Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_01034
Subject:
NM_001258281.1
Aligned Length:
934
Identities:
868
Gaps:
66

Alignment

Query   1  MAVQPKETLQLESAAEVGFVRFFQGMPEKPTTTVRLFDRGDFYTAHGEDALLAAREVFKTQGVIKYMGPAGAKN  74
                                                                             ||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------------------MGPAGAKN  8

Query  75  LQSVVLSKMNFESFVKDLLLVRQYRVEVYKNRAGNKASKENDWYLAYKASPGNLSQFEDILFGNNDMSASIGVV  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   9  LQSVVLSKMNFESFVKDLLLVRQYRVEVYKNRAGNKASKENDWYLAYKASPGNLSQFEDILFGNNDMSASIGVV  82

Query 149  GVKMSAVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEALLIQIGPKECVLPGGETAGDMGKLRQIIQRGGI  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  83  GVKMSAVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEALLIQIGPKECVLPGGETAGDMGKLRQIIQRGGI  156

Query 223  LITERKKADFSTKDIYQDLNRLLKGKKGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLELLSDDSNFGQFELTTFDF  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157  LITERKKADFSTKDIYQDLNRLLKGKKGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLELLSDDSNFGQFELTTFDF  230

Query 297  SQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAFVEDA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231  SQYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAFVEDA  304

Query 371  ELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPNVIQALEKHEGKHQKLLLAVFVTPLTDLR  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305  ELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAANLQDCYRLYQGINQLPNVIQALEKHEGKHQKLLLAVFVTPLTDLR  378

Query 445  SDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFDPNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQ  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379  SDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFDPNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQ  452

Query 519  FGYYFRVTCKEEKVLRNNKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTSLNEEYTKNKTEYEEAQDAIVKEIVNISSGYVEPM  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453  FGYYFRVTCKEEKVLRNNKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTSLNEEYTKNKTEYEEAQDAIVKEIVNISSGYVEPM  526

Query 593  QTLNDVLAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHACVEVQDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHI  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527  QTLNDVLAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHACVEVQDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHI  600

Query 667  ITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEVSIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSAT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601  ITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEVSIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSAT  674

Query 741  KDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALANQIPTVNNLHVTALTTEETLTML  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675  KDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALANQIPTVNNLHVTALTTEETLTML  748

Query 815  YQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQYIGESQGYDIMEPAAKKCYLEREQGEKIIQEFL  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749  YQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQYIGESQGYDIMEPAAKKCYLEREQGEKIIQEFL  822

Query 889  SKVKQMPFTEMSEENITIKLKQLKAEVIAKNNSFVNEIISRIKVTT  934
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823  SKVKQMPFTEMSEENITIKLKQLKAEVIAKNNSFVNEIISRIKVTT  868