Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01083
• Subject: XM_006521163.2
• Aligned Length: 2460
• Identities: 2120
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ---------ATGGAGTCTCGGGTCTTACTGAGAACATTCTGTTTGATCTTCGGTCTCGGAGCAGTTTGGGGGCT  65
                     |||||.||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||.||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGCACGCCATGGAATCCCGGGTGTTACTGAGAACGTTCTGCGTGATCCTCGGGCTTGGAGCGGTTTGGGGGCT  74

Query   66  TGGTGTGGACCCTTCCCTACAGATTGACGTCTTAACAGAGTTAGAACTTGGGGAGTCCAC-GACCGGAGTGCGT  138
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|| || .||||||||.
Sbjct   75  TGGTGTGGACCCCTCCCTACAGATTGACGTCTTAACAGAGTTAGAACTTGGGGAGTCTACAGA-TGGAGTGCGC  147

Query  139  CAGGTCCCGGGGCTGCATAATGGGACGAAAGCCTTTCTCTTTCAAGATACTCCCAGAAGCATAAAAGCATCCAC  212
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..|.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  148  CAAGTCCCGGGACTGCATAATGGGACGAAAGCCTTCCTCTTCCAAGAGTCCCCCAGAAGCATAAAGGCATCCAC  221

Query  213  TGCTACAGCTGAACAGTTTTTTCAGAAGCTGAGAAATAAACATGAATTTACTATTTTGGTGACCCTAAAACAGA  286
            ||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  222  TGCTACAGCTGAGCGGTTTTTCCAGAAGCTGAGAAATAAACACGAGTTCACAATCTTGGTGACCCTGAAACAGA  295

Query  287  CCCACTTAAATTCAGGAGTTATTCTCTCAATTCACCACTTGGATCACAGGTACCTGGAACTGGAAAGTAGTGGC  360
            .||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  296  TCCACTTAAATTCGGGAGTTATCCTCTCCATCCACCACTTGGATCACAGGTACCTGGAACTGGAAAGCAGTGGC  369

Query  361  CATCGGAATGAAGTCAGACTGCATTACCGCTCAGGCAGTCACCGCCCTCACACAGAAGTGTTTCCTTACATTTT  434
            |||||||||||..|||||||.||.||||||||.||||.||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  370  CATCGGAATGAGATCAGACTCCACTACCGCTCTGGCACTCACCGTCCCCACACGGAAGTGTTTCCTTATATTTT  443

Query  435  GGCTGATGACAAGTGGCACAAGCTCTCCTTAGCCATCAGTGCTTCCCATTTGATTTTACACATTGACTGCAATA  508
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  444  GGCTGATGCCAAGTGGCACAAGCTCTCCTTAGCCTTCAGTGCCTCTCACTTAATTTTACACATCGACTGCAATA  517

Query  509  AAATTTATGAAAGGGTAGTAGAAAAGCCCTCCACAGACTTGCCTCTAGGCACAACATTTTGGCTAGGACAGAGA  582
            |.||.||||||.|.||.||.||||.|||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||
Sbjct  518  AGATCTATGAACGAGTGGTGGAAATGCCTTCAACAGACTTGCCTCTGGGCACCACATTTTGGTTGGGACAGAGA  591

Query  583  AATAATGCGCATGGATATTTTAAGGGTATAATGCAAGATGTCCAATTACTTGTCATGCCCCAGGGATTTATTGC  656
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  592  AATAATGCACATGGCTATTTTAAGGGAATAATGCAGGATGTGCACGTTCTTGTCATGCCTCAGGGCTTCATTGC  665

Query  657  TCAGTGCCCAGATCTTAATCGCACCTGTCCAACTTGCAATGACTTCCATGGACTTGTGCAGAAAATCATGGAGC  730
            |||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  TCAGTGCCCGGACCTTAATCGAACCTGTCCAACATGCAACGACTTCCATGGGCTTGTGCAGAAAATCATGGAGC  739

Query  731  TACAGGATATTTTAGCCAAAACATCAGCCAAGCTGTCTCGAGCTGAACAGCGAATGAATAGATTGGATCAGTGC  804
            |.|||||.||||||.|.||.||.|||||||||.||||..||||||||||..|||||||.||..|||||||||||
Sbjct  740  TGCAGGACATTTTATCAAAGACGTCAGCCAAGTTGTCCAGAGCTGAACAAAGAATGAACAGGCTGGATCAGTGC  813

