Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01050
• Subject: NM_001204291.1
• Aligned Length: 792
• Identities: 723
• Gaps: 69

Alignment

Query   1  ATGACACCGGGCACCCAGTCTCCTTTCTTCCTGCTGCTGCTCCTCACAGTGCTTACAGCTACCACAGCCCCTAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACACCGGGCACCCAGTCTCCTTTCTTCCTGCTGCTGCTCCTCACAGTGCTTACAGCTACCACAGCCCCTAA  74

Query  75  ACCCGCAACAGTTGTTACGGGTTCTGGTCATGCAAGCTCTACCCCAGGTGGAGAAAAGGAGACTTCGGCTACCC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ACCCGCAACAGTTGTTACGGGTTCTGGTCATGCAAGCTCTACCCCAGGTGGAGAAAAGGAGACTTCGGCTACCC  148

Query 149  AGAGAAGTTCAGTGCCCAGCTCTACTGAGAAGAATGCTTTTAATTCCTCTCTGGAAGATCCCAGCACCGACTAC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct 149  AGAGAAGTTCAGTGCCCAGCTCTACTGAGAAGAATGCT------------------------------------  186

Query 223  TACCAAGAGCTGCAGAGAGACATTTCTGAAATGTTTTTGCAGATTTATAAACAAGGGGGTTTTCTGGGCCTCTC  296
                                            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187  ---------------------------------TTTTTGCAGATTTATAAACAAGGGGGTTTTCTGGGCCTCTC  227

Query 297  CAATATTAAGTTCAGGCCAGGATCTGTGGTGGTACAATTGACTCTGGCCTTCCGAGAAGGTACCATCAATGTCC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 228  CAATATTAAGTTCAGGCCAGGATCTGTGGTGGTACAATTGACTCTGGCCTTCCGAGAAGGTACCATCAATGTCC  301

Query 371  ACGACGTGGAGACACAGTTCAATCAGTATAAAACGGAAGCAGCCTCTCGATATAACCTGACGATCTCAGACGTC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302  ACGACGTGGAGACACAGTTCAATCAGTATAAAACGGAAGCAGCCTCTCGATATAACCTGACGATCTCAGACGTC  375

Query 445  AGCGTGAGTGATGTGCCATTTCCTTTCTCTGCCCAGTCTGGGGCTGGGGTGCCAGGCTGGGGCATCGCGCTGCT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376  AGCGTGAGTGATGTGCCATTTCCTTTCTCTGCCCAGTCTGGGGCTGGGGTGCCAGGCTGGGGCATCGCGCTGCT  449

Query 519  GGTGCTGGTCTGTGTTCTGGTTGCGCTGGCCATTGTCTATCTCATTGCCTTGGCTGTCTGTCAGTGCCGCCGAA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 450  GGTGCTGGTCTGTGTTCTGGTTGCGCTGGCCATTGTCTATCTCATTGCCTTGGCTGTCTGTCAGTGCCGCCGAA  523

Query 593  AGAACTACGGGCAGCTGGACATCTTTCCAGCCCGGGATACCTACCATCCTATGAGCGAGTACCCCACCTACCAC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524  AGAACTACGGGCAGCTGGACATCTTTCCAGCCCGGGATACCTACCATCCTATGAGCGAGTACCCCACCTACCAC  597

Query 667  ACCCATGGGCGCTATGTGCCCCCTAGCAGTACCGATCGTAGCCCCTATGAGAAGGTTTCTGCAGGTAATGGTGG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598  ACCCATGGGCGCTATGTGCCCCCTAGCAGTACCGATCGTAGCCCCTATGAGAAGGTTTCTGCAGGTAATGGTGG  671

Query 741  CAGCAGCCTCTCTTACACAAACCCAGCAGTGGCAGCCACTTCTGCCAACTTG  792
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672  CAGCAGCCTCTCTTACACAAACCCAGCAGTGGCAGCCACTTCTGCCAACTTG  723