Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01122
• Subject: XM_017010904.1
• Aligned Length: 1340
• Identities: 891
• Gaps: 442

Alignment

Query    1  ATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAATTGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTTAGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGACCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGC  370
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGC  70

Query  371  CCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  CCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATA  144

Query  445  GATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  GATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCA  218

Query  519  CCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  CCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTT  292

Query  593  CAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  CAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACA  366

Query  667  TTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  TTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGT  440

Query  741  GCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  GCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAG  514

Query  815  AAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  AAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACT  588

Query  889  CCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  CCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCA  662

Query  963  CTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  CTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCA  736

Query 1037  AACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  AACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAG  810

Query 1111  AACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAG-------CTAGAAAAT----  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||.|...|    
Sbjct  811  AACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTGGATAGAACTAATCATCAGTGCCTACCTATACCTTCCCT  884

Query 1174  ------CTGGAAGC-----AGAAA--CTGCTCCGTTG----CCC------------------------------  1200
                  ||||  ||     ||.||  |||||..||||    |||                              
Sbjct  885  GTCTTGCTGG--GCTCTAGAGCAAGGCTGCTTGGTTGTGTACCCTGGACCACTGCAAGGACCTCTTGTCAGATA  956

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct  957  TGACCTCCCAGCTATCCTTCACTCGTCCTGCCTTCGTGGAAATACTGCTCCCAGCCCGTCTGGTGGAGCATTTC  1030

Query 1201  --------  1200
                    
Sbjct 1031  TCCTGAGT  1038