Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01122
• Subject: NR_104349.1
• Aligned Length: 1507
• Identities: 1191
• Gaps: 308

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  CCAGGACTGGTTTCTGTAAGAAACAGCAGGAGCTGTGGCAGCGGCGAAAGGAAGCGGCTGAGGCGCTTGGAACC  74

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGACAGCAGCGC  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct   75  CGAAAAGTCTCGGTGCTCCTGGCTACCTCGCACAGCGGTGCCCGCCCGGCCGTCAGTACCATGGACAGCAGCGC  148

Query   15  TGCCCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGCACCCAGCCCCGGTT  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGCACCCAGCCCCGGTT  222

Query   89  CCTGGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCACCGACCTGGGCGGG  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTGGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCACCGACCTGGGCGGG  296

Query  163  AGAGACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATGGCCCTCTACTCCAT  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATGGCCCTCTACTCCAT  370

Query  237  CGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACACCAAGATGAAGACTG  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACACCAAGATGAAGACTG  444

Query  311  CCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGCCCTTCCAGAGTGTG  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGCCCTTCCAGAGTGTG  518

Query  385  AATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATAGATTACTATAACAT  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATAGATTACTATAACAT  592

Query  459  GTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCACCCTGTCAAGGCCT  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCACCCTGTCAAGGCCT  666

Query  533  TAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTTCAGCCATTGGTCTT  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTTCAGCCATTGGTCTT  740

Query  607  CCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACATTCTCTCATCCAAC  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACATTCTCTCATCCAAC  814

Query  681  CTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGTGCTCATCATTACCG  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGTGCTCATCATTACCG  888

Query  755  TGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAGAAAAGGACAGGAAT  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAGAAAAGGACAGGAAT  962

Query  829  CTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACTCCCATTCACATTTA  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACTCCCATTCACATTTA  1036

Query  903  CGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCACTTCTGCATTGCTC  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCACTTCTGCATTGCTC  1110

Query  977  TAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCAAACGATGCTTCAGA  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCAAACGATGCTTCAGA  1184

Query 1051  GAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAGAACACTAGAGACCA  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAGAACACTAGAGACCA  1258

Query 1125  CCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCT-AGA-----------AAA-------------T  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| |||           |||             |
Sbjct 1259  CCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGATCAGAGATCCAATATCAAACCTTCCCAGGGTGT  1332

Query 1174  CTGGAAGCAGA-AACTGCTCCGTTG--------CCC--------------------------------------  1200
            |||.|..|.|| ||||| |||..||        .||                                      
Sbjct 1333  CTGTATTCTGACAACTG-TCCACTGAGGCAATTTCCATACAGCGCAAAGTGGAGTGGCGATTTGGCAGTTATCA  1405

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1406  AGAAAATAGATTTATTTCAAAAGTCATCTTTACTCAACTGTGAGCATACCAAGGGCTAATAATTACAATATTTT  1479

Query 1201  ---------------------------  1200
                                       
Sbjct 1480  CCCGTGAAAGAATATAAGATTGGAAGC  1506