Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01257
• Subject: XM_011509666.2
• Aligned Length: 1751
• Identities: 1246
• Gaps: 481

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGCCGCCTCCCCGTGGACTGGCCTTAAGTGTCCCTATCTATTCTCCCTACGACCAAAGCTCCTGCGGCCT  74

Query    1  ----------------------------------------ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCCTCTAGGGTTGTCACCCTAGCTGGACCTGGTTTCCGCATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA  148

Query   35  TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT  222

Query  109  GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT  296

Query  183  TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCT---------------GGTTTCTGAGCTTGGCTTGG  241
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTGGCATGTGGAGAGCAGGTTTCTGAGCTTGGCTTGG  370

Query  242  ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG  444

Query  316  CATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGG  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGG  518

Query  390  GCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTG  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTG  592

Query  464  GACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC  666

Query  538  ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG  740

Query  612  GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC  814

Query  686  TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA  888

Query  760  GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA  962

Query  834  GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG  907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG  1036

Query  908  CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT  1110

Query  982  GTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGC  1055
            ||||||                                                                    
Sbjct 1111  GTCCAG--------------------------------------------------------------------  1116

Query 1056  TTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC  1129
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117  -------------------------------------------GTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC  1147

Query 1130  TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA  1221

Query 1204  GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCC-----CCAGT--------  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||     |||||        
Sbjct 1222  GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGA--------CCAAGAACCAGTTGAAGTGG  1287

Query 1265  --ATACACT------AGGTC-----ACTGGCAAAAACTA--GAGT---CAG------CTAGGCAA---------  1305
              |.|.|.|      |||.|     |.||||     |||  ||||   |||      .||||.||         
Sbjct 1288  CGACAGAGTCATGACAGGACCGTGGAGTGGC-----CTAAGGAGTACCCAGGGCGAAGTAGGAAACAGGCTCCT  1356

Query 1306  -------TTCCTG-------------ACTGCTCA----CAGGTTGCCCCTGAC--TCTGGCTGGAGCCTCCTAT  1353
                   |||.||             |||.||||    ||||  |.||.||||  .||||..|..||||||   
Sbjct 1357  TCTATTCTTCATGTGCCTGGGTGCCAACTCCTCAGGTGCAGG--GACCGTGACCACCTGGGGGCTGCCTCC---  1425

Query 1354  GAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCG-----CCAG-GCAGCA------GTCAGTGT-----C  1410
                                         |.||.|.||     |||| ||| ||      |||  |.|     |
Sbjct 1426  -----------------------------GTGTCGACGCATTCCCAGCGCA-CATACCTGGTC--TTTTGCTGC  1467

Query 1411  CTG--GGCACAG--AACCTAACAGC-------------------------------------------------  1431
            |||  |.|||.|  |.||.||||||                                                 
Sbjct 1468  CTGTCGTCACCGCCACCCCAACAGCCGGGCAGGCATCGCTGCCGCCATCTTGGAAGCGGGCGCTGCGGGGGCGG  1541

Query 1432  -------------------------------------------------  1431
                                                             
Sbjct 1542  GGTCTCGCGTCATGGGGCGGGGCCTCGGGGCGGAGCCACCCGGGCTGAC  1590