Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01257
• Subject: XM_005245291.4
• Aligned Length: 1622
• Identities: 1357
• Gaps: 241

Alignment

Query    1  ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC  74

Query   75  CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA  148

Query  149  ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTG  222

Query  223  GTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCT  296

Query  297  CTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCA  370

Query  371  AACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGT  444

Query  445  TTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGG  518

Query  519  CAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATAT  592

Query  593  TACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAG  666

Query  667  CGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAG  740

Query  741  GGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTC  814

Query  815  TAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCT  888

Query  889  GCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTA  962

Query  963  CCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAA  1036

Query 1037  TCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGA  1110

Query 1111  GGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGA  1184

Query 1185  AGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGAACTGCATTC  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |
Sbjct 1185  AGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGA--------C  1250

Query 1259  C-----CCAGT----------ATACACT------AGGTC-----ACTGGCAAAAACTA--GAGT---CAG----  1297
            |     |||||          |.|.|.|      |||.|     |.||||     |||  ||||   |||    
Sbjct 1251  CAAGAACCAGTTGAAGTGGCGACAGAGTCATGACAGGACCGTGGAGTGGC-----CTAAGGAGTACCCAGGGCG  1319

Query 1298  --CTAGGCAA----------------TTCCTG-------------ACTGCTCA----CAGGTTGCCCCTGAC--  1334
              .||||.||                |||.||             |||.||||    ||||  |.||.||||  
Sbjct 1320  AAGTAGGAAACAGGCTCCTTCTATTCTTCATGTGCCTGGGTGCCAACTCCTCAGGTGCAGG--GACCGTGACCA  1391

Query 1335  TCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCG-----CCAG-GCAGCA-  1401
            .||||..|..||||||                                |.||.|.||     |||| ||| || 
Sbjct 1392  CCTGGGGGCTGCCTCC--------------------------------GTGTCGACGCATTCCCAGCGCA-CAT  1432

Query 1402  -----GTCAGTGT-----CCTG--GGCACAG--AACCTAACAGC------------------------------  1431
                 |||  |.|     ||||  |.|||.|  |.||.||||||                              
Sbjct 1433  ACCTGGTC--TTTTGCTGCCTGTCGTCACCGCCACCCCAACAGCCGGGCAGGCATCGCTGCCGCCATCTTGGAA  1504

Query 1432  --------------------------------------------------------------------  1431
                                                                                
Sbjct 1505  GCGGGCGCTGCGGGGGCGGGGTCTCGCGTCATGGGGCGGGGCCTCGGGGCGGAGCCACCCGGGCTGAC  1572