Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00923
• Subject: NM_001289026.2
• Aligned Length: 873
• Identities: 824
• Gaps: 45

Alignment

Query   1  ------------ATGTCTCCCCACCCCACCGCCCTCCTGGGCCTAGTGCTCTGCCTGGCCCAGACCATCCACAC  62
                       |||                              |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAAAGAGAAATG------------------------------GTGCTCTGCCTGGCCCAGACCATCCACAC  44

Query  63  GCAGGAGGAAGATCTGCCCAGACCCTCCATCTCGGCTGAGCCAGGCACCGTGATCCCCCTGGGGAGCCATGTGA  136
           |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  45  GCAGGAG---GATCTGCCCAGACCCTCCATCTCGGCTGAGCCAGGCACCGTGATCCCCCTGGGGAGCCATGTGA  115

Query 137  CTTTCGTGTGCCGGGGCCCGGTTGGGGTTCAAACATTCCGCCTGGAGAGGGAGAGTAGATCCACATACAATGAT  210
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 116  CTTTCGTGTGCCGGGGCCCGGTTGGGGTTCAAACATTCCGCCTGGAGAGGGACAGTAGATCCACATACAATGAT  189

Query 211  ACTGAAGATGTGTCTCAAGCTAGTCCATCTGAGTCAGAGGCCAGATTCCGCATTGACTCAGTAAGTGAAGGAAA  284
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 190  ACTGAAGATGTGTCTCAAGCTAGTCCATCTGAGTCAGAGGCCAGATTCCGCATTGACTCAGTAAGAGAAGGAAA  263

Query 285  TGCCGGGCCTTATCGCTGCATCTATTATAAGCCCCCTAAATGGTCTGAGCAGAGTGACTACCTGGAGCTGCTGG  358
           ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264  TGCCGGGCTTTATCGCTGCATCTATTATAAGCCCCCTAAATGGTCTGAGCAGAGTGACTACCTGGAGCTGCTGG  337

Query 359  TGAAAGAAACCTCTGGAGGCCCGGACTCCCCGGACACAGAGCCCGGCTCCTCAGCTGGACCCACGCAGAGGCCG  432
           |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338  TGAAAGAAAGCTCTGGAGGCCCGGACTCCCCGGACACAGAGCCCGGCTCCTCAGCTGGACCCACGCAGAGGCCG  411

Query 433  TCGGACAACAGTCACAATGAGCATGCACCTGCTTCCCAAGGCCTGAAAGCTGAGCATCTGTATATTCTCATCGG  506
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412  TCGGACAACAGTCACAATGAGCATGCACCTGCTTCCCAAGGCCTGAAAGCTGAGCATCTGTATATTCTCATCGG  485

Query 507  GGTCTCAGTGGTCTTCCTCTTCTGTCTCCTCCTCCTGGTCCTCTTCTGCCTCCATCGCCAGAATCAGATAAAGC  580
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486  GGTCTCAGTGGTCTTCCTCTTCTGTCTCCTCCTCCTGGTCCTCTTCTGCCTCCATCGCCAGAATCAGATAAAGC  559

Query 581  AGGGGCCCCCCAGAAGCAAGGACGAGGAGCAGAAGCCACAGCAGAGGCCTGACCTGGCTGTTGATGTTCTAGAG  654
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560  AGGGGCCCCCCAGAAGCAAGGACGAGGAGCAGAAGCCACAGCAGAGGCCTGACCTGGCTGTTGATGTTCTAGAG  633

Query 655  AGGACAGCAGACAAGGCCACAGTCAATGGACTTCCTGAGAAGGACAGAGAGACGGACACCTCGGCCCTGGCTGC  728
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634  AGGACAGCAGACAAGGCCACAGTCAATGGACTTCCTGAGAAGGACAGAGAGACGGACACCTCGGCCCTGGCTGC  707

Query 729  AGGGAGTTCCCAGGAGGTGACGTATGCTCAGCTGGACCACTGGGCCCTCACACAGAGGACAGCCCGGGCTGTGT  802
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708  AGGGAGTTCCCAGGAGGTGACGTATGCTCAGCTGGACCACTGGGCCCTCACACAGAGGACAGCCCGGGCTGTGT  781

Query 803  CCCCACAGTCCACAAAGCCCATGGCCGAGTCCATCACGTATGCAGCCGTTGCCAGACAC  861
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782  CCCCACAGTCCACAAAGCCCATGGCCGAGTCCATCACGTATGCAGCCGTTGCCAGACAC  840