Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01016
• Subject: XM_011535098.3
• Aligned Length: 2143
• Identities: 1855
• Gaps: 284

Alignment

Query    1  ATGCTGTGCGTCGGAAGGCTGGGCGGCTTGGGAGCCAGAGCAGCAGCTCTGCCGCCCCGCCGGGCGGGCCGGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGTGCGTCGGAAGGCTGGGCGGCTTGGGAGCCAGAGCAGCAGCTCTGCCGCCCCGCCGGGCGGGCCGGGG  74

Query   75  AAGCCTCGAAGCCGGGATCCGGGCCCGAAGGGTCAGCACCAGCTGGTCTCCCGTGGGCGCCGCCTTCAATGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGCCTCGAAGCCGGGATCCGGGCCCGAAGGGTCAGCACCAGCTGGTCTCCCGTGGGCGCCGCCTTCAATGTCA  148

Query  149  AGCCCCAGGGCAGCCGCTTGGACCTGTTCGGCGAGCGCCGGGGTCTTTTTGGAGTTCCTGAGCTGAGTGCCCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCCCCAGGGCAGCCGCTTGGACCTGTTCGGCGAGCGCCGGGGTCTTTTTGGAGTTCCTGAGCTGAGTGCCCCA  222

Query  223  GAAGGATTTCATATTGCACAAGAAAAAGCCTTGAGAAAGACAGAATTGCTTGTGGACCGTGCATGTTCCACCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGGATTTCATATTGCACAAGAAAAAGCCTTGAGAAAGACAGAATTGCTTGTGGACCGTGCATGTTCCACCCC  296

Query  297  ACCTGGGCCCCAGACCGTGCTGATCTTCGATGAGCTCTCGGATTCCTTATGCAGAGTGGCCGACTTGGCTGATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCTGGGCCCCAGACCGTGCTGATCTTCGATGAGCTCTCGGATTCCTTATGCAGAGTGGCCGACTTGGCTGATT  370

Query  371  TTGTGAAAATCGCTCACCCTGAGCCAGCATTCAGAGAAGCTGCGGAAGAAGCTTGTAGAAGTATTGGCACCATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGTGAAAATCGCTCACCCTGAGCCAGCATTCAGAGAAGCTGCGGAAGAAGCTTGTAGAAGTATTGGCACCATG  444

Query  445  GTAGAGAAGTTGAACACAAATGTGGATTTATATCAAAGTTTGCAAAAATTACTAGCTGATAAAAAACTTGTGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTAGAGAAGTTGAACACAAATGTGGATTTATATCAAAGTTTGCAAAAATTACTAGCTGATAAAAAACTTGTGGA  518

Query  519  TTCCCTTGATCCAGAAACAAGGCGAGTGGCTGAACTGTTTATGTTTGATTTTGAAATTAGTGGAATCCATCTAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCCCTTGATCCAGAAACAAGGCGAGTGGCTGAACTGTTTATGTTTGATTTTGAAATTAGTGGAATCCATCTAG  592

Query  593  ACAAAGAAAAGCGTAAAAGAGCAGTGGACCTCAATGTTAAAATCTTGGATTTGAGTAGTACATTTCTTATGGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAAGAAAAGCGTAAAAGAGCAGTGGACCTCAATGTTAAAATCTTGGATTTGAGTAGTACATTTCTTATGGGA  666

Query  667  ACCAATTTTCCCAACAAGATTGAGAAGCATCTCTTACCAGAACACATTCGTCGTAACTTTACATCTGCTGGGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCAATTTTCCCAACAAGATTGAGAAGCATCTCTTACCAGAACACATTCGTCGTAACTTTACATCTGCTGGGGA  740

Query  741  TCATATCATAATTGATGGTCTCCACGCAGAATCACCAGATGACTTGGTGCGAGAAGCTGCTTATAAAATTTTTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCATATCATAATTGATGGTCTCCACGCAGAATCACCAGATGACTTGGTGCGAGAAGCTGCTTATAAAATTTTTC  814

Query  815  TTTATCCCAATGCTGGTCAATTGAAATGTTTAGAAGAATTGCTCAGCAGCAGAGATCTTCTGGCAAAGTTGGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTATCCCAATGCTGGTCAATTGAAATGTTTAGAAGAATTGCTCAGCAGCAGAGATCTTCTGGCAAAGTTGGTG  888

Query  889  GGGTATTCCACGTTTTCTCACAGGGCTCTCCAAGGAACGATAGCTAAAAATCCAGAGACTGTCATGCAGTTCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGTATTCCACGTTTTCTCACAGGGCTCTCCAAGGAACGATAGCTAAAAATCCAGAGACTGTCATGCAGTTCCT  962

Query  963  TGAAAAACTATCTGACAAACTTTCTGAAAGAACTCTGAAAGATTTTGAGATGATACGAGGGATGAAAATGAAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAAAACTATCTGACAAACTTTCTGAAAGAACTCTGAAAGATTTTGAGATGATACGAGGGATGAAAATGAAAC  1036

