Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00884
• Subject: NM_010577.4
• Aligned Length: 3164
• Identities: 2761
• Gaps: 22

Alignment

Query    1  ATGGGGAGCCGGACGCCA----------GAGTCCCCTCTCCACGCCGTGCAGCTGCGCTGGGGCCCCCGGCGCC  64
            |||||||||.||||||||          || ||.|||||||||||.||||.||||||||||||.|||||.||||
Sbjct    1  ATGGGGAGCTGGACGCCACGGTCGCCTCGA-TCTCCTCTCCACGCGGTGCTGCTGCGCTGGGGGCCCCGACGCC  73

Query   65  GACCCCCGCTGCTGCCGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCCGCCGCCAC-CCAGGGTCGGGGGCTTCAACTTAGACGC  137
            .|||.|||||||||||.||||||.||||.|||..||||||.|||| ||| |||.||||||||||||.|||||||
Sbjct   74  TACCGCCGCTGCTGCCTCTGCTGCTGCTACTGTGGCCGCCACCACTCCA-GGTTGGGGGCTTCAACCTAGACGC  146

Query  138  GGAGGCCCCAGCAGTACTCTCGGGGCCCCCGGGCTCCTTCTTCGGATTCTCAGTGGAGTTTTACCGGCCGGGAA  211
            |||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  GGAGGCCCCGGCGGTGCTCTCCGGGCCCCCCGGCTCCCTTTTTGGCTTCTCCGTGGAGTTTTACCGGCCGGGAA  220

Query  212  CAGACGGGGTCAGTGTGCTGGTGGGAGCACCCAAGGCTAATACCAGCCAGCCAGGAGTGCTGCAGGGTGGTGCT  285
            ..|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  221  GGGACGGAGTCAGTGTGCTGGTTGGGGCACCCAAGGCTAACACTAGCCAGCCAGGTGTACTGCAAGGTGGTGCT  294

Query  286  GTCTACCTCTGTCCTTGGGGTGCCAGCCCCACACAGTGCACCCCCATTGAATTTGACAGCAAAGGCTCTCGGCT  359
            |||||..|.|||||.|||||..||||.||.|..|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct  295  GTCTATGTGTGTCCCTGGGGCACCAGTCCTATCCAGTGCACCACCATTCAATTTGACAGCAAAGGCTCCCGGAT  368

Query  360  CCTGGAGTCCTCACTGTCCAGCTCAGAGGGAGAGGAGCCTGTGGAGTACAAGTCCTTGCAGTGGTTCGGGGCAA  433
            .||||||||||||||||.|||..|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  369  TCTGGAGTCCTCACTGTACAGTGCCAAGGGAGAGGAGCCTGTGGAGTACAAGTCCTTGCAGTGGTTCGGAGCAA  442

Query  434  CAGTTCGAGCCCATGGCTCCTCCATCTTGGCATGCGCTCCACTGTACAGCTGGCGCACAGAGAAGGAGCCACTG  507
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||.|
Sbjct  443  CAGTTCGGGCCCATGGCTCCTCCATCTTGGCATGTGCTCCACTGTATAGCTGGCGCACAGAAAAGGACCCACAG  516

Query  508  AGCGACCCCGTGGGCACCTGCTACCTCTCCACAGATAACTTCACCCGAATTCTGGAGTATGCACCCTGCCGCTC  581
            |..|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  517  AATGACCCAGTGGGCACCTGCTACCTCTCCACAGAAAACTTCACCCGGATTCTGGAGTACGCACCTTGCCGCTC  590

Query  582  AGATTTCAGCTGGGCAGCAGGACAGGGTTACTGCCAAGGAGGCTTCAGTGCCGAGTTCACCAAGACTGGCCGTG  655
            ||||||..||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  AGATTTTGGCAGTGCAGCAGGGCAGGGCTACTGCCAAGGGGGCTTCAGTGCTGAGTTCACCAAGACTGGCCGTG  664

Query  656  TGGTTTTAGGTGGACCAGGAAGCTATTTCTGGCAAGGCCAGATCCTGTCTGCCACTCAGGAGCAGATTGCAGAA  729
            ||||..|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||.
Sbjct  665  TGGTCCTGGGTGGACCTGGAAGCTACTTCTGGCAAGGCCAGATCCTGTCCGCCACTCAAGAGCAGATCTCGGAG  738

Query  730  TCTTATTACCCCGAGTACCTGATCAACCTGGTTCAGGGGCAGCTGCAGACTCGCCAGGCCAGTTCCATCTATGA  803
            ||.||||||||.|||||.||.|||||||..||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct  739  TCCTATTACCCAGAGTATCTCATCAACCCTGTTCAGGGGCAGCTGCAGACCCGCCAGGCCAGCTCCGTCTATGA  812

