Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01083
• Subject: XM_017019344.1
• Aligned Length: 2463
• Identities: 2448
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGGAGTCTCGGGTCTTACTGAGAACATTCTGTTTGATCTTCGGTCTCGGAGCAGTTTGGGGGCTTGGTGTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTCTCGGGTCTTACTGAGAACATTCTGTTTGATCTTCGGTCTCGGAGCAGTTTGGGGGCTTGGTGTGGA  74

Query   75  CCCTTCCCTACAGATTGACGTCTTAACAGAGTTAGAACTTGGGGAGTCCACGACCGGAGTGCGTCAGGTCCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCTTCCCTACAGATTGACGTCTTAACAGAGTTAGAACTTGGGGAGTCCACGACCGGAGTGCGTCAGGTCCCGG  148

Query  149  GGCTGCATAATGGGACGAAAGCCTTTCTCTTTCAAGATACTCCCAGAAGCATAAAAGCATCCACTGCTACAGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCTGCATAATGGGACGAAAGCCTTTCTCTTTCAAGATACTCCCAGAAGCATAAAAGCATCCACTGCTACAGCT  222

Query  223  GAACAGTTTTTTCAGAAGCTGAGAAATAAACATGAATTTACTATTTTGGTGACCCTAAAACAGACCCACTTAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACAGTTTTTTCAGAAGCTGAGAAATAAACATGAATTTACTATTTTGGTGACCCTAAAACAGACCCACTTAAA  296

Query  297  TTCAGGAGTTATTCTCTCAATTCACCACTTGGATCACAGGTACCTGGAACTGGAAAGTAGTGGCCATCGGAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCAGGAGTTATTCTCTCAATTCACCACTTGGATCACAGGTACCTGGAACTGGAAAGTAGTGGCCATCGGAATG  370

Query  371  AAGTCAGACTGCATTACCGCTCAGGCAGTCACCGCCCTCACACAGAAGTGTTTCCTTACATTTTGGCTGATGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTCAGACTGCATTACCGCTCAGGCAGTCACCGCCCTCACACAGAAGTGTTTCCTTACATTTTGGCTGATGAC  444

Query  445  AAGTGGCACAAGCTCTCCTTAGCCATCAGTGCTTCCCATTTGATTTTACACATTGACTGCAATAAAATTTATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGTGGCACAAGCTCTCCTTAGCCATCAGTGCTTCCCATTTGATTTTACACATTGACTGCAATAAAATTTATGA  518

Query  519  AAGGGTAGTAGAAAAGCCCTCCACAGACTTGCCTCTAGGCACAACATTTTGGCTAGGACAGAGAAATAATGCGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGGGTAGTAGAAAAGCCCTCCACAGACTTGCCTCTAGGCACAACATTTTGGCTAGGACAGAGAAATAATGCGC  592

Query  593  ATGGATATTTTAAGGGTATAATGCAAGATGTCCAATTACTTGTCATGCCCCAGGGATTTATTGCTCAGTGCCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGGATATTTTAAGGGTATAATGCAAGATGTCCAATTACTTGTCATGCCCCAGGGATTTATTGCTCAGTGCCCA  666

Query  667  GATCTTAATCGCA---------------CCTGTCCAACTTGCAATGACTTCCATGGACTTGTGCAGAAAATCAT  725
            |||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCTTAATCGCATGTTTGTAATTCCAGCCTGTCCAACTTGCAATGACTTCCATGGACTTGTGCAGAAAATCAT  740

Query  726  GGAGCTACAGGATATTTTAGCCAAAACATCAGCCAAGCTGTCTCGAGCTGAACAGCGAATGAATAGATTGGATC  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGCTACAGGATATTTTAGCCAAAACATCAGCCAAGCTGTCTCGAGCTGAACAGCGAATGAATAGATTGGATC  814