Query 1037  TGAATCCTCAAAATTCCGAAGTAATGCCCTGGGACCCCCCTTACTACAGTGGTGTGATTCGTGCAGAAAGGTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGAATCCTCAAAATTCCGAAGTAATGCCCTGGGACCCCCCTTACTACAGTGGTGTGATTCGTGCAGAAAGGTAT  1110

Query 1111  AATATTGAGCCCAGCCTATATTGCCCGTTTTTCTCTCTTGGAGCATGCATGGAAGGCCTGAATATTTTGCTTAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATATTGAGCCCAGCCTATATTGCCCGTTTTTCTCTCTTGGAGCATGCATGGAAGGCCTGAATATTTTGCTTAA  1184

Query 1185  CAGACTGTTGGGGATTTCATTATATGCAGAGCAGCCTGCAAAAGGAGAGGTGTGGAGCGAAGATGTCCGAAAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGACTGTTGGGGATTTCATTATATGCAGAGCAGCCTGCAAAAGGAGAGGTGTGGAGCGAAGATGTCCGAAAAC  1258

Query 1259  TGGCTGTTGTTCATGAATCTGAAGGATTGTTGGGGTACATTTACTGTGATTTTTTTCAGCGAGCAGACAAACCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGCTGTTGTTCATGAATCTGAAGGATTGTTGGGGTACATTTACTGTGATTTTTTTCAGCGAGCAGACAAACCA  1332

Query 1333  CATCAGGATTGCCATTTCACTATCCGTGGAGGCAGACTAAAGGAAGATGGAGACTATCAACTCCCAGTTGTAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATCAGGATTGCCATTTCACTATCCGTGGAGGCAGACTAAAGGAAGATGGAGACTATCAACTCCCAGTTGTAGT  1406

Query 1407  TCTTATGCTGAATCTTCCCCGTTCCTCAAGGAGTTCTCCAACTTTGCTAACTCCTGGCATGATGGAAAATCTTT  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCTTATGCTGAATCTTCCCCGTTCCTCAAGGAGTTCTCCAACTTTGCTAACTCCTAGCATGATGGAAAATCTTT  1480

Query 1481  TCCATGAAATGGGACATGCCATGCATTCAATGCTAGGACGTACTCGTTACCAACACGTCACTGGGACCAGGTGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCATGAAATGGGACATGCCATGCATTCAATGCTAGGACGTACTCGTTACCAACACGTCACTGGGACCAGGTGC  1554

Query 1555  CCTACTGATTTTGCTGAGGTTCCTTCTATTCTGATGGAGTACTTTGCAAATGATTATCGAGTAGTTAACCAATT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCTACTGATTTTGCTGAGGTTCCTTCTATTCTGATGGAGTACTTTGCAAATGATTATCGAGTAGTTAACCAATT  1628

Query 1629  TGCCAGACATTATCAGACTGGACAGCCACTGCCAAAAAATATGGTGTCTCGTCTTTGTGAATCTAAAAAGGTTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGCCAGACATTATCAGACTGGACAGCCACTGCCAAAAAATATGGTGTCTCGTCTTTGTGAATCTAAAAAGGTTT  1702

Query 1703  GTGCTGCAGCTGATATGCAACTTCAGGTCTTTTATGCCACTCTGGATCAAATCTACCATGGGAAGCATCCCCTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGCTGCAGCTGATATGCAACTTCAGGTCTTTTATGCCACTCTGGATCAAATCTACCATGGGAAGCATCCCCTG  1776

Query 1777  AGGAATTCAACCACAGACATTCTCAAGGAAACACAAGAGAAATTCTATGGCCTACCATATGTTCCAAATACTGC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGGAATTCAACCACAGACATTCTCAAGGAAACACAAGAGAAATTCTATGGCCTACCATATGTTCCAAATACTGC  1850

Query 1851  ----CTGGCAGCTGCGATTCAGCCACCTCGTGGGGTATGGTGCTAGATATTACTCTTACCTCATGTCCAGAGCG  1920
                |.||.|||.                                                             
Sbjct 1851  TGTACAGGAAGCA-------------------------------------------------------------  1863

Query 1921  GTCGCCTCCATGGTTTGGAAGGAGTGTTTTCTACAGGATCCTTTCAACAGGGCTGCCGGGGAGCGCTATCGCAG  1994
                                                                                      
Sbjct 1864  --------------------------------------------------------------------------  1863

Query 1995  GGAGATGCTGGCCCACGGTGGAGGCAGGGAGCCCATGCTCATGGTTGAAGGTATGCTTCAGAAGTGTCCTTCTG  2068
                                                                                      
Sbjct 1864  --------------------------------------------------------------------------  1863

Query 2069  TTGATGACTTCGTAAGTGCCCTCGTTTCCGACTTGGATCTGGACTTCGAAACTTTCCTCATGGATTCTGAA  2139
                                                                                   
Sbjct 1864  -----------------------------------------------------------------------  1863