Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00739
• Subject: XM_017319883.1
• Aligned Length: 2325
• Identities: 1791
• Gaps: 285

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGCAAGTGTCCATCTCACTCTCGGTCCAAAAGGGCTTTTCCGATTGGGGCTGAGCAGAGGGGTCATGTTTG  74

Query    1  ----------------ATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGC  58
                            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  CCTTCCCTTTCAGATTATGGACGGTTCCTTCGTGCAGCACAGCGTGAGGGTTCTGCAGGAACTCAACAAGCAGC  148

Query   59  GGGAGAAGGGCCAGTACTGCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTT  132
            |.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  149  GCGAGAAGGGCCAGTATTGCGACGCCACACTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTCAAGGCGCACTGGAGTGTCCTG  222

Query  133  GCCTGCTGCAGTCACTTTTTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTT  206
            ||.||.|||||.||.||.||||||||..||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  223  GCGTGTTGCAGCCATTTCTTCCAGAGAATCTACGGGGATGGCACAGGGGGCAGCGTTGTCCTCCCAGCGGGCTT  296

Query  207  CGCTGAGATCTTTGGCCTCTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATC  280
            .||||||||.|||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct  297  TGCTGAGATTTTTGGCCTCCTGCTGGACTTTTTCTACACTGGCCACCTCGCCCTCACCTCAGGGAACAGGGATC  370

Query  281  AGGTGCTCCTGGCAGCCAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACT  354
            ||||.|||.|||||||||..||||||.|.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||.||||.
Sbjct  371  AGGTACTCTTGGCAGCCAAAGAGTTGAGGGTGCCTGAGGCTGTGGAGCTATGTCAGAGCTTCCAGCCCCAAACC  444

Query  355  TCAGTGGGACAGGCAGCAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAA  428
            |||||||||||||||         ||||||||.|||||.|..||||||||||||.|.|||||.||||||.|.||
Sbjct  445  TCAGTGGGACAGGCA---------CAGAGTGGACTGGGTCAACCTGCCTCCCAGGACGTGAAAAGCCACCTGAA  509

Query  429  GGAGCCGGCAGGCTTGGAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAG  502
            |||||||.|||.||||||.||.||||||||||..|||||||||.|.||.|.|.||..|||||||||||||||||
Sbjct  510  GGAGCCGACAGACTTGGATGAGGAGGAAGTTTTCAGGACTCTGAGCCTGGCCTCCGTGGATCAGGAGCCCAGAG  583

Query  503  GCAGTCATAGTCCTCAGAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCC---TCCTCCCTCTGTGGG  573
            .||         ||.||..|||||||||...|.|.||.|||||||      ||.||   .|||.||||||||||
Sbjct  584  ACA---------CTGAGCAGCCCCAGCTGGGTACACCTGCTCAGA------GCACCACGGCCTTCCTCTGTGGG  642

Query  574  AAACTGAAGCAGGCCTTGAAGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCC  647
            |||||.|.||||||.||||||||||.||||...||||||||..|..|.|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  643  AAACTCACGCAGGCTTTGAAGCCTTCTCCCTCAGAGGACAAAGAGTCTGAGGACTGCAAAGAGCCCCCAAGGCC  716

Query  648  CTTAGAGGCTGAAGGTGCCCAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATG  721
            |||.|||||||.||||||||.|||||||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..
Sbjct  717  CTTCGAGGCTGGAGGTGCCCCGCTGCAGGGCGAGAGCAATGAGTGGGAAGTGGTGGTCCAAGTGGAGGACGACA  790

Query  722  GGGATGGCGATTACATGTCTGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGT  795
            ||||.||.||||||.|.||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.||.||..||||.||||||
Sbjct  791  GGGACGGTGATTACGTATCTGAGCCTGAGACTGTGCTAACCAGAAGGAAGTCAAAAGTGATTAGAAAACCCTGT  864

Query  796  GCAGCTGAGCCAGCCCTGAGCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCC  869
            |||||.||||||||||||.|.|||||.||.||..||||.|||||..||||.|.||||||||||.||||.||.||
Sbjct  865  GCAGCCGAGCCAGCCCTGGGTGCGGGTTCTCTCACAGCCGAGCCCACTGACAGCAGAAAAGGTGCAGCCGTTCC  938

Query  870  GGTCGAATGCCCCACATGTCATAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTG  943
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  939  GGTCGAATGTCCCACATGTCACAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTACCTGAAAGTCCACAACAGGAAACACACTG  1012

Query  944  GGGAGAAACCCTTTGAGTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCC  1017
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||||||
Sbjct 1013  GGGAGAAACCCTTCGAGTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTCCGCAAGGAGAATCTCTTGGAACATGAAGCC  1086

