Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00760
- Subject:
- NM_001202234.1
- Aligned Length:
- 1956
- Identities:
- 1794
- Gaps:
- 162
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAAGTGCACAGTATAAAATCAAGATTCTAATTGAAGGCCTCCACCATGGACAGAGGCCAGGCCCTGCCCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCCAGGCAGCCTGGCTCCTTCTGCTGGGCCCTGAAGGCAGACGGGATAATGTGGTTGGCCAAGGCCTGTTGGT 148
Query 1 --------------ATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCAC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCATCCAGAGTGAGATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCAC 222
Query 61 CTGGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGC 134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGC 296
Query 135 TGCCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACC 208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACC 370
Query 209 AGCTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACC 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACC 444
Query 283 TCCCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCC 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCCCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCC 518
Query 357 AGTGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGC 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGC 592
Query 431 CCAGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAA 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAA 666
Query 505 GGCCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAG 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGCCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAG 740
Query 579 TCCTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGC 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGC 814
Query 653 TGGGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGC 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGC 888
Query 727 TCGGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCGGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTG 962
Query 801 TGCTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCA 874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGCTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCA 1036
Query 875 AGCGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGA 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGA 1110
Query 949 AACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAG 1022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAG 1184
Query 1023 CCTGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCA 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCA 1258
Query 1097 CTTCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTG 1170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTTCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTG 1332
Query 1171 GTGCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGA 1244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGA 1406
Query 1245 GGTCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGG 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGTCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGG 1480
Query 1319 AGTCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTC 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGTCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTC 1554
Query 1393 TGCTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTT 1466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGCTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTT 1628
Query 1467 CTCAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCG 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTCAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCG 1702
Query 1541 ACCGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCAC 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACCGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCAC 1776
Query 1615 GTGGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCG 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTGGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCG 1850
Query 1689 GACCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCA 1762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GACCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCA 1924
Query 1763 TTGACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC 1794
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTGACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC 1956