Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01257
• Subject: XM_006496709.3
• Aligned Length: 1441
• Identities: 1004
• Gaps: 269

Alignment

Query    1  ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC  74
            |||||||||||.|||.|.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||||.|||.|.|||
Sbjct    1  ATGGGCCGGACTGTGATAGTACTTGGCGGAGGTATCAGTGGATTGGCCGCAAGTTATCATCTGATCCGAGGCCC  74

Query   75  CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA  148
            |.|.||.|||||||||.||.||||||||.||||..|||||.|||||||.|||||.|||||..|.|||||..|..
Sbjct   75  CAGTCCTCCTAAGGTGATCTTAGTGGAGGGCAGCAAGCGTTTGGGAGGATGGATCCGCTCAATCCGAGGATCAG  148

Query  149  ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTG  222
            |||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||| 
Sbjct  149  ATGGTGCGATCTTTGAACTTGGACCTCGAGGGATTAGGCCGGCTGGAGCCCTGGGAGCCCGGACCCTGCTCCT-  221

Query  223  GTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCT  296
                                                                                      
Sbjct  222  --------------------------------------------------------------------------  221

Query  297  CTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCA  370
                                                                                      
Sbjct  222  --------------------------------------------------------------------------  221

Query  371  AACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGT  444
                                                                                      
Sbjct  222  --------------------------------------------------------------------------  221

Query  445  TTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGG  518
                                      ||||||.|||.||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct  222  --------------------------GGTGGCATCTTTAGCCATGGACAGTCTTTGCCGAGGAGTATTTGCTGG  269

Query  519  CAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATAT  592
            |||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  270  CAACAGCCGGGAGCTCAGCATCCGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAACAAACCCACCGGTCCATAT  343

Query  593  TACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAG  666
            |.|||||.|||||||||||.|||||.|.||..||.|||||.||.||..||||.|||||.||||||..|||||||
Sbjct  344  TGCTGGGGCTGCTGCTGGGCGCAGGACAGAGTCCCCAGCCGGATTCCTCACTAATTCGTCAGGCCCGGGCTGAG  417

Query  667  CGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAG  740
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||.|||||||.|||||.|||.|.|..|||||..|.||||.
Sbjct  418  CGATGGAGCCAGTGGTCACTCCGTGGAGGGCTGGAGGTGTTGCCCCAGGCTCTTCACAATCACCTAGCAAGTAA  491

Query  741  GGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTC  814
            .|||||||.|||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||||
Sbjct  492  AGGGGTCACTGTCCTCAGTGGGCAGCCAGTCTGTGGGCTCAGCCTTCAGCCAGAAGGGCGCTGGAAGGTGTCTC  565

Query  815  TAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCT  888
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.||||||..|||||||||||
Sbjct  566  TAGGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACATTATAAGTGCCATTCCAGCTTCAGAGCTCAGCAAGCTGCTCCCT  639

Query  889  GCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTA  962
            ||.||||||||.|||||.|||||...|||||||.||||||..|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  640  GCCGAGGCTGCACCTCTAGCTCGAATCCTGAGTACCATCAAGGCAGTGTCTGTTGCTGTGGTGAATCTGCAGTA  713

Query  963  CCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGA--GTCCTGGG  1034
            ||.||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||  ||  ||||||||
Sbjct  714  CCGAGGAGCTTGTCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCGTCAGAAGACCC--GACTGTCCTGGG  785

Query 1035  AATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGG  1108
            |||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||.||||||..||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  786  AATTGTGTACGACTCGGTGGCTTTTCCTGAACAGGATGGGAACCCCCCAAGCCTCAGAGTGACTGTGATGTTGG  859

Query 1109  GAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGG--------CTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGC  1174
            ||||||.||||.||||||..||..|.||| |.||        |||       ||||..||||||||.||.||.|
Sbjct  860  GAGGTTACTGGCTACAGAAGCTAAAAGCT-GCGGGCCACCAACTG-------TCTCCAGAGCTGTTCCAGCAAC  925

Query 1175  GGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAG  1248
            ..||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||....|||||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  926  AAGCCCAGGAGGCAGCCGCCACACAGTTAGGACTGAAAGAACCACCGAGTCACTGCCTGGTCCATCTACACAAG  999

Query 1249  AACTGCATTCCCCAGTATACACTAGGTCACTGGCAAAAACTAGAGTCAGCTAGGCAATTCCTGACTGCTCACAG  1322
            |||||.||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1000  AACTGTATCCCTCAGTATACAATAGGCCACTGGCAAAAACTAGACTCAGCTATGCAATTCCTGACGGCCCAGAG  1073

Query 1323  GTTGCCCCTGACTCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGG  1396
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  GTTGCCCCTGACTTTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGGGTTGCTGTCAATGACTGTATAGAGAGTGGGCGCCAGG  1147

Query 1397  CAGCAGTCAGTGTCCTGGGCACAGAACCTAACAGC  1431
            |||||||...||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1148  CAGCAGTTGCTGTCCTGGGCACAGAATCTAACAGC  1182