Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01257
- Subject:
- XM_011509663.2
- Aligned Length:
- 1751
- Identities:
- 1357
- Gaps:
- 370
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGCCGCCTCCCCGTGGACTGGCCTTAAGTGTCCCTATCTATTCTCCCTACGACCAAAGCTCCTGCGGCCT 74
Query 1 ----------------------------------------ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCCCTCTAGGGTTGTCACCCTAGCTGGACCTGGTTTCCGCATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA 148
Query 35 TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT 222
Query 109 GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT 296
Query 183 TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCT---------------GGTTTCTGAGCTTGGCTTGG 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTGGCATGTGGAGAGCAGGTTTCTGAGCTTGGCTTGG 370
Query 242 ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG 315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG 444
Query 316 CATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGG 389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGG 518
Query 390 GCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTG 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTG 592
Query 464 GACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC 666
Query 538 ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG 740
Query 612 GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC 814
Query 686 TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA 888
Query 760 GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA 962
Query 834 GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG 1036
Query 908 CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT 1110
Query 982 GTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGC 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGC 1184
Query 1056 TTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC 1258
Query 1130 TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA 1332
Query 1204 GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCC-----CCAGT-------- 1264
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1333 GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGA--------CCAAGAACCAGTTGAAGTGG 1398
Query 1265 --ATACACT------AGGTC-----ACTGGCAAAAACTA--GAGT---CAG------CTAGGCAA--------- 1305
|.|.|.| |||.| |.|||| ||| |||| ||| .||||.||
Sbjct 1399 CGACAGAGTCATGACAGGACCGTGGAGTGGC-----CTAAGGAGTACCCAGGGCGAAGTAGGAAACAGGCTCCT 1467
Query 1306 -------TTCCTG-------------ACTGCTCA----CAGGTTGCCCCTGAC--TCTGGCTGGAGCCTCCTAT 1353
|||.|| |||.|||| |||| |.||.|||| .||||..|..||||||
Sbjct 1468 TCTATTCTTCATGTGCCTGGGTGCCAACTCCTCAGGTGCAGG--GACCGTGACCACCTGGGGGCTGCCTCC--- 1536
Query 1354 GAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCG-----CCAG-GCAGCA------GTCAGTGT-----C 1410
|.||.|.|| |||| ||| || ||| |.| |
Sbjct 1537 -----------------------------GTGTCGACGCATTCCCAGCGCA-CATACCTGGTC--TTTTGCTGC 1578
Query 1411 CTG--GGCACAG--AACCTAACAGC------------------------------------------------- 1431
||| |.|||.| |.||.||||||
Sbjct 1579 CTGTCGTCACCGCCACCCCAACAGCCGGGCAGGCATCGCTGCCGCCATCTTGGAAGCGGGCGCTGCGGGGGCGG 1652
Query 1432 ------------------------------------------------- 1431
Sbjct 1653 GGTCTCGCGTCATGGGGCGGGGCCTCGGGGCGGAGCCACCCGGGCTGAC 1701