Query  805  TATTGTGAAAGGACTTGCACCATGAAGGGAACCACCTACCGAGAATTTGAGTCCTGGATAGACGGCTGTAAGAA  878
            ||.|||||..||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  814  TACTGTGAGCGGACATGCACTGTGAAGGGAACCACCTACCGAGAGTCTGAGTCCTGGACAGACGGCTGTAAGAA  887

Query  879  CTGCACATGCCTGAATGGAACCATCCAGTGTGAAACTCTAATCTGCCCAAATCCTGACTGCCCACTTAAGTCGG  952
            ||||||||||.||||.||.|||||||||||.||.|||||..|||||||...||||||||||||.|.|||.||||
Sbjct  888  CTGCACATGCTTGAACGGGACCATCCAGTGCGAGACTCTGGTCTGCCCTGCTCCTGACTGCCCTCCTAAATCGG  961

Query  953  CTCTTGCGTATGTGGATGGCAAATGCTGTAAGGAATGCAAATCGATATGCCAATTTCAAGGACGAACCTACTTT  1026
            |.|.||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|..|||||.||.||.|||||.|.|||||||
Sbjct  962  CCCCTGCGTATGTGGATGGCAAGTGCTGTAAGGAGTGCAAATCAACCTGCCAGTTCCAGGGACGGAGCTACTTT  1035

Query 1027  GAAGGAGAAAGAAATACAGTCTATTCCTCTTCTGGAGTATGTGTTCTCTATGAGTGCAAGGACCAGACCATGAA  1100
            ||.||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||.|.|||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036  GAGGGAGAAAGGAACACGGTATACTCATCTTCTGGAATGTGTGTCTTATATGAATGCAAGGATCAGACCATGAA  1109

Query 1101  ACTTGTTGAGAGTTCA--GGCTGTCCAGCTTTGGATTGTCCAGAGTCTCATCAGATAACCTTGTCTCACAGCTG  1172
            .||||||||||  .||  |||||.|||.|.||.||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1110  GCTTGTTGAGA--ACATTGGCTGCCCACCCTTAGATTGTCCCGAGTCTCATCAGATTGCCTTGTCTCACAGCTG  1181

Query 1173  TTGCAAAGTTTGTAAAGGTTATGACTTTTGTTCTGAAAGGCATAACTGCATGGAGAATTCCATCTGCAGAAATC  1246
            .|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||.||||||||||||.||..|||||||.||.|
Sbjct 1182  CTGCAAGGTTTGTAAAGGTTATGACTTCTGTTCTGAGAAGCATACCTGCATGGAGAACTCGGTCTGCAGGAACC  1255

Query 1247  TGAATGACAGGGCTGTTTGTAGCTGTCGAGATGGTTTTAGGGCTCTTCGAGAGGATAATGCCTACTGTGAAGAC  1320
            ||||.|||||||||||.||.|||||..|.|||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1256  TGAACGACAGGGCTGTGTGCAGCTGCAGGGATGGTTTTCGGGCTCTCCGAGAGGACAACGCCTACTGTGAAGAC  1329

Query 1321  ATCGATGAGTGTGCTGAAGGGCGCCATTACTGTCGTGAAAATACAATGTGTGTCAACACCCCGGGTTCTTTTAT  1394
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1330  ATTGACGAGTGTGCAGAAGGGCGCCATTACTGCCGTGAGAACACCATGTGTGTGAATACACCTGGTTCTTTCAT  1403

Query 1395  GTGCATCTGCAAAACTGGATACATCAGAATTGATGATTATTCATGTACAGAACATGATGAGTGTATCACAAATC  1468
            |||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 1404  GTGTATCTGCAAAACTGGGTACATCAGGATCGACGATTACTCATGTACAGAACATGATGAGTGTCTCACAAACC  1477

Query 1469  AGCACAACTGTGATGAAAATGCTTTATGCTTCAACACTGTTGGAGGACACAACTGTGTTTGCAAGCCGGGCTAT  1542
            |||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1478  AGCACAATTGTGATGAAAACGCTTTGTGCTTTAACACTGTTGGAGGACACAACTGTGTCTGCAAGCCTGGCTAC  1551

Query 1543  ACAGGGAATGGAACGACATGCAAAGCATTTTGCAAAGATGGCTGTAGGAATGGAGGAGCCTGTATTGCCGCTAA  1616
            ||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1552  ACCGGGAATGGAACCACGTGCAAAGCTTTCTGCAAAGATGGCTGTAGAAACGGAGGAGCGTGCATTGCTGCCAA  1625

