAT  737
            ||||.|||||||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..||||.||.||||||.|
Sbjct  643  GCCCCGCTGCAGGGCGAGAGCAATGAGTGGGAAGTGGTGGTCCAAGTGGAGGACGACAGGGACGGTGATTACGT  716

Query  738  GTCTGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGCAGCTGAGCCAGCCC  811
            .||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.||.||..||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  717  ATCTGAGCCTGAGACTGTGCTAACCAGAAGGAAGTCAAAAGTGATTAGAAAACCCTGTGCAGCCGAGCCAGCCC  790

Query  812  TGAGCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGGTCGAATGCCCCACA  885
            ||.|.|||||.||.||..||||.|||||..||||.|.||||||||||.||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  791  TGGGTGCGGGTTCTCTCACAGCCGAGCCCACTGACAGCAGAAAAGGTGCAGCCGTTCCGGTCGAATGTCCCACA  864

Query  886  TGTCATAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGGGAGAAACCCTTTGA  959
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  865  TGTCACAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTACCTGAAAGTCCACAACAGGAAACACACTGGGGAGAAACCCTTCGA  938

Query  960  GTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCGGAATTGCATGAACC  1033
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  939  GTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTCCGCAAGGAGAATCTCTTGGAACATGAAGCCAGGAATTGCATGAACC  1012

Query 1034  GCTCGGAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGCTGCGGGTGCACATG  1107
            ||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||..||||||||
Sbjct 1013  GCTCAGAACAGGTCTTCACATGCTCCGTATGCCAGGAGACCTTCCGACGGAGGATGGAGCTGCGCTTGCACATG  1086

Query 1108  GTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAGGACTTGCA  1181
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1087  GTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAAGACTTGCA  1160

Query 1182  GAGCCACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTC  1255
            |||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 1161  GAGCCACATGATCAAGCTGCACGGAGCCCCTAAACCCCACGCATGCCCCACTTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTA  1234

Query 1256  GGACAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTGAGGAGTGTGGGCAC  1329
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1235  GGACGGAGCTACAGCTGCACGAGGCTTTTAAGCATCGTGGAGAAAAGCTCTTTGTGTGTGAGGAATGCGGGCAC  1308

Query 1330  CGGGCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGGCCACACGTATGTGA  1403
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||.|||||
Sbjct 1309  CGGGCCTCGAGCCGCAACGGACTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAAAGGCCTTATGTCTGTGA  1382

Query 1404  GTTCTGCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACACACGGGTGAGAAGCCCT  1477
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1383  GTTCTGCAGCCATGCCTTCACCCAGAAGGCCAACCTCAACATGCACCTGCGCACACACACCGGCGAGAAGCCTT  1456

Query 1478  TCCAGTGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAACCCAAGCCAGCCTGGACAAGCACAACCGCACCCACACCGGG  1551
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1457  TCCAGTGCCACCTCTGTGGGAAGACCTTCCGCACCCAAGCCAGTTTGGACAAGCACAACCGCACCCACACGGGC  1530

Query 1552  GAAAGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCCTGAGGCACGTGGCCAG  1625
            ||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1531  GAGAGGCCTTTCAGCTGTGAATTCTGTGAGCAGCGCTTCACTGAGAAGGGCCCCCTTCTGAGGCATGTGGCCAG  1604

Query 1626  CCGCCATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCCGTGGAGCAACTGCGTG  1699
            |||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||..|.||.|
Sbjct 1605  CCGCCATCAAGAGGGCAGGCCCCACTTCTGCCAGATCTGTGGCAAGACCTTCAAAGCTGTGGAACAGTTACGAG  1678

Query 1700  TGCACGTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTTACCCGACAGGCC  1773
            ||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 1679  TGCACGTCAGGCGACACAAAGGTGTGAGAAAGTTCGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTCACGCGGCAGGCT  1752

Query 1774  CACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGCGCAAGCTCCGCAACCT  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1753  CACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACAGAGTGGAGAACTACAATCCCCGGCAGCGCAAGCTCCGGAACCT  1826

Query 1848  GATCATCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGTGGGCTCGGCGGAGG  1921
            .|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1827  CATCATTGAGGATGAGAAGATGGTGGTCGTGGCTCTCCAGCCCCCTGCAGACCTGGAGGTGGGCTCTGCTGAGG  1900

Query 1922  TCATTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACTGTGTGCAGAGGAGAGC  1995
            |||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||..||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1901  TCATTGTGGAGTCCCTGACCCAGGGTGGCCTTGCCTCCCAACTCCCTAGCCAGAGACTGTGTTCAGAGGAGAGC  1974

Query 1996  TTCACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGGACTGTGACACA  2064
            ||..|..||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1975  TTTGCTAGCCCTGGCGTCCTGGAGCCCTCTCTCATCATCACCGCTGCTGTTCCCGAGGACTGTGACACG  2043