Query 1018  CGGAATTGCATGAACCGCTCGGAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGA  1091
            .|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1087  AGGAATTGCATGAACCGCTCAGAACAGGTCTTCACATGCTCCGTATGCCAGGAGACCTTCCGACGGAGGATGGA  1160

Query 1092  GCTGCGGGTGCACATGGTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGC  1165
            ||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161  GCTGCGCTTGCACATGGTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGC  1234

Query 1166  AGAAGAAGGACTTGCAGAGCCACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCA---------------  1224
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||               
Sbjct 1235  AGAAGAAAGACTTGCAGAGCCACATGATCAAGCTGCACGGAGCCCCTAAACCCCACGCAGTAAGTGCCAGTCAG  1308

Query 1225  --------------------------------------------------------------------------  1224
                                                                                      
Sbjct 1309  GGCTGGGGTTCCGGTGGCTCTGGGACAGCTCAATCCTGTCCTCACCTGGATGTGCTCCCTCTGCCTGTCTCACC  1382

Query 1225  ---------TGCCCCACCTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTCGGACAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCA  1289
                     ||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1383  CACCTGCAGTGCCCCACTTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTAGGACGGAGCTACAGCTGCACGAGGCTTTTAAGCA  1456

Query 1290  CCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTGAGGAGTGTGGGCACCGGGCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACA  1363
            .|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1457  TCGTGGAGAAAAGCTCTTTGTGTGTGAGGAATGCGGGCACCGGGCCTCGAGCCGCAACGGACTGCAGATGCACA  1530

Query 1364  TCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGGCCACACGTATGTGAGTTCTGCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAAT  1437
            ||||||||||||||||||||||.|||||..|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1531  TCAAGGCCAAGCACAGGAATGAAAGGCCTTATGTCTGTGAGTTCTGCAGCCATGCCTTCACCCAGAAGGCCAAC  1604

Query 1438  CTCAACATGCACCTGCGCACACACACGGGTGAGAAGCCCTTCCAGTGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAAC  1511
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1605  CTCAACATGCACCTGCGCACACACACCGGCGAGAAGCCTTTCCAGTGCCACCTCTGTGGGAAGACCTTCCGCAC  1678

Query 1512  CCAAG-----------CCAGCC----------------------------------------------------  1522
            |||||           ||||||                                                    
Sbjct 1679  CCAAGGTGAGGCAGGCCCAGCCCCTCCTTGCCCCAGGGCTGAGACAGCCACTGAGTTCCACCTTGTCCCCCATA  1752

Query 1523  -------TGGACAAGCACAACCGCACCCACACCGGGGAAAGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTT  1589
                   |||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1753  GCCAGTTTGGACAAGCACAACCGCACCCACACGGGCGAGAGGCCTTTCAGCTGTGAATTCTGTGAGCAGCGCTT  1826

Query 1590  CACTGAGAAGGGGCCCCTCCTGAGGCACGTGGCCAGCCGCCATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATAT  1663
            ||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct 1827  CACTGAGAAGGGCCCCCTTCTGAGGCATGTGGCCAGCCGCCATCAAGAGGGCAGGCCCCACTTCTGCCAGATCT  1900

Query 1664  GCGGCAAGACCTTCAAAGCCGTGGAGCAACTGCGTGTGCACGTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAG  1737
            |.|||||||||||||||||.|||||.||..|.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1901  GTGGCAAGACCTTCAAAGCTGTGGAACAGTTACGAGTGCACGTCAGGCGACACAAAGGTGTGAGAAAGTTCGAG  1974

Query 1738  TGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTTACCCGACAGGCCCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGA  1811
            |||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||
Sbjct 1975  TGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTCACGCGGCAGGCTCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACAGAGTGGA  2048

Query 1812  GAACTACAACCCGCGGCAGCGCAAGCTCCGCAACCTGATCATCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGC  1885
            |||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 2049  GAACTACAATCCCCGGCAGCGCAAGCTCCGGAACCTCATCATTGAGGATGAGAAGATGGTGGTCGTGGCTCTCC  2122

Query 1886  AGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGTGGGCTCGGCGGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCC  1959
            ||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||
Sbjct 2123  AGCCCCCTGCAGACCTGGAGGTGGGCTCTGCTGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGACCCAGGGTGGCCTTGCCTCC  2196

Query 1960  CAGCTCCCCGGCCAGAGACTGTGTGCAGAGGAGAGCTTCACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCAT  2033
            ||.|||||..||||||||||||||.|||||||||||||..|..||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2197  CAACTCCCTAGCCAGAGACTGTGTTCAGAGGAGAGCTTTGCTAGCCCTGGCGTCCTGGAGCCCTCTCTCATCAT  2270

Query 2034  CACAGCTGCTGTCCCCGAGGACTGTGACACA  2064
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2271  CACCGCTGCTGTTCCCGAGGACTGTGACACG  2301