Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00765
• Subject: NM_001039129.4
• Aligned Length: 1119
• Identities: 889
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGTCTAAGTCAGAGTCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAAC  74
            |||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCTAAGTCCGAGTCTCCCAAGGAGCCAGAACAGCTGCGGAAGCTCTTCATCGGAGGGCTGAGCTTCGAAAC  74

Query   75  AACTGATGAGAGCCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAA  148
            |||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACCGACGAGAGTCTGAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACACTAACAGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAA  148

Query  149  ACACCAAGCGCTCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCA  222
            ||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  149  ACACCAAGAGATCCAGGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAAGAAGTGGATGCTGCCATGAATGCA  222

Query  223  AGGCCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGG  296
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct  223  AGACCACACAAGGTGGATGGAAGAGTTGTGGAACCTAAGAGAGCTGTCTCAAGAGAAGATTCTCAGCGACCAGG  296

Query  297  TGCCCACTTAACTGTGAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATT  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  297  TGCCCACTTAACTGTGAAAAAGATCTTTGTTGGTGGTATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTACGAGATT  370

Query  371  ATTTTGAACAGTATGGAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTT  444
            |||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  371  ATTTTGAGCAGTATGGGAAGATTGAAGTGATAGAAATTATGACTGACAGAGGCAGTGGGAAAAAGAGGGGCTTT  444

Query  445  GCCTTTGTAACCTTTGACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCA  518
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTTTTGTTACCTTTGATGACCATGACTCTGTGGATAAGATTGTTATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCA  518

Query  519  CAACTGTGAAGTTAGAAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTG  592
            ||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  519  CAACTGTGAAGTAAGAAAGGCTCTGTCGAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGTCAGAGAGGTCGCAGTG  592

Query  593  GTTCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  593  GTTCTGGAAACTTTGGTGGTGGTCGTGGAGGCGGTTTTGGTGGCAATGACAATTTTGGTCGAGGAGGGAACTTC  666

Query  667  AGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTGGTCGTGGTGGCTTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATT  740

Query  741  TGGTAATGA-----------------------------------------------------------------  749
            |||.|||||                                                                 
Sbjct  741  TGGCAATGATGGTGGTTATGGAGGAGGCAGCCCTGGTTACTCTGGAGGAAGCAGAGGCTATGGAAGTGGTGGAC  814

Query  750  --------------------------------------------------------------------------  749
                                                                                      
Sbjct  815  AGGGTTATGGAAACCAGGGCAGTGGCTATGGCGGGAGTGGCAGCTATGACAGCTATAACAACGGAGGAGGCGGA  888

Query  750  --------------------TGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAA  803
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GGCGGCTTTGGCGGTGGTAGTGGAAGCAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGCAATTACAACAA  962

Query  804  TCAGTCTTCAAATTTTGGACCCATGAAGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAG  877
            |||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  963  TCAGTCTTCCAATTTTGGGCCGATGAAGGGAGGAAACTTTGGAGGCAGGAGCTCTGGCCCTTATGGTGGTGGAG  1036

Query  878  GCCAATACTTTGCAAAACCACGAAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGC  951
            ||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCAGTACTTTGCTAAACCACGGAACCAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGC  1110

Query  952  AGAAGATTT  960
            ||.||.||.
Sbjct 1111  AGGAGGTTC  1119