Query 1617  TGTGTGTGCCTGCCCACAAGGCTTCACTGGACCCAGCTGTGAAACGGACATTGATGAATGCTCTGATGGTTTTG  1690
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 1626  TGTGTGTGCCTGCCCACAAGGCTTCACGGGACCCAGCTGTGAGACAGACATTGACGAGTGCTCTGAGGGCTTTG  1699

Query 1691  TTCAATGTGACAGTCGTGCTAATTGCATTAACCTGCCTGGATGGTACCACTGTGAGTGCAGAGATGGCTACCAT  1764
            ||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1700  TTCAGTGTGACAGCCGTGCCAACTGCATCAACCTGCCTGGGTGGTATCACTGTGAGTGCAGAGACGGCTACCAT  1773

Query 1765  GACAATGGGATGTTTTCACCAAGTGGAGAATCGTGTGAAGATATTGATGAGTGTGGGACCGGGAGGCACAGCTG  1838
            |||||||||||||||.|.|||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1774  GACAATGGGATGTTTGCGCCAGGCGGAGAATCCTGTGAAGATATTGACGAATGCGGGACTGGGAGGCACAGCTG  1847

Query 1839  TGCCAATGATACCATTTGCTTCAATTTGGATGGCGGATATGATTGTCGATGTCCTCATGGAAAGAATTGCACAG  1912
            ..||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1848  CACCAACGACACCATTTGCTTCAACTTGGACGGGGGATACGATTGCCGGTGTCCCCATGGGAAGAACTGCACTG  1921

Query 1913  GGGACTGCATCCATGATGGAAAAGTTAAGCACAATGGTCAGATTTGGGTGTTGGAAAATGACAGGTGCTCTGTG  1986
            ||||||||.|.||.||.||.|||||.|||||||..||.|||||.||||||.|||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1922  GGGACTGCGTGCACGAGGGGAAAGTGAAGCACACCGGCCAGATCTGGGTGCTGGAAAACGACAGGTGCTCCGTG  1995

Query 1987  TGCTCATGTCAGAATGGATTCGTTATGTGTCGACGGATGGTCTGTGACTGTGAGAATCCCACAGTTGATCTTTT  2060
            ||.||.||.||||.|||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||.
Sbjct 1996  TGTTCCTGCCAGACTGGGTTTGTCATGTGTCGACGGATGGTCTGCGACTGCGAAAACCCCACAGTTGACCTTTC  2069

Query 2061  TTGCTGCCCTGAATGTGACCCAAGGCTTAGTAGTCAGTGCCTCCATCAAAATGGGGAAACTTTGTATAACAGTG  2134
            .|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||..||||.|||||.|
Sbjct 2070  CTGCTGCCCTGAGTGTGACCCAAGGCTGAGCAGTCAGTGCCTGCATCAAAACGGGGAAACCGTGTACAACAGCG  2143

Query 2135  GTGACACCTGGGTCCAGAATTGTCAACAGTGCCGCTGCTTGCAAGGGGAAGTTGATTGTTGGCCCCTGCCTTGC  2208
            |.|||||||||||||||.||||.|..||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 2144  GCGACACCTGGGTCCAGGATTGCCGTCAGTGCCGCTGCTTGCAAGGAGAAGTTGACTGTTGGCCCCTGGCTTGC  2217

Query 2209  CCAGATGTGGAGTGTGAATTCAGCATTCTCCCAGAGAATGAGTGCTGCCCGCGCTGTGTCACAGACCCTTGCCA  2282
            |||||.||.||.||||||||.|||.|.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 2218  CCAGAGGTAGAATGTGAATTTAGCGTCCTTCCTGAGAACGAGTGCTGCCCACGCTGTGTCACCGATCCTTGTCA  2291

Query 2283  GGCTGACACCATCCGCAATGACATCACCAAGACTTGCCTGGACGAAATGAATGTGGTTCGCTTCACCGGGTCCT  2356
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2292  GGCCGACACCATCCGCAATGACATCACCAAAACCTGCCTGGACGAGATGAACGTGGTTCGCTTCACCGGGTCTT  2365

Query 2357  CTTGGATCAAACATGGCACTGAGTGTACTCTCTGCCAGTGCAAGAATGGCCACATCTGTTGCTCAGTGGATCCA  2430
            |.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||.|||||||||||||||
Sbjct 2366  CCTGGATCAAGCACGGCACGGAGTGTACCCTCTGCCAGTGCAAGAATGGCCATTTGTGCTGCTCAGTGGATCCA  2439

Query 2431  CAGTGCCTTCAGGAACTG  2448
            ||||||||||||||.|||
Sbjct 2440  CAGTGCCTTCAGGAGCTG  2457