Query  800  AGTGCTATTGTGAAAGGACTTGCACCATGAAGGGAACCACCTACCGAGAATTTGAGTCCTGGATAGACGGCTGT  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTGCTATTGTGAAAGGACTTGCACCATGAAGGGAACCACCTACCGAGAATTTGAGTCCTGGATAGACGGCTGT  888

Query  874  AAGAACTGCACATGCCTGAATGGAACCATCCAGTGTGAAACTCTAATCTGCCCAAATCCTGACTGCCCACTTAA  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAACTGCACATGCCTGAATGGAACCATCCAGTGTGAAACTCTAATCTGCCCAAATCCTGACTGCCCACTTAA  962

Query  948  GTCGGCTCTTGCGTATGTGGATGGCAAATGCTGTAAGGAATGCAAATCGATATGCCAATTTCAAGGACGAACCT  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTCGGCTCTTGCGTATGTGGATGGCAAATGCTGTAAGGAATGCAAATCGATATGCCAATTTCAAGGACGAACCT  1036

Query 1022  ACTTTGAAGGAGAAAGAAATACAGTCTATTCCTCTTCTGGAGTATGTGTTCTCTATGAGTGCAAGGACCAGACC  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTTTGAAGGAGAAAGAAATACAGTCTATTCCTCTTCTGGAGTATGTGTTCTCTATGAGTGCAAGGACCAGACC  1110

Query 1096  ATGAAACTTGTTGAGAGTTCAGGCTGTCCAGCTTTGGATTGTCCAGAGTCTCATCAGATAACCTTGTCTCACAG  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGAAACTTGTTGAGAGTTCAGGCTGTCCAGCTTTGGATTGTCCAGAGTCTCATCAGATAACCTTGTCTCACAG  1184

Query 1170  CTGTTGCAAAGTTTGTAAAGGTTATGACTTTTGTTCTGAAAGGCATAACTGCATGGAGAATTCCATCTGCAGAA  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTGTTGCAAAGTTTGTAAAGGTTATGACTTTTGTTCTGAAAGGCATAACTGCATGGAGAATTCCATCTGCAGAA  1258

Query 1244  ATCTGAATGACAGGGCTGTTTGTAGCTGTCGAGATGGTTTTAGGGCTCTTCGAGAGGATAATGCCTACTGTGAA  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCTGAATGACAGGGCTGTTTGTAGCTGTCGAGATGGTTTTAGGGCTCTTCGAGAGGATAATGCCTACTGTGAA  1332

Query 1318  GACATCGATGAGTGTGCTGAAGGGCGCCATTACTGTCGTGAAAATACAATGTGTGTCAACACCCCGGGTTCTTT  1391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACATCGATGAGTGTGCTGAAGGGCGCCATTACTGTCGTGAAAATACAATGTGTGTCAACACCCCGGGTTCTTT  1406

Query 1392  TATGTGCATCTGCAAAACTGGATACATCAGAATTGATGATTATTCATGTACAGAACATGATGAGTGTATCACAA  1465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TATGTGCATCTGCAAAACTGGATACATCAGAATTGATGATTATTCATGTACAGAACATGATGAGTGTATCACAA  1480

Query 1466  ATCAGCACAACTGTGATGAAAATGCTTTATGCTTCAACACTGTTGGAGGACACAACTGTGTTTGCAAGCCGGGC  1539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCAGCACAACTGTGATGAAAATGCTTTATGCTTCAACACTGTTGGAGGACACAACTGTGTTTGCAAGCCGGGC  1554

Query 1540  TATACAGGGAATGGAACGACATGCAAAGCATTTTGCAAAGATGGCTGTAGGAATGGAGGAGCCTGTATTGCCGC  1613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATACAGGGAATGGAACGACATGCAAAGCATTTTGCAAAGATGGCTGTAGGAATGGAGGAGCCTGTATTGCCGC  1628