Query  804  TGACAGCTACCTAGGATACTCTGTGGCTGTTGGTGAATTCAGTGGTGATGACACAGAAGACTTTGTTGCTGGTG  877
            ||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  813  TGACAGCTACTTGGGATACTCTGTGGCTGTGGGTGAATTCAGTGGTGATGACACAGAAGACTTTGTTGCTGGCG  886

Query  878  TGCCCAAAGGGAACCTCACTTACGGCTATGTCACCATCCTTAATGGCTCAGACATTCGATCCCTCTACAACTTC  951
            |||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|..||||||||||||.||
Sbjct  887  TGCCCAAGGGGAACCTCACCTATGGCTATGTCACCGTCCTTAATGGCTCAGACATCCACTCCCTCTACAACGTC  960

Query  952  TCAGGGGAACAGATGGCCTCCTACTTTGGCTATGCAGTGGCCGCCACAGACGTCAATGGGGACGGGCTGGATGA  1025
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||...||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  961  TCAGGAGAACAGATGGCCTCCTACTTCGGCTATGCTGTGGCTGCCACTGATACCAATGGAGATGGGCTAGATGA  1034

Query 1026  CTTGCTGGTGGGGGCACCCCTGCTCATGGATCGGACCCCTGACGGGCGGCCTCAGGAGGTGGGCAGGGTCTACG  1099
            |.|.|||||.||||||||||||||||||||.|||||..||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1035  CCTACTGGTAGGGGCACCCCTGCTCATGGAGCGGACAGCTGATGGGAGACCTCAGGAGGTGGGCAGGGTCTACA  1108

Query 1100  TCTACCTGCAGCACCCAGCCGGCATAGAGCCCACGCCCACCCTTACCCTCACTGGCCATGATGAGTTTGGCCGA  1173
            ||||.|||||||.||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||..|||||
Sbjct 1109  TCTATCTGCAGCGCCCAGCGGGCATAGATCCCACACCCACCCTCACCCTCACTGGGCAAGATGAGTTCAGCCGA  1182

Query 1174  TTTGGCAGCTCCTTGACCCCCCTGGGGGACCTGGACCAGGATGGCTACAATGATGTGGCCATCGGGGCTCCCTT  1247
            ||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1183  TTCGGCAGCTCCTTGACACCCTTGGGGGACCTGGACCAAGACGGCTACAATGATGTCGCCATTGGGGCTCCATT  1256

Query 1248  TGGTGGGGAGACCCAGCAGGGAGTAGTGTTTGTATTTCCTGGGGGCCCAGGAGGGCTGGGCTCTAAGCCTTCCC  1321
            ||||||||||.|||||||||||||.||.|||.||||.||.||.|||||||||||.|||.||.||||.|||||||
Sbjct 1257  TGGTGGGGAGGCCCAGCAGGGAGTCGTATTTATATTCCCGGGAGGCCCAGGAGGACTGAGCACTAAACCTTCCC  1330

Query 1322  AGGTTCTGCAGCCCCTGTGGGCAGCCAGCCACACCCCAGACTTCTTTGGCTCTGCCCTTCGAGGAGGCCGAGAC  1395
            |||||.|||||||.||.||||||||..|||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1331  AGGTTTTGCAGCCTCTTTGGGCAGCTGGCCGTACCCCAGACTTCTTTGGCTCTGCCCTTCGAGGAGGACGAGAT  1404

Query 1396  CTGGATGGCAATGGATATCCTGATCTGATTGTGGGGTCCTTTGGTGTGGACAAGGCTGTGGTATACAGGGGCCG  1469
            |||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||
Sbjct 1405  CTGGATGGCAATGGATACCCTGATCTAATCGTTGGATCCTTTGGTGTGGACAAGGCTCTGGTGTACAGAGGGCG  1478

Query 1470  CCCCATCGTGTCCGCTAGTGCCTCCCTCACCATCTTCCCCGCCATGTTCAACCCAGAGGAGCGGAGCTGCAGCT  1543
            .||||||.|.||.||.||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||.
Sbjct 1479  GCCCATCATATCTGCCAGCGCATCTCTCACCATCTTCCCCTCCATGTTCAACCCAGAGGAGCGCAGTTGCAGCC  1552

