Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01122
• Subject: NM_001285528.2
• Aligned Length: 1248
• Identities: 883
• Gaps: 354

Alignment

Query    1  ATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGC  370
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGC  70

Query  371  CCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  CCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATA  144

Query  445  GATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  GATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCA  218

Query  519  CCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  CCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTT  292

Query  593  CAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  CAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACA  366

Query  667  TTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  TTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGT  440

Query  741  GCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  GCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAG  514

Query  815  AAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  AAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACT  588

Query  889  CCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  CCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCA  662

Query  963  CTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  CTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCA  736

Query 1037  AACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  AACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAG  810

Query 1111  AACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAG-----CTAGAAAATCTGGAA  1179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     .||.|.|||      
Sbjct  811  AACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGAATTATTATATAAT------  878

Query 1180  GC--AGAAACTGCTCCGTTGCCC-----------------------------------------  1200
            .|  |||...||||.|..|.|||                                         
Sbjct  879  TCATAGATGTTGCTGCAATACCCCTCTTATTTCTCAAAAGCCAGTCTTGCTCTGGTTCTGTGAT  942