Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00760
• Subject: XM_006520455.1
• Aligned Length: 1911
• Identities: 1548
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACCGGGTTAGCTGAGAAATTCCTTTTGAGAGTTGTCTTTTCTCCAGTCCAGAGACTGCTCTCTGGATCTTC  74

Query    1  ----------------------------------ATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGA  40
                                              |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.|||
Sbjct   75  CTGCTCAGTTCCTCGCCTCCCTTCAATATATGAGATGCCCTGTATTCAAGCTCAATATGGAACACCAGCAACGA  148

Query   41  GTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCC  114
            |.||.|||||.||||||||||||.|..|.||.||||||.|||.|||||||..||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCAGGACCGCGTGACCACCTGACCGGTGATCCCCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGCCTACCATGGACCTGGCC  222

Query  115  AGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGA  188
            |||||||||.||||.||.||.||.||..||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  223  AGCCCCGAGACAGCACCTGCCGCACCTGCTACACTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGGTACACCGGAGA  296

Query  189  GTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCA  262
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||...||||||.|||||||||||.|..|||||.||||||||||
Sbjct  297  GTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCGGGGACGACCCAGCCGTGCTCCTCAGCTTGTTCCTCTGCCTCCTCCA  370

Query  263  ------CATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGC  330
                  |.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGTCTTCTTCCTCATCCTCGGCCACCTCCCCCGCTTCGGCGTCCTTCAAGTTTGAGGACTTCCAGGTGTACGGC  444

Query  331  TGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCC  404
            ||||||||.|||.||||||||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  445  TGCTACCCGGGCACCCTGAGCGGCCCATTAGATGAGACCCTATCCTCCAGCGGCTCTGAGTACTATGGCAGTCC  518

Query  405  CTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCC  478
            ||||||.|||||.|||||.||.||.||||.||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  519  CTGCTCAGCCCCCTCGCCATCTACACCCAACTTCCAGCCGTCCCAGCTTTCTCCCTGGGACGGCTCATTTGGCC  592

Query  479  ACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCT---GGGCCC  549
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||.||||.||.||.|||   |||||.
Sbjct  593  ACTTCTCCCCGAGCCAGACTTATGAAGGCCTCTGGGCATGGACAGAGCAGTTGCCTAAGGCTTCTTCAGGGCCT  666

Query  550  CCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAA  623
            ||.|..||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||
Sbjct  667  CCGCCACCTCCAACCTTCTTCTCCTTCAGTCCTCCCACTGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGTTCTCTGAA  740

Query  624  GTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTT  697
            .||||||||..|||..||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|.||.|||||.||.|
Sbjct  741  ATTGTTCCCACCACCAGCCACCCACCAGCTTGGGGAGGGGGAGAGCTATTCCATGCCAGCAGCTTTCCCCGGCT  814

Query  698  TGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGC  771
            ||||||||||.|||||..|||.|||....||.||.||.|||||..|||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct  815  TGGCACCCACCTCTCCGAACCGTGACACTTCCGGCATTCTGGACGCACCCGTGACCTCCACCAAGTCCCGGAGC  888

Query  772  GGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCG  845
            |||||..|||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  889  GGGGCTTCAGGTGGCAGCGAGGGCCGCTGTGCAGTCTGTGGTGACAATGCTTCGTGTCAGCACTATGGGGTCCG  962

Query  846  CACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACA  919
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  CACCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTACAGAAAAGCGCCAAGTACATCTGCCTGGCAAACA  1036

Query  920  AGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGC  993
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  AGGATTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGGAACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCTGTGGGC  1110

Query  994  ATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCC  1067
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGTGAAGGAAGTTGTACGGACAGACAGCCTAAAAGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCC  1184

Query 1068  CCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCA  1141
            .|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||..||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185  TCCAGATGCCTCCCCTACCAATCTTCTCACTTCCCTCATCCGGGCACACTTGGACTCCGGGCCTAGCACTGCCA  1258

Query 1142  AACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAG  1215
            ||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.
Sbjct 1259  AATTGGACTATTCCAAGTTCCAGGAACTGGTGCTGCCCCGCTTCGGGAAGGAAGATGCCGGTGACGTGCAACAA  1332

Query 1216  TTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCT  1289
            ||.||.|||.|||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||...||||||
Sbjct 1333  TTTTATGACTTGCTCTCTGGTTCCCTGGACGTTATCCGAAAGTGGGCAGAAAAAATCCCTGGCTTCATTGAGCT  1406

Query 1290  GTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGT  1363
            .|..||.|..|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|
Sbjct 1407  TTGCCCAGGAGACCAAGACCTGTTGCTAGAGTCTGCCTTCCTGGAACTCTTCATCCTCCGCCTGGCATACCGAT  1480

Query 1364  CTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTC  1437
            ||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 1481  CTAAACCCGGTGAGGGGAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTACTACACCAGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTT  1554

Query 1438  GGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGC  1511
            ||.||.||||||||||..|||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1555  GGTGATTGGATTGACAACATCCTGGCCTTCTCACGGTCCCTGCACAGCTTGGGTGTTGATGTTCCCGCCTTTGC  1628

Query 1512  CTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGA  1585
            ||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1629  CTGCCTGTCCGCTCTGGTCCTCATCACTGATCGACACGGGCTCCAGGACCCTCGTCGGGTGGAAGAGCTGCAGA  1702

Query 1586  ACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCA  1659
            |.|||||.||.|||||.||||||||||||.||||..|.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1703  ATCGCATTGCTAGCTGTCTGAAGGAGCACATGGCTACCGTGGCAGGAGACCCACAGCCGGCCAGCTGCCTGTCA  1776

Query 1660  CGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCT  1733
            ||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||.|
Sbjct 1777  CGTCTGCTGGGCAAACTGCCTGAGCTTCGGACCCTGTGCACTCAAGGCCTGCAGCGCATCTTTTGCCTCAAGTT  1850

Query 1734  GGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC  1794
            ||||||||||||.|||||||||||.||..|.|||||||||||.||||||||..||.|.|||
Sbjct 1851  GGAGGACTTGGTACCCCCTCCACCTATTGTGGACAAGATCTTTATGGACACATTGTCTTTC  1911