Query 1544  TAGAGGGGAACCCTGTGGCCTGCATCAACCTTAGCTTCTGCCTCAATGCTTCTGGAAAACACGTTGCTGACTCC  1617
            |.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..|..||||.
Sbjct 1553  TGGAAGGGAACCCTGTGTCCTGCATCAACCTTAGCTTCTGCCTCAATGCCTCTGGAAAACATGTCCCCAACTCT  1626

Query 1618  ATTGGTTTCACAGTGGAACTTCAGCTGGACTGGCAGAAGCAGAAGGGAGGGGTACGGCGGGCACTGTTCCTGGC  1691
            ||.||.|||...||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct 1627  ATAGGCTTCGAGGTGGAACTCCAACTGGACTGGCAGAAGCAAAAGGGAGGGGTCCGGCGGGCACTGTTCCTGAC  1700

Query 1692  CTCCAGGCAGGCAACCCTGACCCAGACCCTGCTCATCCAGAATGGGGCTCGAGAGGATTGCAGAGAGATGAAGA  1765
            .||||.||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1701  TTCCAAGCAGGCCACCCTTACCCAGACCCTGCTTATCCAGAATGGGGCTCGGGAGGACTGCAGGGAGATGAAGA  1774

Query 1766  TCTACCTCAGGAACGAGTCAGAATTTCGAGACAAACTCTCGCCGATTCACATCGCTCTCAACTTCTCCTTGGAC  1839
            |||||||||||||.||.||||||||..|||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1775  TCTACCTCAGGAATGAATCAGAATTCAGAGACAAACTCTCCCCAATTCACATTGCCCTCAACTTCTCCTTGGAC  1848

Query 1840  CCCCAAGC-CCCAGTGGACAGCCACGGCCTCAGGCCAGCCCTACATTATCAGAGCAAGAGCCGGATAGAGGACA  1912
            |||.|||| |||| ||||||||||.||||||.||||||..|||||.||.||.|||||.|||.||||||||||||
Sbjct 1849  CCCAAAGCTCCCA-TGGACAGCCATGGCCTCCGGCCAGTTCTACACTACCAAAGCAAAAGCAGGATAGAGGACA  1921

Query 1913  AGGCTCAGATCTTGCTGGACTGTGGAGAAGACAACATCTGTGTGCCTGACCTGCAGCTGGAAGTGTTTGGGGAG  1986
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||
Sbjct 1922  AGGCCCAGATCTTGCTGGACTGTGGTGAAGACAATATCTGTGTGCCTGACCTGCAGCTGGATGTGTATGGGGAG  1995

Query 1987  CAGAACCATGTGTACCTGGGTGACAAGAATGCCCTGAACCTCACTTTCCATGCCCAGAATGTGGGTGAGGGTGG  2060
            .||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||.||||||||||.||
Sbjct 1996  AAGAAACATGTGTACCTGGGTGACAAGAACGCACTGAACCTGACATTCCATGCCCAAAATCTGGGTGAGGGCGG  2069

Query 2061  CGCCTATGAGGCTGAGCTTCGGGTCACCGCCCCTCCAGAGGCTGAGTACTCAGGACTCGTCAGACACCCAGGGA  2134
            .||||||||.||.||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2070  TGCCTATGAAGCCGAGCTTCGGGTCACAGCCCCTCTAGAGGCCGAGTACTCAGGACTTGTCAGACACCCAGGGA  2143

Query 2135  ACTTCTCCAGCCTGAGCTGTGACTACTTTGCCGTGAACCAGAGCCGCCTGCTGGTGTGTGACCTGGGCAACCCC  2208
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  ACTTCTCCAGCCTGAGCTGTGACTACTTTGCTGTGAACCAGAGCCGCCAGCTGGTGTGTGACCTGGGCAACCCC  2217

Query 2209  ATGAAGGCAGGAGCCAGTCTGTGGGGTGGCCTTCGGTTTACAGTCCCTCATCTCCGGGACACTAAGAAAACCAT  2282
            |||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|..|||||.|||||||||||
Sbjct 2218  ATGAAGGCAGGCACCAGTCTCTGGGGTGGCCTTCGGTTCACTGTTCCTCATCTTCAAGACACAAAGAAAACCAT  2291

Query 2283  CCAGTTTGACTTCCAGATCCTCAGCAAGAATCTCAACAACTCGCAAAGCGACGTGGTTTCCTTTCGGCTCTCCG  2356
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.|||||||.|||||.|..|||||.|
Sbjct 2292  CCAGTTTGACTTTCAGATCCTCAGCAAGAACCTGAACAACTCACAAAGCAACGTGGTCTCCTTCCCACTCTCGG  2365