Query 1614  TAATGTGTGTGCCTGCCCACAAGGCTTCACTGGACCCAGCTGTGAAACGGACATTGATGAATGCTCTGATGGTT  1687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TAATGTGTGTGCCTGCCCACAAGGCTTCACTGGACCCAGCTGTGAAACGGACATTGATGAATGCTCTGATGGTT  1702

Query 1688  TTGTTCAATGTGACAGTCGTGCTAATTGCATTAACCTGCCTGGATGGTACCACTGTGAGTGCAGAGATGGCTAC  1761
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTGTTCAATGTGACAGTCGTGCTAATTGCATTAACCTGCCTGGATGGTACCACTGTGAGTGCAGAGATGGCTAC  1776

Query 1762  CATGACAATGGGATGTTTTCACCAAGTGGAGAATCGTGTGAAGATATTGATGAGTGTGGGACCGGGAGGCACAG  1835
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CATGACAATGGGATGTTTTCACCAAGTGGAGAATCGTGTGAAGATATTGATGAGTGTGGGACCGGGAGGCACAG  1850

Query 1836  CTGTGCCAATGATACCATTTGCTTCAATTTGGATGGCGGATATGATTGTCGATGTCCTCATGGAAAGAATTGCA  1909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTGTGCCAATGATACCATTTGCTTCAATTTGGATGGCGGATATGATTGTCGATGTCCTCATGGAAAGAATTGCA  1924

Query 1910  CAGGGGACTGCATCCATGATGGAAAAGTTAAGCACAATGGTCAGATTTGGGTGTTGGAAAATGACAGGTGCTCT  1983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CAGGGGACTGCATCCATGATGGAAAAGTTAAGCACAATGGTCAGATTTGGGTGTTGGAAAATGACAGGTGCTCT  1998

Query 1984  GTGTGCTCATGTCAGAATGGATTCGTTATGTGTCGACGGATGGTCTGTGACTGTGAGAATCCCACAGTTGATCT  2057
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGTGCTCATGTCAGAATGGATTCGTTATGTGTCGACGGATGGTCTGTGACTGTGAGAATCCCACAGTTGATCT  2072

Query 2058  TTTTTGCTGCCCTGAATGTGACCCAAGGCTTAGTAGTCAGTGCCTCCATCAAAATGGGGAAACTTTGTATAACA  2131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTTTTGCTGCCCTGAATGTGACCCAAGGCTTAGTAGTCAGTGCCTCCATCAAAATGGGGAAACTTTGTATAACA  2146

Query 2132  GTGGTGACACCTGGGTCCAGAATTGTCAACAGTGCCGCTGCTTGCAAGGGGAAGTTGATTGTTGGCCCCTGCCT  2205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GTGGTGACACCTGGGTCCAGAATTGTCAACAGTGCCGCTGCTTGCAAGGGGAAGTTGATTGTTGGCCCCTGCCT  2220

Query 2206  TGCCCAGATGTGGAGTGTGAATTCAGCATTCTCCCAGAGAATGAGTGCTGCCCGCGCTGTGTCACAGACCCTTG  2279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TGCCCAGATGTGGAGTGTGAATTCAGCATTCTCCCAGAGAATGAGTGCTGCCCGCGCTGTGTCACAGACCCTTG  2294

Query 2280  CCAGGCTGACACCATCCGCAATGACATCACCAAGACTTGCCTGGACGAAATGAATGTGGTTCGCTTCACCGGGT  2353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCAGGCTGACACCATCCGCAATGACATCACCAAGACTTGCCTGGACGAAATGAATGTGGTTCGCTTCACCGGGT  2368

Query 2354  CCTCTTGGATCAAACATGGCACTGAGTGTACTCTCTGCCAGTGCAAGAATGGCCACATCTGTTGCTCAGTGGAT  2427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCTCTTGGATCAAACATGGCACTGAGTGTACTCTCTGCCAGTGCAAGAATGGCCACATCTGTTGCTCAGTGGAT  2442

Query 2428  CCACAGTGCCTTCAGGAACTG  2448
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCACAGTGCCTTCAGGAACTG  2463