Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00923
• Subject: NM_001289027.2
• Aligned Length: 870
• Identities: 794
• Gaps: 72

Alignment

Query   1  ATGTCTCCCCACCCCACCGCCCTCCTGGGCCTAGTGCTCTGCCTGGCCCAGACCATCCACACGCAGGA------  68
                                                                 ||         |||      
Sbjct   1  ------------------------------------------------------AT---------GGAAAGAGA  11

Query  69  ---GGAAGATCTGCCCAGACCCTCCATCTCGGCTGAGCCAGGCACCGTGATCCCCCTGGGGAGCCATGTGACTT  139
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  12  AATGGAAGATCTGCCCAGACCCTCCATCTCGGCTGAGCCAGGCACCGTGATCCCCCTGGGGAGCCATGTGACTT  85

Query 140  TCGTGTGCCGGGGCCCGGTTGGGGTTCAAACATTCCGCCTGGAGAGGGAGAGTAGATCCACATACAATGATACT  213
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  86  TCGTGTGCCGGGGCCCGGTTGGGGTTCAAACATTCCGCCTGGAGAGGGACAGTAGATCCACATACAATGATACT  159

Query 214  GAAGATGTGTCTCAAGCTAGTCCATCTGAGTCAGAGGCCAGATTCCGCATTGACTCAGTAAGTGAAGGAAATGC  287
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 160  GAAGATGTGTCTCAAGCTAGTCCATCTGAGTCAGAGGCCAGATTCCGCATTGACTCAGTAAGAGAAGGAAATGC  233

Query 288  CGGGCCTTATCGCTGCATCTATTATAAGCCCCCTAAATGGTCTGAGCAGAGTGACTACCTGGAGCTGCTGGTGA  361
           |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 234  CGGGCTTTATCGCTGCATCTATTATAAGCCCCCTAAATGGTCTGAGCAGAGTGACTACCTGGAGCTGCTGGTGA  307

Query 362  AAGAAACCTCTGGAGGCCCGGACTCCCCGGACACAGAGCCCGGCTCCTCAGCTGGACCCACGCAGAGGCCGTCG  435
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308  AAGAAAGCTCTGGAGGCCCGGACTCCCCGGACACAGAGCCCGGCTCCTCAGCTGGACCCACGCAGAGGCCGTCG  381

Query 436  GACAACAGTCACAATGAGCATGCACCTGCTTCCCAAGGCCTGAAAGCTGAGCATCTGTATATTCTCATCGGGGT  509
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382  GACAACAGTCACAATGAGCATGCACCTGCTTCCCAAGGCCTGAAAGCTGAGCATCTGTATATTCTCATCGGGGT  455

Query 510  CTCAGTGGTCTTCCTCTTCTGTCTCCTCCTCCTGGTCCTCTTCTGCCTCCATCGCCAGAATCAGATAAAGCAGG  583
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456  CTCAGTGGTCTTCCTCTTCTGTCTCCTCCTCCTGGTCCTCTTCTGCCTCCATCGCCAGAATCAGATAAAGCAGG  529

Query 584  GGCCCCCCAGAAGCAAGGACGAGGAGCAGAAGCCACAGCAGAGGCCTGACCTGGCTGTTGATGTTCTAGAGAGG  657
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530  GGCCCCCCAGAAGCAAGGACGAGGAGCAGAAGCCACAGCAGAGGCCTGACCTGGCTGTTGATGTTCTAGAGAGG  603

Query 658  ACAGCAGACAAGGCCACAGTCAATGGACTTCCTGAGAAGGACAGAGAGACGGACACCTCGGCCCTGGCTGCAGG  731
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604  ACAGCAGACAAGGCCACAGTCAATGGACTTCCTGAGAAGGACAGAGAGACGGACACCTCGGCCCTGGCTGCAGG  677

Query 732  GAGTTCCCAGGAGGTGACGTATGCTCAGCTGGACCACTGGGCCCTCACACAGAGGACAGCCCGGGCTGTGTCCC  805
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678  GAGTTCCCAGGAGGTGACGTATGCTCAGCTGGACCACTGGGCCCTCACACAGAGGACAGCCCGGGCTGTGTCCC  751

Query 806  CACAGTCCACAAAGCCCATGGCCGAGTCCATCACGTATGCAGCCGTTGCCAGACAC  861
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752  CACAGTCCACAAAGCCCATGGCCGAGTCCATCACGTATGCAGCCGTTGCCAGACAC  807