Query 2357  TGGAGGCTCAGGCCCAGGTCACCCTGAACGGTGTCTCCAAGCCTGAGGCAGTGCTATTCCCAGTAAGCGACTGG  2430
            ||||||||||.|||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||
Sbjct 2366  TGGAGGCTCAAGCCCAGGTCTCCCTTAATGGTGTCTCCAAGCCTGAAGCTGTGATTTTCCCAGTCAGCGACTGG  2439

Query 2431  CATCCCCGAGACCAGCCTCAGAAGGAGGAGGACCTGGGACCTGCTGTCCACCATGTCTATGAGCTCATCAACCA  2504
            .||||.|.|||||||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2440  AATCCTCAAGACCAGCCTCAGAAGGAGGAAGACTTGGGCCCAGCTGTCCACCATGTCTACGAGCTCATCAACCA  2513

Query 2505  AGGCCCCAGCTCCATTAGCCAGGGTGTGCTGGAACTCAGCTGTCCCCAGGCTCTGGAAGGTCAGCAGCTCCTAT  2578
            .||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 2514  GGGGCCCAGCTCCATCAGCCAGGGTGTGCTGGAGCTCAGCTGTCCACAGGCTCTGGAAGGCCAACAGCTCCTCT  2587

Query 2579  ATGTGACCAGAGTTACGGGACT---CAACTGCACCACCAA--TCACCCCATTAACCCAAAGGGCCTGGAGTTGG  2647
            |||||||||..||.||.|||||   ||||||||||.||||  .||||||  .|||.||.|||||||||||||||
Sbjct 2588  ATGTGACCAAGGTGACAGGACTCAGCAACTGCACCTCCAACTACACCCC--CAACTCACAGGGCCTGGAGTTGG  2659

Query 2648  ATCCCGAGGGTTCCCTGCACCACCAGCAAAAACGGGAAGCTCCAAGCCGCAGCTCTGCTTCCTCGGGACCTCAG  2721
            ||||.|||...||.|..|||||||.|||.|||||.||.||||||.|..|.||.|||.||.||||.|||.|.||.
Sbjct 2660  ATCCAGAGACCTCTCCACACCACCTGCAGAAACGAGAGGCTCCAGGGAGGAGTTCTACTGCCTCAGGAACACAA  2733

Query 2722  ATCCTGAAATGCCCGGAGGCTGAGTGTTTCAGGCTGCGCTGTGAGCTCGGGCCCCTGCACCAACAAGAGAGCCA  2795
            .|.|||||||||||.||.||..|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||..||||||||||.
Sbjct 2734  GTTCTGAAATGCCCTGAAGCCAAGTGTTTCAGGCTGCGCTGTGAGTTTGGGCCACTGCACCGCCAAGAGAGCCG  2807

Query 2796  AAGTCTGCAGTTGCATTTCCGAGTCTGGGCCAAGACTTTCTTGCAGCGGGAGCACCAGCCATTTAGCCTGCAGT  2869
            .|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||.||||
Sbjct 2808  TAGTCTGCAGCTGCATTTCCGAGTCTGGGCCAAGACCTTCTTGCAGCGGGAATACCAGCCATTTAGCCTTCAGT  2881

Query 2870  GTGAGGCTGTGTACAAAGCCCTGAAGATGCCCTACCGAATCCTGCCTCGGCAGCTGCCCCAAAAAGAGCGTCAG  2943
            ||||||||||.||..||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||..|.|.||||
Sbjct 2882  GTGAGGCTGTATATGAAGCTCTGAAGATGCCCTACCAGATCCTGCCTCGGCAGCTTCCCCAAAAGAAACTTCAG  2955

Query 2944  GTGGCCACAGCTGTGCAATGGACCAAGGCAGAAGGCAGCTATGGCGTCCCACTGTGGATCATCATCCTAGCCAT  3017
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 2956  GTGGCCACAGCCGTGCAGTGGACCAAGGCAGAAGGCAGCAATGGTGTCCCGTTGTGGATCATCATCCTAGCCAT  3029

Query 3018  CCTGTTTGGCCTCCTGCTCCTAGGTCTACTCATCTACATCCTCTACAAGCTTGGATTCTTCAAACGCTCCCTCC  3091
            .||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 3030  TCTTTTTGGCCTCCTGCTCCTAGGTCTGCTCATCTACGTCCTCTACAAGCTCGGCTTCTTCAAACGTTCCCTCC  3103

Query 3092  CATATGGCACCGCCATGGAAAAAGCTCAGCTCAAGCCTCCAGCCACCTCTGATGCC  3147
            |.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3104  CCTACGGCACAGCCATGGAAAAAGCTCAGCTCAAGCCTCCAGCCACCTCAGATGCC  3159