Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00897
• Subject: XM_017322094.1
• Aligned Length: 1308
• Identities: 1153
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGGCCTGGCCAGGGCCCTACGCCGCCTCAGCGGCGCCCTGGATTCGGGAGACAGCCGGGCGGGCGATGAAGA  74
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||..|.|||.||||.||.||.||.|||||.||
Sbjct    1  ATGGGCCTGGCTAGGGCCCTGCGCCGCCTGAGCGGCGCGCTGGAGCCAGGAAACAGTCGAGCTGGGGATGAGGA  74

Query   75  GGAGGCCGGGCCCGGGTTGTGCCGCAACGGGTGGGCGCCGGCACCGGTGCAGTCACCCGTGGGCCGGCGCCGCG  148
            .|||||.|||.||||..||||||||||.||||||||.||.|.||||||      |.|.|.|.||||||||||||
Sbjct   75  AGAGGCGGGGGCCGGACTGTGCCGCAATGGGTGGGCTCCTGGACCGGT------AGCTGGGAGCCGGCGCCGCG  142

Query  149  GTCGCTTCGTCAAGAAAGACGGGCACTGCAACGTGCGTTTCGTAAACCTGGGTGGCCAGGGCGCGCGCTACCTG  222
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  143  GGCGCTTCGTCAAAAAAGATGGGCACTGCAATGTGCGCTTCGTGAATCTGGGCGGCCAGGGCGCGCGCTACCTA  216

Query  223  AGCGACCTGTTCACCACATGCGTGGACGTGCGCTGGCGCTGGATGTGCCTGCTCTTCTCCTGCTCCTTCCTCGC  296
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  217  AGTGACCTGTTCACCACATGTGTGGACGTGCGCTGGCGCTGGATGTGCCTGCTCTTCTCCTGTTCCTTCCTCGC  290

Query  297  CTCCTGGCTGCTCTTCGGCCTGGCCTTCTGGCTCATTGCCTCGCTGCACGGCGACCTGGCCGCCCCGCCACCGC  370
            |||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|
Sbjct  291  CTCCTGGTTGCTCTTCGGCCTGACCTTCTGGCTCATCGCCTCGCTGCACGGCGACCTAGCTGCCCCACCGCCAC  364

Query  371  CCGCGCCCTGCTTCTCACACGTGGCCAGCTTCCTGGCCGCCTTCCTCTTCGCGCTGGAGACGCAGACGTCCATC  444
            |.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  365  CGGCTCCCTGTTTCTCGCAAGTGGCCAGCTTCCTGGCTGCCTTCCTCTTTGCACTGGAGACACAGACGTCCATA  438

Query  445  GGCTACGGCGTGCGCAGCGTCACCGAGGAGTGCCCGGCCGCTGTGGCCGCCGTGGTGCTGCAGTGCATTGCCGG  518
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  439  GGCTATGGTGTGCGCAGCGTCACCGAGGAGTGTCCAGCTGCTGTGGCCGCTGTGGTGCTGCAGTGCATCGCAGG  512

Query  519  CTGCGTGCTCGACGCCTTCGTCGTGGGTGCTGTCATGGCCAAGATGGCCAAACCCAAGAAGCGCAACGAGACGC  592
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  513  CTGTGTGCTCGACGCCTTCGTCGTGGGTGCAGTTATGGCCAAGATGGCCAAGCCCAAGAAACGCAACGAGACAC  586

Query  593  TGGTCTTCAGCGAGAACGCCGTCGTGGCGCTGCGCGACCACCGCCTCTGCCTCATGTGGCGCGTCGGCAACCTG  666
            |.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  587  TAGTCTTCAGTGAGAACGCAGTGGTGGCTCTGCGAGACCACCGTCTCTGCCTCATGTGGCGGGTGGGCAACCTG  660

Query  667  CGCCGCAGCCACCTGGTCGAGGCCCACGTGCGTGCCCAGCTGCTGCAGCCCCGTGTGACCCCAGAGGGTGAGTA  740
            ||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  661  CGACGCAGTCACCTGGTGGAAGCTCACGTGCGGGCCCAGCTGCTGCAGCCCCGTGTGACCCCCGAGGGTGAGTA  734

Query  741  CATCCCGCTGGACCACCAGGATGTGGATGTGGGCTTTGATGGAGGCACCGATCGTATCTTCCTCGTGTCCCCCA  814
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  735  CATCCCACTGGACCACCAGGATGTAGATGTTGGTTTTGATGGAGGCACTGATCGCATCTTCCTCGTCTCCCCCA  808

Query  815  TCACCATCGTCCATGAGATCGACTCTGCCAGTCCTCTGTATGAGCTAGGACGTGCCGAGCTGGCCAGGGCTGAC  888
            |.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||
Sbjct  809  TTACCATTGTGCATGAGATTGACTCTGCCAGTCCACTGTATGAGCTGGGGCGGGCCGAGCTGGCCCGGGCTGAC  882

Query  889  TTTGAGCTGGTGGTCATTCTCGAGGGGATGGTTGAGGCCACAGCCATGACCACACAGTGTCGCTCGTCCTACCT  962
            ||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  883  TTTGAGCTGGTGGTCATTCTTGAAGGTATGGTTGAGGCCACAGCCATGACTACACAGTGCCGCTCATCTTACCT  956

Query  963  CCCTGGTGAACTGCTCTGGGGCCATCGTTTTGAGCCAGTTCTCTTCCAGCGTGGCTCCCAGTATGAGGTCGACT  1036
            |||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  957  CCCAGGTGAGCTGCTCTGGGGACATCGCTTCGAGCCGGTCCTCTTCCAGCGTGGCTCCCAGTATGAGGTTGACT  1030

Query 1037  ATCGCCACTTCCATCGCACTTATGAGGTCCCAGGGACACCGGTCTGCAGTGCTAAGGAGCTGGATGAACGGGCA  1110
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  ATCGCCACTTCCATCGAACATATGAGGTCCCAGGGACACCAGTCTGCAGTGCCAAGGAGCTGGATGAACGGGCA  1104

Query 1111  GAGCAGGCTTCCCACAGCCTCAAGTCTAGTTTCCCCGGCTCTCTGACTGCATTTTGTTATGAGAATGAACTTGC  1184
            |||||||||||||||||||..|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  GAGCAGGCTTCCCACAGCCCTAAGTCAAGTTTCCCTGGCTCCCTCACTGCATTTTGTTATGAGAATGAACTTGC  1178

Query 1185  TCTGAGCTGCTGCCAGGAGGAAGATGAGGACGATGAGACTGAGGAAGGGAATGGGGTGGAAACAGAAGATGGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||.||||.|...|..||.||...|||..|||
Sbjct 1179  TCTGAGCTGCTGCCAGGAGGAAGATGAGGAGGAGGACACTAAGGAGGGGACTTCAGCAGAGACCCCAGAGAGGG  1252

Query 1259  CTGCTAGCCCCCGAGTTCTCACACCAACCCTGGCGCTGACCCTGCCTCCA  1308
            ||||.|||||||.||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1253  CTGCCAGCCCCCAAGCTCTTACACCAACCCTGGCTCTGACCCTGCCTCCA  1302